Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NBEA_0045400

Sequence Length

695 nt

GC Content

0.4216

GACGGACAUAUAAUGAUCUGAACCAAUAUCCAGUGUUUCCGUGGGUGUUAACCAACUAUGAAUCAGAAGAGUUGGACCUGACUCUUCCAGGAAACUUCAGGGAUCUAUCAAAGCCAAUUGGUGCUUUGAACCCCAAGAGAGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAGGAACUAAUUCCAGAGUUCUACUACCUACCAGAGAUGUUUGUCAACAGUAAUGGAUAUAAUCUUGGAGUCAGAGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUGGCCCUAGAAAGUGAAUUUGUUUCUUGCCAACUUCAUCAGUGGAUCGACCUUAUAUUUGGCUAUAAGCAGCGAGGACCAGAAGCAGUUCGUGCUCUGAAUGUUUUUCACUACUUGACUUAUGAAGGCUCUGUGAACCUGGAUAGUAUCACUGAUCCUGUGCUCAGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-173.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -187.41

Frequency: 0.0000

Diversity: 234.40

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.........((((........(((((((.((((.((.((((.....((((((.(........).)))))).((((....(((((.(((.(((((((......(((((((........)))))))..((((((...(((.(((.....))).)))(((....)))..((((((((......................(((((....))))).(((((.((((..((((((((((((((((.((((.....))))..........((((..(((...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))....)))).....(((((((......)))))))(((..((((((........))))))..)))...(((.((((...((((..........))))..)))))))))))))....))))))))))..))...)).))))))))))))).))))))........)))))))..))).)).)))....)))).((((...(((((.........))))).)))).((((((.(((.((.....((((((......)))))).((((.((((........)))).)))).((((.....))))....)).))).)))))))))))).)))))))))))........)))))))).(((...)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{(((,,,.....,|{||||......(((((((.(({({({{{(({,,,..||{{{{.,......{{|{||||},...|)))}}}))||||||,{((((((,.....((((((({.....}.)))))))..{(((((,,.(((.(((.....))).))){{{,,|,},}..(((((({{.,,{{.....,,,,,{{{{{{{{{.{{,.((((((((....,{{(((((((.,,...,,(((({{.((((,....}}}}..|||,..,{({,...,,,...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))}..,))})}},.,|||||{{......})))}}}(((..((((((........))))))..)))...}})))))))}}}))....}))))))).}},.,||||}}.,,},}.,},}}},|,))))|})},..}}.,||}|)))))))).}}}))|........}}}}}}},,|||.||.||,||,,}}}}.||||,..|{|||,,......,))))),)))}.{{{{{{.{{{,{|,,|.|{{{{{,...,|,|,,}}}.||}{|{{{{(((,,(((.....)))))))...}}},}}),}},,)),})),})))))}|}}}}|}}}|))))))),....,,.)))))})).{{|,.,)))