Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0046700
Sequence Length
1637 nt
GC Content
0.4673
GAACCUUUCACAACCUUCUUCCUCAAUGCAAAUGAUGGAAAAUUUGAUCAUCCAGAUCGAACCUUCUCAUCCGUUGCAAGGUCUUGGAGAACUAGUCAGAGAGAUACUUCUGAUGUAAAGGAACUAAUUCCAGAGUUCUACUACCUACCAGAGAUGUUUGUCAACAGUAAUGGAUAUAAUCUUGGAGUCAGAGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUGGCCCUAGAAAGUGAAUUUGUUUCUUGCCAACUUCAUCAGUGGAUCGACCUUAUAUUUGGCUAUAAGCAGCGAGGACCAGAAGCAGUUCGUGCUCUGAAUGUUUUUCACUACUUGACUUAUGAAGGCUCUGUGAACCUGGAUAGUAUCACUGAUCCUGUGCUCAGGGAGAUUCCAGAAGCUUAUUUCAUUAGAGACCCCCACACUUUCCUUCUUACAAAGGACUUUAUUAAGGCCAUGGAGGCACAGAUACAGAACUUUGGACAGACGCCAUCUCAGUUGCUUAUUGAGCCACAUCCGCCUCGGAGCUCUGCCAUGCACCUGUGUUUCCUUCCACAGAGUCCGCUCAUGUUUAAAGAUCAGAUGCAACAGGAUGUGAUAAUGGUGCUGAAGUUUCCUUCAAAUUCUCCAGUAACCCAUGUGGCAGCCAACACUCUGCCCCACUUGACCAUCCCCGCAGUGGUGACAGUGACUUGCAGCCGACUCUUUGCAGUGAAUAGAUGGCACAACACAGUAGGCCUCAGAGGAGCUCCAGGAUACUCCUUGGAUCAAGCCCACCAUCUUCCCAUUGAAAUGGAUCCAUUAAUAGCCAAUAAUUCAGGUGUAAACAAACGGCAGAUCACAGACCUCGUUGACCAGAGUAUACAAAUCAAUGCACAUUGUUUUGUGGUAACAGCAGAUAAUCGCUAUAUUCUUAUCUGUGGAUUCUGGGAUAAGAGCUUCAGAGUUUAUUCUACAGAAACAGGGAAAUUGACUCAGAUUGUAUUUGGCCAUUGGGAUGUGGUCACUUGCUUGGCCAGGUCCGAGUCAUACAUUGGUGGGGACUGCUACAUCGUGUCCGGAUCUCGAGAUGCCACCCUGCUGCUCUGGUACUGGAGUGGGCGGCACCAUAUCAUAGGAGACAACCCUAACAGCAGUGACUAUCCGGCACCAAGAGCCGUCCUCACAGGCCAUGACCAUGAAGUUGUCUGUGUUUCUGUCUGUGCAGAACUUGGGCUUGUUAUCAGUGGUGCUAAAGAGGGCCCUUGCCUUGUCCACACCAUCACUGGAGAUUUGCUGAGAGCCCUUGAAGGACCAGAAAACUGCUUAUUCCCACGCUUGAUAUCUGUCUCCAGCGAAGGCCACUGUAUCAUAUACUAUGAACGAGGGCGAUUCAGUAAUUUCAGCAUUAAUGGGAAACUUUUGGCUCAAAUGGAGAUCAAUGAUUCAACACGGGCCAUUCUCCUGAGCAGUGACGGCCAGAACCUGGUCACCGGAGGGGACAAUGGGGUAGUAGAGGUCUGGCAGGCCUGUGACUUCAAGCAACUGUACAUUUACCCUGGAUGUGAUGCUGGCAUUAGAGCAAUGGACUUGUCCCAUGACCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-476.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -510.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 421.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...............)))(((..(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))).((((.(((.((.(.((((.((.(((((.(((((..(((..((((((........))))))..)))....))))).))))).)).........((((...))))(((.(((.((((((..(((((.((((...((((.((((((((.........(((((..((((......(((((.((.((.(((......))))).)).)))))......)))).)))))............)))))))).)))).....(((...)))((((.((((........)))).)))).((((.....))))........((.((((((((((((.((((((((((((.(((...))).)))).).))))....)))))).))))...))))).))......))))))))).)))))).(((((..((.((((...(((.....)))...)))).))..)))))....))).)))...(((((((((...(((.((((...((((((((.((((((..(((.(((((..((((((((.....(((((((((.........((((.((.(....).)).))))..((((((((((((...........((((((((..((((.