Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0006100
Sequence Length
2843 nt
GC Content
0.4583
AAUUAGAUGCACAUGAAGAUGACCUACAGAUAAAUGACCCAGAACGGGAAUUUUUGGAAAGGCCUUCUAGAGAUCAUCUCUAUCUUCCUCUUGAGCCAUCCUACCGGGAGUCUUCUCUUAGUCCUAGUCCUGCCAGCAGCAUCUCUUCUAGGAGUUGGUUCUCUGAUGCAUCUUCUUGUGAAUCGCUUUCACAUAUUUAUGAUGAUGUGGACUCAGAGUUGAAUGAAGCUGCAGCCCGAUUUACCCUUGGAUCCCCUCUGACUUCUCCUGGUGGCUCUCCAGGGGGCUGCCCUGGAGAAGAAACUUGGCAUCAACAGUAUGGACUUGGACACUCAUUAUCACCCAGGCAAUCUCCUUGCCACUCUCCUAGAUCCAGUGUCACUGAUGAGAAUUGGCUGAGCCCCAGGCCAGCCUCAGGACCCUCAUCAAGGCCCACAUCCCCCUGUGGGAAACGGAGGCACUCCAGUGCUGAAGUUUGUUAUGCUGGGUCCCUUUCACCCCAUCACUCACCUGUUCCUUCACCUGGUCACUCCCCCAGGGGAAGUGUGACAGAAGAUACGUGGCUCAAUGCUUCUGUCCAUGGUGGGUCAGGCCUUGGCCCUGCAGUUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAGGUAGCCGAGGGGCAGUAAAAGCAUCUACUGGGGGACAUCCUGUUGUGAAGCUCCUGGGCUAUAACGAAAAGCCAAUAAAUCUACAAAUGUUUAUUGGGACAGCAGAUGAUCGAUAUUUACGACCUCAUGCAUUUUACCAGGUGCAUCGAAUCACUGGGAAGACAGUCGCUACUGCAAGCCAAGAGAUAAUAAUUGCCAGUACAAAAGUUCUGGAAAUUCCACUUCUUCCUGAAAAUAAUAUGUCAGCCAGUAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCUCCCAGCGGUCUGCUCAAGAACUUCCUCAUAUUGAGAAGUACAGUAUCAACAGUUGUUCUGUAAAUGGAGGUCAUGAAAUGGUUGUGACUGGAUCUAAUUUUCUUCCAGAAUCCAAAAUCAUUUUUCUUGAAAAAGGACAAGAUGGACGACCUCAGUGGGAGGUAGAAGGGAAGAUAAUCAGGGAAAAAUGUCAAGGGGCUCACAUUGUCCUUGAAGUUCCUCCAUAUCAUAACCCAGCAGUUACAGCUGCAGUGCAGGUGCACUUUUAUCUUUGCAAUGGCAAGAGGAAAAAAAGCCAGUCUCAACGUUUUACUUAUACACCAGUUUUGAUGAAGCAAGAACACAGAGAAGAGAUUGAUUUGUCUUCAGUUCCAUCUUUGCCUGUGCCUCAUCCUGCUCAGACCCAGAGGCCUUCCUCUGAUUCAGGGUGUUCACAUGACAGUGUACUGUCAGGACAGAGAAGUUUGAUUUGCUCCAUCCCACAAACAUAUGCAUCCAUGGUGACCUCAUCCCAUCUGCCACAGUUGCAGUGUAGAGAUGAGAGUGUUAGUAAAGAACAGCAUAUGAUUCCUUCUCCAAUUGUACACCAGCCUUUUCAAGUCACACCAACACCUCCUGUGGGGUCUUCCUAUCAGCCUAUGCAAACUAAUGUUGUGUACAAUGGACCAACUUGUCUUCCUAUUAAUGCUGCCUCUAGUCAAGAAUUUGAUUCAGUUUUGUUUCAGCAGGAUGCAACUCUUUCUGGUUUAGUGAAUCUUGGCUGUCAACCACUGUCAUCCAUACCAUUUCAUUCUUCAAAUUCAGGCUCAACAGGACAUCUCUUAGCCCAUACACCUCAUUCUGUGCAUACCCUGCCUCAUCUGCAAUCAAUGGGAUAUCAUUGUUCAAAUACAGGACAAAGAUCUCUUUCUUCUCCAGUGGCUGACCAGAUUACAGGUCAGCCUUCGUCUCAGUUACAACCUAUUACAUAUGGUCCUUCACAUUCAGGGUCUGCUACAACAGCUUCCCCAGCAGCUUCUCAUCCCUUGGCUAGUUCACCGCUUUCUGGGCCACCAUCUCCUCAGCUUCAGCCUAUGCCUUACCAAUCUCCUAGCUCAGGAACUGCCUCAUCACCGUCUCCAGCCACCAGAAUGCAUUCUGGACAGCACUCAACUCAAGCACAAAGUACGGGCCAGGGGGGUCUUUCUGCACCUUCAUCCUUAAUAUGUCACAGUUUGUGUGAUCCAGCGUCAUUUCCACCUGAUGGGGCAACUGUGAGCAUUAAACCUGAACCAGAAGAUCGAGAGCCUAACUUUGCAACCAUUGGUCUGCAGGACAUCACUUUAGAUGAUGACCAAUUUAUAUCUGACUUGGAACACCAGCCAUCAGGUUCAGCAGAGAAAUGGCCUAACCACAGUGUGCUCUCAUGUCCAGCUCCUUUCUGGAGAAUCUAGAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-795.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -851.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 808.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((((.....((.(((((.((..(((........((((((.......))))))........)))..)).)))))))))))))(((((.