Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NBEA_0046800
Sequence Length
596 nt
GC Content
0.4648
AGAAGAUGAAGUAGUGGUAAAUGAUGUUGAUCUUCCCCCUUGGGCAAAAAAACCUGAAGACUUUGUGCGGAUCAACAGGAUGGCCCUAGAAAGUGAAUUUGUUUCUUGCCAACUUCAUCAGUGGAUCGACCUUAUAUUUGGCUAUAAGCAGCGAGGACCAGAAGCAGUUCGUGCUCUGAAUGUUUUUCACUACUUGACUUAUGAAGGCUCUGUGAACCUGGAUAGUAUCACUGAUCCUGUGCUCAGGGAGAUUCCAGAAGCUUAUUUCAUUAGAGACCCCCACACUUUCCUUCUUACAAAGGACUUUAUUAAGGCCAUGGAGGCACAGAUACAGAACUUUGGACAGACGCCAUCUCAGUUGCUUAUUGAGCCACAUCCGCCUCGGAGCUCUGCCAUGCACCUGUGUUUCCUUCCACAGAGUCCGCUCAUGUUUAAAGAUCAGAUGCAACAGGAUGUGAUAAUGGUGCUGAAGUUUCCUUCAAAUUCUCCAGUAACCCAUGUGGCAGCCAACACUCUGCCCCACUUGACCAUCCCCGCAGUGGUGACAGUGACUUGCAGCCGACUCUUUGCAGUGAAUAGAUGGCACAACACAGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -157.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 200.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((.((((...((((.((((((((.........(((((..((((......(((((.((.((.(((......))))).)).)))))......)))).)))))............)))))))).)))).....(((...)))((((.((((........)))).)))).((((.....))))........((.((((((((((((.((((((((((((.(((...))).)))).).))))....)))))).))))...))))).))......))))))))).)))))(.(((((..((.((((...(((.....)))...)))).))..))))).......((((((((((.(((.....((((....((((...))))))))......))).)))...(((((..((.((((((.(((((.((......((((.((.(....).)).)))).(((((((((.((.............)).)))))..))))..(((((........))))).(((((.(((((.......))))).).)))))).)).))).)))))).)).)).))).)))))))...........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.((((((((.,((({({..,,,((((((((.,....,.{{({,......|||,..|{,{{{,,|.||}}}|}}}||.,,}})},|||||},.,....,}))})))))))))))))).{,{|,,.,,},.......{{((({{{(({(({((({,,(((,,(((.....)))))))...|,,.,||,,..,,|.,,,.{{{{{((((((({({{{((((({((.,((.,,}}}.}}}}.,})))},,..}))))),,}},...|}}},.,)}}............|,{||,,..{,|||},((,{{{{..,(((..,,,||}..,|}}},|}..}}}||{.{|||.||,..|||,||}}}}})),}))}}}..((((...))))}))||||,,,|...}|||||||||,|,|{|((((((.(((((.({......((((.((.(....).)).)))).(((((((((.((.,,......,}..}).))))}..)))),.(((((........))))),(((((.(((((.......))))).).))))}).)).))).)))))).||..||}....,}.})),,,.}},.))))
Back