Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0044800
Sequence Length
811 nt
GC Content
0.4168
GAGGAUAUCAUUGGCCACUCCUCGACAGCUUUAUAAAUCUUCCAAUAUGACUCAGCGCUGGCAAAGAAGGGAAAUUUCAAACUUCGAAUAUUUGAUGUUCCUUAAUACUAUUGCAGGACGGACAUAUAAUGAUCUGAACCAAUAUCCAGUGUUUCCGUGGGUGUUAACCAACUAUGAAUCAGAAGAGUUGGACCUGACUCUUCCAGGAAACUUCAGGGAUCUAUCAAAGCCAAUUGGUGCUUUGAACCCCAAGAGAGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAGGAACUAAUUCCAGAGUUCUACUACCUACCAGAGAUGUUUGUCAACAGUAAUGGAUAUAAUCUUGGAGUCAGAGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUGGCCCUAGAAAGUGAAUUUGUUUCUUGCCAACUUCAUCAGUGGAUCGACCUUAUAUUUGGCUAUAAGCAGCGAGGACCAGAAGCAGUUCGUGCUCUGAAUGUUUUUCACUACUUGACUUAUGAAGGCUCUGUGAACCUGGAUAGUAUCACUGAUCCUGUGCUCAGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-205.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -223.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 203.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.(((((((((((((.(((((....(((((((..((((.(((((((((.(((.((((.(.(..((((..((.((((....)))).))((((((((...)))).))))(((((((...))).)))).......((((...((((((.((((.((((.((((((.(........).))))))...))))...)))))))))).....))))...(((((((........))))))).......))))..).).)))).)))..)))))..)))).)))))))))))....)))))........(((..((.(((.((((((((.....(((((((((........((((...((((.....))))..........((((..(((...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))....)))).....(((((((......)))))))(((..((((((........))))))..)))...))))))))).))))....)))))))).))).))..))).))).)))........).)))))).))))))....))))))(.(((((((((......((((..((((......)).))..)))).((((...(((((.........))))).))))...((((.(((.((.....((((((......)))))).((((.((((........)))).)))).((((.....))))....)).))).))))(((.((.((((..((....))..)))).)).))).))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((.((((((,(({,,,.(((((....(((((((..((((.(((((((((.(((,{{{(((((,.,.(((((.........})))).})))))}....,|,}}},.({.(((((((...))).))))..}},,,|,||,,,({((((.({((,{{{,.{{{{{{.{......,,|,||||}}...}))),,,))}}))))}},,..(((.,...(((((((,.....,.)))))))..))}..}}}.,((,({{....}))),)))))..)))).)))))))))))....))))).....,,.(((..((.(((.((((((((.....({(((((((........((((,,.((((,....|}}}..|||,..,{({,...,,,...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..)))))))),..,))})}}}.,|||||{|,.....,})}|},(((..((((((........))))))..)))...,))))))))))}))....)))))))).))).))..))),)||.,.,....,},,).)))))).))))))}...,)))))(.(((((((((......,{((,.{({{.,,..,||.||.,||||.((((...(((((.........))))).)))).{{{{((,((({({,,,.,({{,,,...,|,|,||||.{{,{{((({(((,,(((.....)))))))...}}},}}}.},.,}),}}}.}))))),.||,||||.,|,,.|,}},.}))),}}}}}..))))))))).)
Back