((....(((....((((((...(((((((.....((.(((....))).)).....)))))))((((((((((((((((((.((.((((((.....)))))).......)).))))))...)))))(((((((((((.(((((..............((((((((.(((.(((((((.(((((((((....)))))))))..)))))))...(((((((((...(((((((.((((((((((............(((((.....)))))..............))))))..(((((((..(((((((.(((...))))))))....))..)))))))...((((((......))))))...((((((...((((((((((((((......(((.((((((((.....(((((((...........((((.(((((........))))).))))((.((((((((...(((......))))))))))))))))))))..)))....))))).)))........)))))))))))((...((((..(....)..))))...))..)))...)))))).....))))...))))))).............((((...)))).)))).)))))((.(.....).)).(((((((((((.......((((.(((((((((((((.................))))))).(((((((((((((((.....(((((..............)))))...(((.....))).................((((.(((((((....((((..(((((((......)))).)).)..))))....)))).........))).)))).........(((......)))........)))))))).(.(((((((((((......((((.....((((((((....((((((((.((.((((((((((((........(((((((((........)))))))))(((.(.(((((((((.......)))..((((((((((....)))))))).))...((((((((((.((..((((((((.......((((....((((.((((.((....)).)))).)))).....)))).((((..........))))..((((((..((.(((.((((((......((((....(((.((.........)))))..)))).....)))))).))).))..))))))((((...(((((((((.......))))...((((......))))..)))))....)))))))).))))..))...((((((((.(((...(((.(((.(((.((.(((((((.(((...)))))))).........((((.....))))...((((((..((((((((((.....(((((...........)))))..(((....(((.......)))....)))....(((((.(((...((((((((((((..(((((((((.(((((((..(((((..........))))).)))))))((((..(((((..((((((...(((((....)))))(((((....)))))......((((((..(((...(((((....(((.((((..(((.((((.................(((((.(((......((((((.(.((((((.......)))))).).))))))....))).)))))..((((.((..((((((....))))))..)).))))((((...((((((....)))))))))).)))).))).)))).)))..((((((((..(((((((.((..((.((((((((((...(((((.((.......)))))))))))))...)))).))..))...)))))))..............(((((..............)).)))...........)))))))).)))))....)))..)))))).....))))))....)))))..))))))))))))).......)))))))(((((((((..((((.((((....(((.((......)).))).....)))).))))....)))))))))....)))))))).)))))))))))))))))))))......((((....((((....))))))))............)))).))).))))))........))).))))))))..(((.((((((.......)))))).))).....))))).)))))((((((((........)))))))).))))))).))).............)))))))).........)))).))..)))))))).))))))))..))))....))))))))))).)))))))).....)))))).))))((((.((((.........................)))).))))..............)))))).((..((((((....))))))...)).....................))))))))))))))))..))))).))))))..)))))(((((((((((.((.(.(((.((.((.......))))))).).)))))))))).))).......)))))))..(((.((((((...(((.((...(((((..(((((.((.(((((.......))))).)).......((((((.((((....))))...))))))...)))))..)))))......)).)))..))))))..)))..))))))....)))...)).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,..((({{.,,,,({((({{,{{{.,,,...,,{..