Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NDE1_0008200
Sequence Length
208 nt
GC Content
0.4038
GCUGGAGGGUGGUGGUUUUUAUAUUCCUUGUGUGAGGGGUGUCUGUGAUAUUUGGAAUUUGAGAAUGGAUUUAGACAAUGCUAAGUACAGUCUGCUGGGUUUUGCUUUGUUCUGGGUUGUUGUUGGGUUUUUUUUGUUUGUUUGUUUUGGUUUUUGGUUUUCUUGCCGUGGUGCAAAACUGUAGAAAGUUGCUUAUUCACUGGCCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-44.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -48.01
Frequency: 0.0054
Diversity: 25.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.((((((((((((.(((((..((((.(.((....)).).))))..))))).))))))).(((((((((((.((.(((..(((....)))..))).)).))).)))))))).....(((((.(((((((.......((((((.....((((......)))).....))))))..)))))))..)))))..))))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((.((((((((((((.(((((..((((.(.((....)).).))))..))))).))))))).(((((((((((.((.{((..(((....)))..))}.)).)))}}))))))).....(((((.,{((((,.......((((((.....((((......)))).....))))))..}}))))}..)))))..))))).)))).
Back