Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0004800
Sequence Length
1995 nt
GC Content
0.4486
AUCUUGAGCCAGAUGAUUGUGCAUCCAUUUACAUCUUUAAUGUAGAUCCACCUCCAUCUACUUUAACCACACCACUUUGCUUACCACAUCAUGGAUUACCGUCUCACUCUUCUGUUUUGUCACCAUCGUUUCAGCUCCAAAGUCACAAAAACUAUGAAGGAACUUGUGAGAUUCCUGAAUCUAAAUAUAGCCCAUUAGGUGGUCCCAAACCCUUUGAGUGCCCAAGUAUUCAAAUUACAUCUAUCUCUCCUAACUGUCAUCAAGAAUUAGAUGCACAUGAAGAUGACCUACAGAUAAAUGACCCAGAACGGGAAUUUUUGGAAAGGCCUUCUAGAGAUCAUCUCUAUCUUCCUCUUGAGCCAUCCUACCGGGAGUCUUCUCUUAGUCCUAGUCCUGCCAGCAGCAUCUCUUCUAGGAGUUGGUUCUCUGAUGCAUCUUCUUGUGAAUCGCUUUCACAUAUUUAUGAUGAUGUGGACUCAGAGUUGAAUGAAGCUGCAGCCCGAUUUACCCUUGGAUCCCCUCUGACUUCUCCUGGUGGCUCUCCAGGGGGCUGCCCUGGAGAAGAAACUUGGCAUCAACAGUAUGGACUUGGACACUCAUUAUCACCCAGGCAAUCUCCUUGCCACUCUCCUAGAUCCAGUGUCACUGAUGAGAAUUGGCUGAGCCCCAGGCCAGCCUCAGGACCCUCAUCAAGGCCCACAUCCCCCUGUGGGAAACGGAGGCACUCCAGUGCUGAAGUUUGUUAUGCUGGGUCCCUUUCACCCCAUCACUCACCUGUUCCUUCACCUGGUCACUCCCCCAGGGGAAGUGUGACAGAAGAUACGUGGCUCAAUGCUUCUGUCCAUGGUGGGUCAGGCCUUGGCCCUGCAGUUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAGGUAGCCGAGGGGCAGUAAAAGCAUCUACUGGGGGACAUCCUGUUGUGAAGCUCCUGGGCUAUAACGAAAAGCCAAUAAAUCUACAAAUGUUUAUUGGGACAGCAGAUGAUCGAUAUUUACGACCUCAUGCAUUUUACCAGGUGCAUCGAAUCACUGGGAAGACAGUCGCUACUGCAAGCCAAGAGAUAAUAAUUGCCAGUACAAAAGUUCUGGAAAUUCCACUUCUUCCUGAAAAUAAUAUGUCAGCCAGUAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCUCCCAGCGGUCUGCUCAAGAACUUCCUCAUAUUGAGAAGUACAGUAUCAACAGUUGUUCUGUAAAUGGAGGUCAUGAAAUGGUUGUGACUGGAUCUAAUUUUCUUCCAGAAUCCAAAAUCAUUUUUCUUGAAAAAGGACAAGAUGGACGACCUCAGUGGGAGGUAGAAGGGAAGAUAAUCAGGGAAAAAUGUCAAGGGGCUCACAUUGUCCUUGAAGUUCCUCCAUAUCAUAACCCAGCAGUUACAGCUGCAGUGCAGGUGCACUUUUAUCUUUGCAAUGGCAAGAGGAAAAAAAGCCAGUCUCAACGUUUUACUUAUACACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-546.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -584.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 402.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((.(((((((..(((((((((((((((((((((..((((((........)))))).........(((((((..............((((((...((((((((((((..((((((.((..................)).)))))).....))))).....))))))).....)))))).............))))))).........(((((((((....)))))))))...((((((..(((..............)))..))))))....)))))))).........)))))).(((.....))).((((((((((.....))))))))))......((((((((.(((..(((.((((((.(((.((((((((((.(((((....((((((((((..((((((...((((((.....(((((..((((....((((((.....)))))).......)))).((((((.(((((((.......(.((((.....(((...(((((((.((..((((((.((.(((((((((.(((((((((.....))))))))).......(((((.(.(((((((.((..((((.(((((..........(((((.....))))).........((((((((((.(((((((((..(((((((.(((...))))))))....))..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...)))))).))))))))))........(((((((...........((((.(((((........))))).))))((.((((((((...(((......))))))))))))))))))))...(((....))).)).)))...))))..)).)))))))...((((..(....)..))))......((((....)))).........).)))))..))))))))).))))))))(((....)))..))))))))).....)))...((((((((((.(((((..(.(.((((.((((((((((.................)))))))((((((.(...((((......