Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0046000
Sequence Length
1366 nt
GC Content
0.4590
CCAAUUGGUGCUUUGAACCCCAAGAGAGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAGGAACUAAUUCCAGAGUUCUACUACCUACCAGAGAUGUUUGUCAACAGUAAUGGAUAUAAUCUUGGAGUCAGAGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUGGCCCUAGAAAGUGAAUUUGUUUCUUGCCAACUUCAUCAGUGGAUCGACCUUAUAUUUGGCUAUAAGCAGCGAGGACCAGAAGCAGUUCGUGCUCUGAAUGUUUUUCACUACUUGACUUAUGAAGGCUCUGUGAACCUGGAUAGUAUCACUGAUCCUGUGCUCAGGGAGGCCAUGGAGGCACAGAUACAGAACUUUGGACAGACGCCAUCUCAGUUGCUUAUUGAGCCACAUCCGCCUCGGAGCUCUGCCAUGCACCUGUGUUUCCUUCCACAGAGUCCGCUCAUGUUUAAAGAUCAGAUGCAACAGGAUGUGAUAAUGGUGCUGAAGUUUCCUUCAAAUUCUCCAGUAACCCAUGUGGCAGCCAACACUCUGCCCCACUUGACCAUCCCCGCAGUGGUGACAGUGACUUGCAGCCGACUCUUUGCAGUGAAUAGAUGGCACAACACAGUAGGCCUCAGAGGAGCUCCAGGAUACUCCUUGGAUCAAGCCCACCAUCUUCCCAUUGAAAUGGAUCCAUUAAUAGCCAAUAAUUCAGGUGUAAACAAACGGCAGAUCACAGACCUCGUUGACCAGAGUAUACAAAUCAAUGCACAUUGUUUUGUGGUAACAGCAGAUAAUCGCUAUAUUCUUAUCUGUGGAUUCUGGGAUAAGAGCUUCAGAGUUUAUUCUACAGAAACAGGGAAAUUGACUCAGAUUGUAUUUGGCCAUUGGGAUGUGGUCACUUGCUUGGCCAGGUCCGAGUCAUACAUUGGUGGGGACUGCUACAUCGUGUCCGGAUCUCGAGAUGCCACCCUGCUGCUCUGGUACUGGAGUGGGCGGCACCAUAUCAUAGGAGACAACCCUAACAGCAGUGACUAUCCGGCACCAAGAGCCGUCCUCACAGGCCAUGACCAUGAAGUUGUCUGUGUUUCUGUCUGUGCAGAACUUGGGCUUGUUAUCAGUGGUGCUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-384.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -411.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 356.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((.(((((((.(((((.....(((.(((.....))).)))(((....))).)))).....).)))))))))).............(((.((((((((.....(((((((((........((((...((((.....))))..........((((..(((...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))....)))).....(((((((......)))))))(((..((((((........))))))..)))...))))))))).))))....)))))))).)))..((..((((((....(((.(.((((((((....((((.((((((((.........(((((..((((......(((((.((.((.(((......))))).)).)))))......)))).)))))............)))))))).)))).....(((......)))((((((((((.(((.....)))))))...)))))))))))))).)))).....))))))..))...))).(((((((((((((.....((((...((((((.((((((...((((((((.....(((.((((.((...((((((.....)))))).....((((...))))))))))))).....)))))))).)))))).((((((.(((((.((......((((.((.(....).)).)))).(((((((((.((.............)).)))))..))))..(((((........))))).(((((.(((((.......))))).).)))))).)).))).)))))).(((.((......)).)))..........))))))....))))((((((......)))))).((((((((...(((..((((....))))...........(((.........)))........((((((((.((((((((((........)))..((((((.((((....)))).)))))).....(((........)))...(((((.(((((((((((((((........))))))).....))))))))...)))))....((((((....((...((((((((.((((.((((((......)))))).)))).))).........((((((((.(((.....(((.((((((.(((.(.((((.(((....(((((......)))))))).)))).)......((((.......)))).......)))..)))))))))....))).)))))))).)))))..))..)).)))))))))))..)))).))))..)))...))))))))..)))))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((.(((((((.{((((.,,,.(((.(((.....}}}.})),||,,,,},},)))}.....}.)))))))))}.....,,,..,,.{{{.((((((((.....{{(((((((.......,(((({{.((((,....}}}}..|||,..,{({,...,,,...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))}..,))})}}}.,|||||{{,.....,)))}}}(((..((((((........))))))..)))...,}))))))))}}))....)))))))).))}.,|{.|||{{{(,...{{(.(.(((((((({.{,(({{.((((((((.{,,....||({{,..,,,{,,,,.,(((((,{(.((,||{,||{|.||||}.,},|}}}}......}))),)})))},.,,,.,..}.}))))))).}}}}..,{.(((...,,.}}},||{,.(((,,(((.....)))))))...}}}}.})))))))).)))).....}}))))}.}}...))).((((((((((((({{{{.((((,,,((((((.{(((((...((((((((.....(((.((((.((...{{{{((.,,,.))}))),....((((...))))))))))))).....)))))))),)))))}.((((((.(((((.((......((((.((.(....).)).)))).(((((((((.((.,,......,,..}}.))))}..)))),.(((((........))))).(((((.(((((.......))))).).)))))).)).))).)))))).{((.{(,.....}}.}},...,...,,.))))))....)))){{{(((,...,,)}}))}.((((((((,,,({{,,{{{,.,..))))...........{{{.........}}},,......,|((((((.((((((({{{.....{{{|||{.{(((((.((((....}))).))))))....,,(({({{{{..,,,....,,|}}|||}|{{|||||||{....,||{|||||||||..,||||||||..,|,|||....|||||,....{{...((((((((.((((.((((((......)))))).)))).))){,.....,}((((((((.(((.,...(((.((((((.,{,.{.((((.(((....(((((......)))))))).)))).}......((((.......))))......,})}..)))))))))...,))).)))))))).)))))..}}..))}}))})))))))..))))))})},.,}}...))))))))..)))))))))))))...
Back