Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NFATC3_0005900

Sequence Length

1548 nt

GC Content

0.4567

AAUUAGAUGCACAUGAAGAUGACCUACAGAUAAAUGACCCAGAACGGGAAUUUUUGGAAAGGCCUUCUAGAGAUCAUCUCUAUCUUCCUCUUGAGCCAUCCUACCGGGAGUCUUCUCUUAGUCCUAGUCCUGCCAGCAGCAUCUCUUCUAGGAGUUGGUUCUCUGAUGCAUCUUCUUGUGAAUCGCUUUCACAUAUUUAUGAUGAUGUGGACUCAGAGUUGAAUGAAGCUGCAGCCCGAUUUACCCUUGGAUCCCCUCUGACUUCUCCUGGUGGCUCUCCAGGGGGCUGCCCUGGAGAAGAAACUUGGCAUCAACAGUAUGGACUUGGACACUCAUUAUCACCCAGGCAAUCUCCUUGCCACUCUCCUAGAUCCAGUGUCACUGAUGAGAAUUGGCUGAGCCCCAGGCCAGCCUCAGGACCCUCAUCAAGGCCCACAUCCCCCUGUGGGAAACGGAGGCACUCCAGUGCUGAAGUUUGUUAUGCUGGGUCCCUUUCACCCCAUCACUCACCUGUUCCUUCACCUGGUCACUCCCCCAGGGGAAGUGUGACAGAAGAUACGUGGCUCAAUGCUUCUGUCCAUGGUGGGUCAGGCCUUGGCCCUGCAGUUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAGGUAGCCGAGGGGCAGUAAAAGCAUCUACUGGGGGACAUCCUGUUGUGAAGCUCCUGGGCUAUAACGAAAAGCCAAUAAAUCUACAAAUGUUUAUUGGGACAGCAGAUGAUCGAUAUUUACGACCUCAUGCAUUUUACCAGGUGCAUCGAAUCACUGGGAAGACAGUCGCUACUGCAAGCCAAGAGAUAAUAAUUGCCAGUACAAAAGUUCUGGAAAUUCCACUUCUUCCUGAAAAUAAUAUGUCAGCCAGUAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCUCCCAGCGGUCUGCUCAAGAACUUCCUCAUAUUGAGAAGUACAGUAUCAACAGUUGUUCUGUAAAUGGAGGUCAUGAAAUGGUUGUGACUGGAUCUAAUUUUCUUCCAGAAUCCAAAAUCAUUUUUCUUGAAAAAGGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-429.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -460.76

Frequency: 0.0000

Diversity: 401.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((.(((((((..((((((((((((..(((..(((.....))).......((((.((.....((((((...))))))))))))((((((((..((((...))))((((((((..(.((((((...(((.....)))......)))))).)((((((...(((((((((...((((((.....))))))......(((((((((((..(((........)))..)))))..........(((((((.((..((((((.((.(((((((((.(((((((((.....))))))))).......(((((.(.(((((((.((..((((.(((((..........(((((.....))))).........((((((((((.(((((((((..(((((((.(((...))))))))....))..)))))))...((((((......))))))((((...(((((....)))))...)))))).))))))))))........(((((((...........((((.(((((........))))).))))((.((((((((...(((......))))))))))))))))))))...(((....))).)).)))...))))..)).)))))))...((((..(....)..))))......((((....)))).........).)))))..))))))))).))))))))(((....)))..)))))))))...))))))..((((((((((.(((((..(.(.((((.((((((((((.................)))))))((((((.(...((((......(((((..............)))))......)))).).))))))(((((.......((((.(((((((....((((..(((((((......)))).)).)..))))....)))).........))).)))).................((.((((.(((......))).))..)))))))))(((((........))))).))).)))).).)..)))))))))))))))...........(((((((((........)))))))))....(((((.(.(((.......)))).)).)))........)))))))))))))))..))))))))((..((((((((.......((((....((((.((((.((....)).)))).)))).....)))).((((..........))))..((((((..((.(((.((((((......((((....(((.((.........)))))..)))).....)))))).))).))..))))))((((...(((((((((.......))))...((((......))))..)))))....)))))))).))))..))....((((((........))))))...))))))))(((((.(((...))))))))............)))..)))))......))))))).......)))))..)).))))))))((..(((((((.............)))).......)))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((.({(({,,..(((((((.((,,.,{{{..(((.....))).}|||,,(({{,{{...,.((((({...))))))}}}}}}((((((((..{((,...|}||((({((((..{,(((({(..,(((,,.,,|}},,,,..}}}}||{|({{{({,,,(((((((({...((((((.....)))))).......||||||{{((,,((({,,{,...,},.,|}||},.,,{{{...(((((((.((..((((((.((.(((((((((.(((((((((.....))))))))).,.....((({{.,..,{(({{,(,{{(((({(((............(((((.....))))).........|||..}}}}}}.{(((((((..{{(((((.(((...))))))))....,,..))))))).,.((((((......))))))...,{{{({,,||||{((((((((({..,...(((.((((({{{...,.(((((((.......,...((((.(((((........))))).)))){{.((((((((...{({......}}))))))))))}})))))),.}))....))))).)))........)))))))))))}|,..((({..{....,.,))))....},{||,...}))})}.....}},}.}})))..))))))))).),))))))(((....)))..)})))))))...,,,}}...((((((((((.((((({{({,.((((.(({{(((({{....|,,,......|,,|}}}}},((((({.,.,,({{|,,,,..(((((..............)))))......}}),.)})))))}(((((.......((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....)))).........})).)))).{{{{.....((,{.,,.|,,..,.|,}}}}...}},}))}.||,.)))))(((((........)))))}))).)))),)})..)))))))))))))))...........(((((((((........)))))))))....((({{.(.(((.......))).,}},)))..,.....)))))))))))}))}}|))}}}}}}((..((((((((,.,..,,((({....{((,.((((.((....)).)))).,)))....,})}}.{{{{........,.}}}|,,{(((({,,{{,((|.|{{{{{..,...{|||,,,.|||,||.......}}}},,,..))))...,,)})))),))),}}..}}})))||{|...{||{(((((.......)))),..((((......))))..,}))).,..))}))))).))))..)}....{{{{{|,|.,,,,.)}))))...))))))))(((({{(({...}))))))),,,{...,.{,,,,,}.,))))...,}.}))))))...|||,||}}|.,||,|}}}}}}}{{..|||}|..,,.,,||,,,,}}))||,|.....))),,))