Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0046200
Sequence Length
646 nt
GC Content
0.4365
AGCUGUGUUUUAUGCAGAGCGUUAUGAGACAUGGGAAGAUGAUCAAAGCCCACCCUACCAUUAUAAUACCCAUUAUUCAACAGCAACAUCUACUUUAUCCUGGCUUGUUCGAAUUGAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAGGAACUAAUUCCAGAGUUCUACUACCUACCAGAGAUGUUUGUCAACAGUAAUGGAUAUAAUCUUGGAGUCAGAGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUGGCCCUAGAAAGUGAAUUUGUUUCUUGCCAACUUCAUCAGUGGAUCGACCUUAUAUUUGGCUAUAAGCAGCGAGGACCAGAAGCAGUUCGUGCUCUGAAUGUUUUUCACUACUUGACUUAUGAAGGCUCUGUGAACCUGGAUAGUAUCACUGAUCCUGUGCUCAGGGAGGCCAUGGAGGCACAGAUACAGAACUUUGGACAGACGCCAUCUCAGUUGCUUAUUGAGCCACAUCCGCCUCGGAGCUCUGCCAUGCACCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-164.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -178.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 169.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.....(((((((....((((.((.(((..((.((((((....((...(((((((((.(((.((((((((.....(((((((((........((((...((((.....))))..........((((..(((...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))....)))).....(((((((......)))))))(((..((((((........))))))..)))...))))))))).))))....)))))))).))).(((((..........)))))...)))))))))..))...)))))).)).))).))(((((..((((......(((((.((.((.(((......))))).)).)))))......)))).)))))..........((((((.(..........(((((((((((((((((...((((.(((.....))))))).......((((............))))((((((((...((.....(((....((((((.((((((((((....)).))..))))))))).))).)))..))))))).)))..))).)))))))))..))))))))))))))))..)))))))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((.....(((((((....((((..,.((({{(({,{{{{.....,,..,{{({{{{{{.,{,.((({{{{{....,{{(((((((,,,,,,,{(((({{.((((,....}}}}..|||,..,{((,...,,,...(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))))))}..,))))},,..|||||({......})))}}}(((..((((((........))))))..)))...||}}})}))}}|}}....}})})))).)),.|||||,,,,,,,}..,.)))},,))))}))),..}}.,|})})))}))}).,.,|((({,..,,,(,,,..,((({{.{{.((.{|{.,,,,.}})}),}),}}}}}......}))}.}}))),,.,,,,,..(((({{.|..........((((((((((((((((({..(((,{(((.....)))))))...,...,{{{......,.....,,,,((((((((...{(.,,..{((....{(({{,{((((((({((....)).}},.})))))))).))).})}..))))))).))).,))).)))))))))..))))).)))))))))),.))))))).,.))))...
Back