Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0004500
Sequence Length
1498 nt
GC Content
0.4586
AUCUUGAGCCAGAUGAUUGUGCAUCCAUUUACAUCUUUAAUGUAGAUCCACCUCCAUCUACUUUAACCACACCACUUUGCUUACCACAUCAUGGAUUACCGUCUCACUCUUCUGUUUUGUCACCAUCGUUUCAGCUCCAAAGUCACAAAAACUAUGAAGGAACUUGUGAGAUUCCUGAAUCUAAAUAUAGCCCAUUAGGUGGUCCCAAACCCUUUGAGUGCCCAAGUAUUCAAAUUACAUCUAUCUCUCCUAACUGUCAUCAAGAAUUAGAUGCACAUGAAGAUGACCUACAGAUAAAUGACCCAGAACGGGAAUUUUUGGAAAGGCCUUCUAGAGAUCAUCUCUAUCUUCCUCUUGAGCCAUCCUACCGGGAGUCUUCUCUUAGUCCUAGUCCUGCCAGCAGCAUCUCUUCUAGGAGUUGGUUCUCUGAUGCAUCUUCUUGUGAAUCGCUUUCACAUAUUUAUGAUGAUGUGGACUCAGAGUUGAAUGAAGCUGCAGCCCGAUUUACCCUUGGAUCCCCUCUGACUUCUCCUGGUGGCUCUCCAGGGGGCUGCCCUGGAGAAGAAACUUGGCAUCAACAGUAUGGACUUGGACACUCAUUAUCACCCAGGCAAUCUCCUUGCCACUCUCCUAGAUCCAGUGUCACUGAUGAGAAUUGGCUGAGCCCCAGGCCAGCCUCAGGACCCUCAUCAAGGCCCACAUCCCCCUGUGGGAAACGGAGGCACUCCAGUGCUGAAGUUUGUUAUGCUGGGUCCCUUUCACCCCAUCACUCACCUGUUCCUUCACCUGGUCACUCCCCCAGGGGAAGUGUGACAGAAGAUACGUGGCUCAAUGCUUCUGUCCAUGGUGGGUCAGGCCUUGGCCCUGCAGUUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAGGUAGCCGAGGGGCAGUAAAAGCAUCUACUGGGGGACAUCCUGUUGUGAAGCUCCUGGGCUAUAACGAAAAGCCAAUAAAUCUACAAAUGUUUAUUGGGACAGCAGAUGAUCGAUAUUUACGACCUCAUGCAUUUUACCAGGUGCAUCGAAUCACUGGGAAGACAGUCGCUACUGCAAGCCAAGAGAUAAUAAUUGCCAGUACAAAAGUUCUGGAAAUUCCACUUCUUCCUGAAAAUAAUAUGUCAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-405.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -433.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 434.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....((((((((...((((((...((.(((.((((((((.((((((........)))))).))))............(((((((.(((((((((........((((.(((((.((((((.((..................)).))))))....(((((((((..(((((...(((((..(((....)))....))))).(((.....)))...((((((.((((((..........((((((..(((..............)))..)))))).....(((((((................(((.....))).((((((((((.....))))))))))......)))))))((.((((((((..(((((((((.((..((((.(((((..(((.........(((((.......((((......))))))))).......((((((.....))))))..........)))..))))).))))..))..((((...(((...((((((....))))))....))).))))))))))))).(((((((((.....))))))))).......)))).)))).)).....)))))).))))))..........(((((.....))))).........((((((((((.(((((((((..(((((((.(((...))))))))....))..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...)))))).))))))))))...............)))))..)))))))))(((((........)))))))))).))))((((((...(((......))))))))))))))))))))).))))((((((..((((((((((((...(((((.((......)))))))..(((((.(((..............((((((.((..((((......................)))))).)))))))))...)))))..........((((((((((.(((((..(.(.((((.((((((((((.................)))))))((((((.(...((((......(((((..............)))))......)))).).))))))(((((.......((((.(((((((....((((..(((((((......)))).)).)..))))....)))).........))).)))).................((.((((.(((......))).))..)))))))))(((((........))))).))).)))).).)..)))))))))))))))...........(((((((((........))))))))).....(((.(((((((..............(((((((....)))))))))).)))))))))))))........)))))).))))))))))..))).))...))))))....)))))...)))....)((..((((..........))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..{.(((((((({..((((((...{{.{{{.{(({((({.((((((........)))))).})},.....,.({{{{(,,{,(({(((((((((({{{{(({(((((((((,(((((((.((....{.............)).))))}}|}..,|||||,,,..|||||}}...,,...{{,....,}}.....,.))}|||}}.......,{(((((({,,,,|}}}}}}},...((((((..(((.......,......)))..)))))).,,,.(((((((.{.,.((({.,{{{..(((.....))).}}}},,{{,,|{{...,,((((({...)))))),}},}|,.,,((((((.,({{,,(((({,,..||||,{{{((,{(...{({.,,.,}|}.,,,..}}})))},))))}}})))..})}}}}}}.{(((((.....)))))}.......,)})))))))},,)))))}.),.,|..({{{(((..{((({,.{{{{{||,||..{{{{|{.{{,|||||||||.(((((((((.....))))))))).,.....||||,,|,,.||{,{||||||||{||||,,..........(((((.....))))).........|{{{{|||||,,{(((((((..{,(((((.(((...))))))))....,,..)))))))...((((((......)))))){{{(,,,(({{{,.,,|||||,,,||},},.,|||}|||||,,,.....{{{{{{,|,,}}..}}},||||,(((((........))))),))))||.|||||||{,..,{{,,....}})))}))))))))))))))}.))),..,})}}},|||{{,,,,,{}|,}}}}}}}}}|,.,{|||,,|....,,,}}}}.....,|||,...,}}}}||,,,,|,,|,||}}|,,}}}}}}}}}.,.}}}}))(((,.,,)))..}}}}})))).,.,,.,,...((((((((((.((((({{({,.((((.(({{(((({{....|,,,......|,,|}}}}},((((({.,.,,({{|,,,,..(((((..............)))))......}}),.)})))))}(((((.......((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....)))).........})).)))).{{{{.....((,{.,,.|,,..,.|,}}}}...}},}))}.||,.)))))(((((........)))))}))).)))),)})..)))))))))))))))...........(((((((((........)))))))))....{(({,,(,(((,......}}}..,},|||{(({..,,|}}}}}}},},.,)})))},,},}}}))}}...)))),,)),,})))}}..,}}.}}..,)))))}..},}))))...))}....)((..((((........,.))))..))
Back