Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0004700
Sequence Length
1812 nt
GC Content
0.4487
AUCUUGAGCCAGAUGAUUGUGCAUCCAUUUACAUCUUUAAUGUAGAUCCACCUCCAUCUACUUUAACCACACCACUUUGCUUACCACAUCAUGGAUUACCGUCUCACUCUUCUGUUUUGUCACCAUCGUUUCAGCUCCAAAGUCACAAAAACUAUGAAGGAACUUGUGAGAUUCCUGAAUCUAAAUAUAGCCCAUUAGGUGGUCCCAAACCCUUUGAGUGCCCAAGUAUUCAAAUUACAUCUAUCUCUCCUAACUGUCAUCAAGAAUUAGAUGCACAUGAAGAUGACCUACAGAUAAAUGACCCAGAACGGGAAUUUUUGGAAAGGCCUUCUAGAGAUCAUCUCUAUCUUCCUCUUGAGCCAUCCUACCGGGAGUCUUCUCUUAGUCCUAGUCCUGCCAGCAGCAUCUCUUCUAGGAGUUGGUUCUCUGAUGCAUCUUCUUGUGAAUCGCUUUCACAUAUUUAUGAUGAUGUGGACUCAGAGUUGAAUGAAGCUGCAGCCCGAUUUACCCUUGGAUCCCCUCUGACUUCUCCUGGUGGCUCUCCAGGGGGCUGCCCUGGAGAAGAAACUUGGCAUCAACAGUAUGGACUUGGACACUCAUUAUCACCCAGGCAAUCUCCUUGCCACUCUCCUAGAUCCAGUGUCACUGAUGAGAAUUGGCUGAGCCCCAGGCCAGCCUCAGGACCCUCAUCAAGGCCCACAUCCCCCUGUGGGAAACGGAGGCACUCCAGUGCUGAAGUUUGUUAUGCUGGGUCCCUUUCACCCCAUCACUCACCUGUUCCUUCACCUGGUCACUCCCCCAGGGGAAGUGUGACAGAAGAUACGUGGCUCAAUGCUUCUGUCCAUGGUGGGUCAGGCCUUGGCCCUGCAGUUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAGGUAGCCGAGGGGCAGUAAAAGCAUCUACUGGGGGACAUCCUGUUGUGAAGCUCCUGGGCUAUAACGAAAAGCCAAUAAAUCUACAAAUGUUUAUUGGGACAGCAGAUGAUCGAUAUUUACGACCUCAUGCAUUUUACCAGGUGCAUCGAAUCACUGGGAAGACAGUCGCUACUGCAAGCCAAGAGAUAAUAAUUGCCAGUACAAAAGUUCUGGAAAUUCCACUUCUUCCUGAAAAUAAUAUGUCAGCCAGUAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCUCCCAGCGGUCUGCUCAAGAACUUCCUCAUAUUGAGAAGUACAGUAUCAACAGUUGUUCUGUAAAUGGAGGUCAUGAAAUGGUUGUGACUGGAUCUAAUUUUCUUCCAGAAUCCAAAAUCAUUUUUCUUGAAAAAGGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-486.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -520.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 538.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((..(((((...(((.((((((........((((.((((((........)))))).))))...((......))...........))))))))))))))..)))....))((((((((.(((((((((..((((((.((((((...((....))....))))))((((((((..(((.............(((((.(((........(((((((((....)))))))))...((((((..(((..............)))..))))))........))).)))))..............))).))))))))))))))..(((((((((((((...))))))......((((((((..((((...))))((((((((..(.((((((...(((.....)))......)))))).)((((((...(((((((((...((((((.....))))))......(((((((((((..(((........)))..)))))..........(((((((.((..((((((.((.(((((((((.(((((((((.....))))))))).......(((((.(.(((((((.((..((((.(((((..........(((((.....))))).........((((((((((.(((((((((..(((((((.(((...))))))))....))..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...)))))).))))))))))........(((((((...........((((.(((((........))))).))))((.((((((((...(((......))))))))))))))))))))...(((....))).)).)))...))))..)).)))))))...((((..(....)..))))......((((....)))).........).)))))..))))))))).))))))))(((....)))..)))))))))