Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0005400
Sequence Length
1370 nt
GC Content
0.4642
AUCUUGAGCCAGAUGAUUGUGCAUCCAUUUACAUCUUUAAUGUAGAUCCACCUCCAUCUACUUUAACCACACCACUUUGCUUACCACAUCAUGGAUUACCGUCUCACUCUUCUGUUUUGUCACCAUCGUUUCAGCUCCAAAGUCACAAAAACUAUGAAGGAACUUGUGAGAUUCCUGAAUCUAAAUAUAGCCCAUUAGGUGGUCCCAAACCCUUUGAGUGCCCAAGUAUUCAAAUUACAUCUAUCUCUCCUAACUGUCAUCAAGAAUUAGAUGCACAUGAAGAUGACCUACAGAUAAAUGACCCAGAACGGGAAUUUUUGGAAAGGCCUUCUAGAGAUCAUCUCUAUCUUCCUCUUGAGCCAUCCUACCGGGAGUCUUCUCUUAGUCCUAGUCCUGCCAGCAGCAUCUCUUCUAGGAGUUGGUUCUCUGAUGCAUCUUCUUGUGAAUCGCUUUCACAUAUUUAUGAUGAUGUGGACUCAGAGUUGAAUGAAGCUGCAGCCCGAUUUACCCUUGGAUCCCCUCUGACUUCUCCUGGUGGCUCUCCAGGGGGCUGCCCUGGAGAAGAAACUUGGCAUCAACAGUAUGGACUUGGACACUCAUUAUCACCCAGGCAAUCUCCUUGCCACUCUCCUAGAUCCAGUGUCACUGAUGAGAAUUGGCUGAGCCCCAGGCCAGCCUCAGGACCCUCAUCAAGGCCCACAUCCCCCUGUGGGAAACGGAGGCACUCCAGUGCUGAAGUUUGUUAUGCUGGGUCCCUUUCACCCCAUCACUCACCUGUUCCUUCACCUGGUCACUCCCCCAGGGGAAGUGUGACAGAAGAUACGUGGCUCAAUGCUUCUGUCCAUGGUGGGUCAGGCCUUGGCCCUGCAGUUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAGGUAGCCGAGGGGCAGUAAAAGCAUCUACUGGGGGACAUCCUGUUGUGAAGGAAUCCAAGAUACGUUCAUCUUUUGAUGUCGUCUUUGAUGCACAGCUUCUACUGUCCAUGGGAAAGAAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-377.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -402.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((.(((((((.....(((.............((((.((((((........)))))).))))...........)))......)))).))).)))..))((...((((((........(((.((((((((((((.............(((((((((((((..(((((...(((((..(((....)))....))))).(((.....)))...((((((.((((((..........((((((..(((..............)))..)))))).....(((((((................(((.....))).((((((((((.....))))))))))......)))))))((.((((((((..(((((((((.((..((((.(((((..(((.........(((((.......((((......))))))))).......((((((.....))))))..........)))..))))).))))..))..((((...(((...((((((....))))))....))).))))))))))))).(((((((((.....))))))))).......)))).)))).)).....)))))).))))))..........(((((.....))))).........((((((((((.(((((((((..(((((((.(((...))))))))....))..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...)))))).))))))))))...............)))))..)))))))))..))))(((((((....))).)))).((((((((...(((......)))))))))))...((((((((((((.((((..((.(((...............((((...(((((((((((((.((((......(((((......((((.(((((((..(((((........(((..((.(.((((.((..((((..(....)..))))...)))))).)..))...)))........)))))))).))))))))..))))).......))).....).)))).)))))))))..))))...............))).))....)))).)))))))).))))..........((((.(((((((....((((..(((((((......)))).)).)..))))....)))).........))).))))..................))))......)))))).)).)))..((.(.((((((((.(((((((....(((.((((((.....(((((.(.(((...))).).))))).....)))))).)))..))).....)))).)))))))).).))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,,{{{.{{{||{{..,(((((,,.,.........{(((.((((((........)))))).)))}.......,,,,||,...{,,||||{|||,|||,,||(({{,((((({,{({{{{.((,.{,({,,,,{{,{....}}.,,,,,,||,.{|||||{{{..|||||},..,{{,..{{,....,,}.....,,))||||,......,.,{(((((({,,,,||}}}}}},...((((((..(((.......,......)))..)))))).,.,.((((({(.{,{.{{{{.,{{{..(((.....))).}}}},||{,.|||...}}{(((({...)))))),},,,|,.{{((((((.,(({{{(((({,{..{{{{.{((((,{(,,.{({,,{,,|||,{,,..,},))}},})}},}}))),.|||||,||.((((((.....)))))).......}),)))))))},}}))))..)}..{{{{,,.{{(...((((({....})))))....}}).}||}|||}|||}|,(((((((((.....))))))))),}.....||||,||||.||.,{||||||||,}}}}},..........(((((.....))))).........((((((((((.{((((((((..{,(((((.(((...))))))))....},..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...))))}}.))))))))))...............}}}}}..}}|||||||{,||{....{{((||||)}||,|||.((((((((...{({......)})))))))))}},((((((((((((.((((..,{{((({............,.||||},.(((((((((((((,{{{{......(((((......((({,(((((((..(((((.{{,...,({,..{{.{.((((,(,..{(((..{,...),.)})}..})}}))).}.,}}..,)))..,}}...))))))))}})))))))..))))}....,,.}}}.....}.)))).)))))))))..},||{{{............,,)}))}...)))).)))))))).))))..........((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....)))).........))).)))).........,{{......}}},......))),}},)}.))).|((.,.{|||{(({.,{{{{{{..,,|||,{{{{{{.....|||||,|,{{{...))}.).))))),...,)))))).)))..))))),,,}|||,|}||}|||.,.))}.)),)))))
Back