(((((((........))))).(((((.(((((.......))))).).)))).......((((....((((((.(((((...((((........((.(((.((.((((((..........)))))).))....))).)).......((((....))))...........))))...)))))..))))))....))))....(((((..(((........)))..((((((.((((....)))).))))))......((((((((...........))))))))((((((((((........)))))))))).....(((((((((.(((...(((((((....((...((((((((.((((.((((((......)))))).)))).))).........((((((((.(((.....(((.((((((.(((.(.((((.(((....(((((......)))))))).)))).)......((((.......)))).......)))..)))))))))....))).)))))))).)))))..))..)).)))))))).))))))))))))))....)).))))..........((((((....(.(((((....))))).)...)))))).))))))))..(((((((.(((((((..(((.((((.....((..........))......))))..))).((....))((..((((...))))..))..)))))))..)))))))))))))))))))..(((((.....((((((...((..((........))..)).))))))))))).))))).).)))((((((...))))))...))))))))..)))))))))))))).))))..)))).)))).))).)))))))))((((((((...)))))))).((((........))))...)))).)))))).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...............)))(((..(((((..(((((((..(((((((.....)))))))..))).))))..))))).((((.(((.({,(.((((.((.(((((.(((((..(((..((((((........))))))..)))....))))}.))))).))..{{{{..||,,,....,|{((({((({.((..({{(((((.,((((({,,{,{((((((((.,....,,{{({,......|||,..|,,||,,,|.})}))}})}{{.|,||},,,{|||||,.....|}}}}}})))}}}}}}}}}.,.{{||.,,},.......{{(({{{((({(({((({,,(((,,(((.....)))))))...|,,,,||,,..,,},,,,.{{{{{(((((((,(({(((((((((.{((.,,}}).)})}.,})))),...}))))),,)}}...}}}},.})}},......,,,,,},,,|||..(((((..((.((((...(((.....)))...)))).))..))))).,,})).}}},}))|,|||||||},.,||}||{|...((((((((.((((((..(((.(((((({((((((((.....((({(((({.........((((.((.(....).)).))))..((((((((((((,.......,,.{(((((((.......{.(((((........))))).(((((.(((((.......))))).}.)))),,.,,..((({....{{((({.(((({.,.((((........||.{{{,{,.,,{{,{{((((((,...}})))))}...,}}}|,|,,{,{,,{{{{.},,})))...........}))}...})))},.)))}}}....))}),|,,{{{{{,,,,,..,,.((({{{{.{(((((.((((....)))).))))))....{,((((((({...........})))))))||}}))))}({{{,{{{({|||{{(({{...{.{((((((((.(((...{((((((....({...((((((((.((((.((((((......)))))).)))).))),,.....,}((((((((.(((.,...(((.((((((.,,,.{.((((.(((....(((((......)))))))).)))).}......((((.......))))......,})}..)))))))))...,))).)))))))).)))))..}}..))}}))))))).))))))))),.),...))))}))))))),})))).((((((....{.(((((....))))).}...)))))).)))))))).}|((((((.(((((((.,{{{.(((....}}||,,...{{..((((.((.....,,.}}.))))..}}.,...{{,({{{|...,}))}.)))))))..)))))))))))))))))))..(((({.....((((((...((..((.....,.,))..}}.))))))})}))}))))).}.)))((((((...))))))...)))))))))},))))))))))))).))))..})))}),))})))})))))))))|(((((({...))))))),.{(((........)))}...)))).)))))).)))).)))
Back