(((.....))).}}}},|{{,.{{{,,.}}|{{|{{.,,)))))),,}}{(({{.(({{{.{{{....||{{({{.,|{{{.{{{,,,,({{{(({.,,.{}||,,,....,|||||{{(({{((({{{,{{(((,{{.((((((.....)))))}.......}}.)))))},..||||}|,,{.((((((.(((((...(((,..(((((((.,((,((((((.((.(((((((((,(((((((((.....))))))))).,.....(((({.{..,((({({(,{{(((({(((............(((((.....))))).........|||..})}))).{(((((((..{{(((((.(((...))))))))....,,..))))))).,.((((((......))))))...,{{{({,,||||{((((((((({..,...(((.((((({{{...,.(((((((.......,...((((.(((((........))))).)))){{.((((((((...{({......}}))))))))))}})))))),.}))....))))).)))........)))))))))))}|,..((({..{....,.,))))...,},{||,...}))})}.....}},}.}}))),,))))))))).},)))))){(({{{,,||,{||,,,||||,{{,..,,.||,{{{{{((((((......{((((.(((((({((((({....|,........,,.})))))}.(((((((((((((((.....(((((..............)))))...(({.....)))...,,,..,,,,.,,,.((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....))))..,},,..,))}.)))}.........(((......)))........)))))))).(.(((((((((((..{...((((.....((((((((.,{{(((,(((({((..((((((((,{,.,......(((((((((........))))))))){{{.(,(((((((((.......))}..{{(((((((,....}))))))).}}..,((((((((((.((..((({((((,.,,,{{(({,....{({,.((((.((....)}.))))..}}}.,..,||||.{(({.......,,,||||..{(((((,,(({(({.({{,,,......||{|,,,,|||.||.......,|||,,,..))))...,,)))))}||)|,}}..||||},.(((.,,(({((({((....,,,||||,..((((......))))...,||||||,}}|})})).}}}}..||,,.{(((((({.{({...||{,{{(.(((.{.|{{(((({{(({...}))))))}{{{{...,,{,,,.,}..))))..,||(((|,.{((((((((({{,({(((((...........)))))..}}}}..,}}}}|,|{{{{|...})))}},,|(((((.(({..(((((((((((((,,((((((((({...((((,.,,{.((((((({(.......)))))))).,))}})|,.,..,....,...(((((....)))))(((((....))))).....,,{(((,..,||}}|(((({...{{({..,{,...,,|||||,......,....||...{{||||||{,,..{{(((,(,,({(((,((.,{{...,))),)},,))))),})}})),.,|{{{{{{,,,.((..((((((....))))))..))}))))}..,...((((((....))))))||{|,{{|,,||,...})),))},.}}}......(((((((.((..((.((((((((((...(((((,{{....,,,)}))})})))))).,.)))).))..))...))))))).,},},,.|{{,,{{({{{{,.,{{.,,.....|..........||,,,,}}))}|}},.})),,,,.|{....)}.,,,....))))))))))))))),,,,.)))))))))).,,....))))))){(((((({{..{|||,{(({....{{|,{{|.|,||,}.}}},....)))).}}),,,,.)))))))))....)))))))).)))}}}))))))))},}}}},......((((.,,.(((,...,)}))))))............}})).))).}})}))........))}.)))))))},.{{(.((((((.......)))))).))}.....))))).)))))((((((((........)))))))).))))))}.))}....,,,......,},))},)}}}}}}..)))))},,{{|,,,,})),)))))))).,)))).,..))))))))))).)))))))).....)))))).))))|{({.{(({...,.....|..........,,.,,}))).))))..,.,,,.......)))))).({..((((({....})))))...))...........}},,,.....,))))))))))))))...))))).))))))..,,,,.{{((((((({{{((.(.(({,((.((.......))))))).).)))))))))).))),,,..|||,.,))),,|||.((((({,..{{{.{{...(((((..(((((.((.(((({,....}.})))).)).......{{((((.{(((....}}}},,.)))))),,,)))))..)))))..,...)).))),.)))))),.,}}}}}))}}}....))),..)),)))))
Back