Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NCOA5_0000600

Sequence Length

464 nt

GC Content

0.4871

GAGAGAAGGCUCUUAUGACCGAUACCUACGAAUGGAUGACUAUUGCAGGAGAAAGGAUGACUCUUAUUUUGACCGUUACAGAGAUAGCUUUGAUGGACGGGGCCCUCCAGGCCCAGAAAGUCAGUCUCGUGCAAAAGAGCGUUUGAAACGUGAGGAACGGCGUAGAGAAGAGCUUUAUCGUCAAUAUUUUGAGGAAAUCCAGAGACGCUUUGAUGCCGAAAGGCCCGUUGAUUGUUCUGUGAUUGUGGUCAACAAACAGACAAAAGACUAUGCUGAGUCUGUGGGGCGGAAGGUGCGAGACCUGGGCAUGGUAGUGGACUUGAUCUUCCUUAACACAGAAGUGUCACUGUCACAAGCCUUGGAGGAUGUUAGCAGGGGAGGUUCUCCUUUUGCUAUUGUCAUCACCCAGCAACACCAGAUUCACCGCUCCUGCACAGUCAACAUCAUGUUUGGAACCCCGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-134.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -145.30

Frequency: 0.0000

Diversity: 127.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(....((((((((((((.(((.(.((((((...(((((.((.(((((.((((.....(((((....(((((.(((((.(((((....)))))...)))))((((.....)))))))))))))).)))).)))))...)))))))....))).)))).)))))))....)))))))).((.((((....)))).))..((((((.(.....(((((((....)))..((((((((((((((..((((.....)))))))))....(((((......)))))(((((((((.((((.....))))((((.(((((((((((((.................)))).)))))))))...))))(((..((((.(((((((((((...)))).)))))))....))))..)))...............)))).))))))))))))))))))).))))))...)(....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

({(..((((((((((((.(((.{.((((((..,(((((.((.(((((.((((.....(((((.,..,,,{{.(((((.(((((....))))).,,)}))|((((.....)))))}}},))))).)))).))))).,,}})))))....))),})),.))))))}....)))))))).((.((((....)))).))..{{(((({,..}}}||,,(((....)))..(((|,((({{((((..{(((.....)}}}))))),,,..|||,..,.{(((((((((..(({{.((((.....}}}}((((.{((({((({(({{,,,,,,,.........,)))),))))))}),,..)))}{((..((((.(((((((((((...))))))))))))..,.))))..)))))..)),,))))))},},)})|{||},}}|||||,.,.}}))})}....}|}),,)