...))))))..((((((((((.(((((..(.(.((((.((((((((((.................)))))))((((((.(...((((......(((((..............)))))......)))).).))))))(((((.......((((.(((((((....((((..(((((((......)))).)).)..))))....)))).........))).)))).................((.((((.(((......))).))..)))))))))(((((........))))).))).)))).).)..)))))))))))))))...........(((((((((........)))))))))....(((((.(.(((.......)))).)).)))........)))))))))))))))..))))))))((..((((((((.......((((....((((.((((.((....)).)))).)))).....)))).((((..........))))..((((((..((.(((.((((((......((((....(((.((.........)))))..)))).....)))))).))).))..))))))((((...(((((((((.......))))...((((......))))..)))))....)))))))).))))..))....((((((........))))))...))))))))(((((.(((...)))))))).........((((.....))))....))))))).))))))))).))))(((((...........)))))..(((....(((.......)))....)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({,((({(,,,(({,,{{|||...|||,.{(({.((((((........)))))).}))}.......({({((....((((((((((((({{{{{(((((((((((.{((((((.((....{,.......,....)).))}}}}}}...}}})}.....))))}}}..,,,...{{,....,,,.....,,))}}||}}.......{((((((((....))))))))}...((((((..(((..............)))..)))))).,,,.(((((((.{.,.((({.,,{{..(((.....))).}}}},,{{,,{{{...,,((((({...)))))),,,,}},.,,((((({,{{{,..{((((,,..||||,{{{{{{{(..,{({..,.,)}}.,,...})))))},})))}}}))),.}))})}}}.{(((((.....)))))}.......,))))))))),..)))))}.}..,|,.{{{{{,|...{{{,..(((((((.{{..((((((.{{.(((((((({.(((((((((.....))))))))).,.....{({{,,|,,,{{{,{{{||{(((({{{{.,..........(((((.....))))).........|||,,|||||}.{(((((((..{{(((((.(((...))))))))....,,..)))))))...((((((......)))))),,,{,{,({{{|,,|{|||||{{{||,,,..,|||,|||||,,,.....{{{{{{{,.,,,..},,,((({.(((((........))))).)))){|.((((((((...{({......}})))))))))}}}))))))}.}}}....))))).)}).....,,,)}}))})))))||{..((({..{....,.,)))}....,,{|{{...,}}}}|,.,.,},,}.}}))},.))))))))).},))))))(((....)))..}}))))))).,,,,,||...((((((((((.((((({{({,.((((.(({{(((({{....|,,,......|,,|}}}}},((((({.,.,,{{{|,,,,..(((((..............)))))......}})}.)})))))}(((((.......((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....)))).........})).)))).{{{{.....((,{.,,.|,,..,.|,}}}}...}},}))}.||,.}))))(((((........)))))}))).)))),)})..)))))))))))))))...........(((((((((........)))))))))..,,||||,|{,(((,......}}}..||{((((((,....}))))))).)}.,|,{|||||.,||||||((((((((,....,,((({....{(({.((((.((....)).)))).,)))....,})}}.{{({........,.}}}|,.((((((..((,(({.{(({{{......{{{|....{{{.{{.......,|}}}}}..))))...,.)))))).))).}}..)}}})},{{|,..{{|{(((((.......)))),..((((......))))..,}))),,,,)))))))).))))..,,....{{{{{|,|,,.,,,))))))}}}))))))))(((({{((,...}))))})},{||,..,.||,|,.,,,)))),.}})))}}},,.{((((((((,,({(((((...........)))))..}},,.})))))))}}((({.....,,,))))
Back