Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0005300
Sequence Length
1248 nt
GC Content
0.4639
AUCUUGAGCCAGAUGAUUGUGCAUCCAUUUACAUCUUUAAUGUAGAUCCACCUCCAUCUACUUUAACCACACCACUUUGCUUACCACAUCAUGGAUUACCGUCUCACUCUUCUGUUUUGUCACCAUCGUUUCAGCUCCAAAGUCACAAAAACUAUGAAGGAACUUGUGAGAUUCCUGAAUCUAAAUAUAGCCCAUUAGGUGGUCCCAAACCCUUUGAGUGCCCAAGUAUUCAAAUUACAUCUAUCUCUCCUAACUGUCAUCAAGAAUUAGAUGCACAUGAAGAUGACCUACAGAUAAAUGACCCAGAACGGGAAUUUUUGGAAAGGCCUUCUAGAGAUCAUCUCUAUCUUCCUCUUGAGCCAUCCUACCGGGAGUCUUCUCUUAGUCCUAGUCCUGCCAGCAGCAUCUCUUCUAGGAGUUGGUUCUCUGAUGCAUCUUCUUGUGAAUCGCUUUCACAUAUUUAUGAUGAUGUGGACUCAGAGUUGAAUGAAGCUGCAGCCCGAUUUACCCUUGGAUCCCCUCUGACUUCUCCUGGUGGCUCUCCAGGGGGCUGCCCUGGAGAAGAAACUUGGCAUCAACAGUAUGGACUUGGACACUCAUUAUCACCCAGGCAAUCUCCUUGCCACUCUCCUAGAUCCAGUGUCACUGAUGAGAAUUGGCUGAGCCCCAGGCCAGCCUCAGGACCCUCAUCAAGGCCCACAUCCCCCUGUGGGAAACGGAGGCACUCCAGUGCUGAAGUUUGUUAUGCUGGGUCCCUUUCACCCCAUCACUCACCUGUUCCUUCACCUGGUCACUCCCCCAGGGGAAGUGUGACAGAAGAUACGUGGCUCAAUGCUUCUGUCCAUGGUGGGUCAGGCCUUGGCCCUGCAGUUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-333.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -357.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 354.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((((((((((.....(((.............((((.((((((........)))))).))))...........)))......)))).)))........)))).)((((.((((((((((.....((((((.((((..(((.(((((....(((((((((..(((((...(((((..(((....)))....))))).(((.....)))...((((((.((((((..........((((((..(((..............)))..)))))).....(((((((................(((.....))).((((((((((.....))))))))))......)))))))((.((((((((..(((((((((.((..((((.(((((..(((.........(((((.......((((......))))))))).......((((((.....))))))..........)))..))))).))))..))..((((...(((...((((((....))))))....))).))))))))))))).(((((((((.....))))))))).......)))).)))).)).....)))))).))))))..........(((((.....))))).........((((((((((.(((((((((..(((((((.(((...))))))))....))..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...)))))).))))))))))...............)))))..)))))))))(((((........)))))(((.((((((((((((...(((......)))))))))))...((((((((((((.((((..((.(((...............((((...(((((((((((((.((((......(((((......((((.(((((((..(((((........(((..((.(.((((.((..((((..(....)..))))...)))))).)..))...)))........)))))))).))))))))..))))).......))).....).)))).)))))))))..))))...............))).))....)))).)))))))).))))..........)))).)))...............((((((......)))).)).))))))))..)).)).))))))......)))..........(((......)))......))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.{(((((((((((...(((.{,,|||...,,,,.{(((.((((((........)))))).)))}...........||.......,,,,|||||,,,},}}}||,.(((((((((((({.((....{,....,,......)}.}}}},.{{{,(((((((((..(((((...,,{{,..{{,....,,}....,,}|||(({.....,,,...((((((.(((((|.,|||.....((((((..(((......,,....,.)))..)))))).....{{{({{(.{{{.{{{{.,{{{..(((.....))).}}}}}}|{,.}||.,,}}|(((({...)))))),|,,,{{.{{((((((..((((((((({{(..((({.(((((.,({{.,({{{{,,|{{,{{,...,.}}}},}}}}.},)}),.|||{|.||.((((((.....)))))).......}}.)))}}))))),))))..)}..{{{(,,.{{{...(((({,....}))))}....}}),}}})))))))))).(((((((((.....))))))))).,.....}))).)))}.}}..,}})))))).)))))}..........(((((.....))))).........((((((((((.{((((((((..{,(((((.(((...))))))))....,,..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...))))}}.))))))))))...............)))))..))))))))),,|||}{{{{{{{,,,,)))}})}).|)))))))}....}))))))).}((((.|{.{{{((((((((((((.((((..{{{((({...........,,.||||},.((((((((({{{(,{{{{,.....{((((......(((,,(((({((..(((((.{{|...|{{,..{{.{.((((,{,..|{{{..{,...),.}}}}..}}}}))).},,}},.,)))..,}}...))))))))}))))))))..))))}....,|.}},.....}.)))).)))))))))..},||{{{............,,)}))}...)))).)))))))).}}},..........((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....))))...,,....))).)))).........(((......)))..,,,,}})..)).))))
Back