(((((..............)))))......)))).).))))))(((((.......((((.(((((((....((((..(((((((......)))).)).)..))))....)))).........))).)))).................((.((((.(((......))).))..)))))))))(((((........))))).))).)))).).)..)))))))))))))))...........(((((((((........)))))))))........((((((((((((..((((.((((((((((....)))))))).))......(((((((.(((.(((......)))...........((((.((((.((....)).)))).))))..))))))))))...........))).)..)))))))))))))))).))))))))...))))))..))))).....))))))....))))))..)))...))))))).........(((((...(((((((((.......))))...((((......))))..)))))....)))))......((((((((..((((((........))))))(((.....)))(((((.(((...)))))))).........((((.....))))..))))))))...(((((((((..(((((((...........)))))..))...))))))))).........))))))))).))).)))))).)))))))))..))))))))))).....(((..(((.(((((((.(.......)))))))).)))..))).............(((((....)))))......)))))))..))))))((((....))))..((........)).).))))).))((............))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((.,((((((..(((((((({{,,.{{{{{(((,.((((((........)))))).,,,,....{(({{{{.{{{.......,,,,(((,,...((((((((((((.(((((((.((....{........,....)).)))))),}...))))).....))))))),}},}),,}},.....}}}.....})))))).........(((((((((....)))))))))...((((((..(((..............)))..))))))....,}}}}}}}..,...,...,,||,.(((.....))).{{{|{{(({{.....})))}}))}}..}}},((((((((.(((..(((.((((((.(({.(((({{((((.(((((....((((((((((..((((((...((((((.....(((((..((((....((((((.....)))))).......)))).((((((.(((((((.......,,((({,,..,{{{,..(((((((.((..((((((.((.(((((((((.(((((((((.....))))))))).......((({{.{..,{(({(,(,{{(((({(((............(((((.....))))).........|||..}}})}}.{(((((((..{{(((((.(((...))))))))....,,..))))))).,.((((((......))))))...,{{{({,,||||{((((((((({..,...(((.((((({{{...,.(((((((.......,...((((.(((((........))))).)))){{.((((((((...{({......}}))))))))))}})))))),.}))....))))).)))........)))))))))))}|,..((({..{....,.,))))....},{||,...}))})}.....}},}.}})))..))))))))).),))))))(((....)))..))))))))).,,..,,,...((((((((((.((((({{({,.((((.(({{(((({{....|,,,......|,,|}}}}},((((({.,.,,({{|,,,,..(((((..............)))))......}}),.)})))))}(((((.......((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....)))).........})).)))).{{{{.....((,{.,,.|,,..,.|,}}}}...}},}))}.||,.)))))(((((........)))))}))).)))),)})..)))))))))))))))...........(((((((((........)))))))))....{{{{,,({(((,,.....}}},.||{|||{({,..,,}}}}}}}},}}.,}|||||,,,|{{{||,{,{,|||,.,}}...(({,....{(({.((((.((....)).)))).,))}....,)))),|||,........,,)).},}))))})))))))))})}})))))))...))))))..))))).....))))))....))))))..)))...))))))).........{((((...(((((((((.......)))),..((((......))))..}))))....))))}......((((((((..((((((.,....,.)))))){((.....))}(((({{(({...}))))))){{{{...,,{{,,.,,..))))..)))))))),{.(((((((((..({(((((...........)))))..}},,.))))))))),,.}}....))))))))).))),}}))}}.)))))))))..)))))))))))....{(((..,{{.(((((((((.......)))))))).}))}}),,.............(((((....))))).}}}..)))))))..)))))){{((....))}}..{{........)).).))))).))({............))
Back