Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0006800
Sequence Length
2133 nt
GC Content
0.4416
UUUUUCCAUUUCAGUACUGUGUAGAGACUGACAUCCCUCUCAAAACAAGGAAAACUUCUGAAGAUCAAGCUGCCAUACUACCAGGAAAAUUAGAGCUGUGUUCAGAUGACCAAGGGAGUUUAUCACCAGCCCGGGAGACUUCAAUAGAUGAUGGCCUUGGAUCUCAGUAUCCUUUAAAGAAAGAUUCAUGUGGUGAUCAGUUUCUUUCAGUUCCUUCACCCUUUACCUGGAGCAAACCAAAGCCUGGCCACACCCCUAUAUUUCGCACAUCUUCAUUACCUCCACUAGACUGGCCUUUACCAGCUCAUUUUGGACAAUGUGAACUGAAAAUAGAAGUGCAACCUAAAACUCAUCAUCGAGCCCAUUAUGAAACUGAAGGUAGCCGAGGGGCAGUAAAAGCAUCUACUGGGGGACAUCCUGUUGUGAAGCUCCUGGGCUAUAACGAAAAGCCAAUAAAUCUACAAAUGUUUAUUGGGACAGCAGAUGAUCGAUAUUUACGACCUCAUGCAUUUUACCAGGUGCAUCGAAUCACUGGGAAGACAGUCGCUACUGCAAGCCAAGAGAUAAUAAUUGCCAGUACAAAAGUUCUGGAAAUUCCACUUCUUCCUGAAAAUAAUAUGUCAGCCAGUAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCUCCCAGCGGUCUGCUCAAGAACUUCCUCAUAUUGAGAAGUACAGUAUCAACAGUUGUUCUGUAAAUGGAGGUCAUGAAAUGGUUGUGACUGGAUCUAAUUUUCUUCCAGAAUCCAAAAUCAUUUUUCUUGAAAAAGGACAAGAUGGACGACCUCAGUGGGAGGUAGAAGGGAAGAUAAUCAGGGAAAAAUGUCAAGGGGCUCACAUUGUCCUUGAAGUUCCUCCAUAUCAUAACCCAGCAGUUACAGCUGCAGUGCAGGUGCACUUUUAUCUUUGCAAUGGCAAGAGGAAAAAAAGCCAGUCUCAACGUUUUACUUAUACACCAGUUUUGAUGAAGCAAGAACACAGAGAAGAGAUUGAUUUGUCUUCAGUUCCAUCUUUGCCUGUGCCUCAUCCUGCUCAGACCCAGAGGCCUUCCUCUGAUUCAGGGUGUUCACAUGACAGUGUACUGUCAGGACAGAGAAGUUUGAUUUGCUCCAUCCCACAAACAUAUGCAUCCAUGGUGACCUCAUCCCAUCUGCCACAGUUGCAGUGUAGAGAUGAGAGUGUUAGUAAAGAACAGCAUAUGAUUCCUUCUCCAAUUGUACACCAGCCUUUUCAAGUCACACCAACACCUCCUGUGGGGUCUUCCUAUCAGCCUAUGCAAACUAAUGUUGUGUACAAUGGACCAACUUGUCUUCCUAUUAAUGCUGCCUCUAGUCAAGAAUUUGAUUCAGUUUUGUUUCAGCAGGAUGCAACUCUUUCUGGUUUAGUGAAUCUUGGCUGUCAACCACUGUCAUCCAUACCAUUUCAUUCUUCAAAUUCAGGCUCAACAGGACAUCUCUUAGCCCAUACACCUCAUUCUGUGCAUACCCUGCCUCAUCUGCAAUCAAUGGGAUAUCAUUGUUCAAAUACAGGACAAAGAUCUCUUUCUUCUCCAGUGGCUGACCAGAUUACAGGUCAGCCUUCGUCUCAGUUACAACCUAUUACAUAUGGUCCUUCACAUUCAGGGUCUGCUACAACAGCUUCCCCAGCAGCUUCUCAUCCCUUGGCUAGUUCACCGCUUUCUGGGCCACCAUCUCCUCAGCUUCAGCCUAUGCCUUACCAAUCUCCUAGCUCAGGAACUGCCUCAUCACCGUCUCCAGCCACCAGAAUGCAUUCUGGACAGCACUCAACUCAAGCACAAAGUACGGGCCAGGGGGGUCUUUCUGCACCUUCAUCCUUAAUAUGUCACAGUUUGUGUGAUCCAGCGUCAUUUCCACCUGAUGGGGCAACUGUGAGCAUUAAACCUGAACCAGAAGAUCGAGAGCCUAACUUUGCAACCAUUGGUCUGCAGGACAUCACUUUAGAUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-555.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -597.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 565.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........(((((.((......)))))))..(((((.(((..............((((((.((..((((......................)))))).)))))))))...)))))........((.(((((((((((.......((((.(((((((((((((.................))))))).(((((((((((((((.....(((((..............)))))...(((.....))).................((((.(((((((....((((..(((((((......)))).)).)..))))....)))).........))).)))).........(((......)))........)))))))).(.(((((((((((......((((.....((((((((....((((((((.((.((((((((((((........(((((((((........)))))))))(((.(.(((((((((.......)))..((((((((((....)))))))).))...((((((((((.((..((((((((.......((((....((((.((((.((....)).)))).)))).....)))).((((..........))))..((((((..((.(((.((((((......((((....(((.((.........)))))..)))).....)))))).))).))..))))))((((...(((((((((.......))))...((((......))))..)))))....)))))))).))))..))...((((((((.(((...(((.(((.(((.((.(((((((.(((...)))))))).........((((.....))))...((((((..((((((((((.....(((((...........)))))..(((....(((.......)))....)))....(((((.(((...((((((((((((..(((((((((.(((((((..(((((..........))))).)))))))((((..(((((..((((((...(((((....)))))(((((....)))))......((((((..(((...(((((....(((.((((..(((.((((.................(((((.(((......((((((.(.((((((.......)))))).).))))))....))).)))))..((((.((..((((((....))))))..)).))))((((...((((((....)))))))))).)))).))).)))).)))..((((((((..(((((((.((..((.((((((((((...(((((.((.......)))))))))))))...)))).))..))...)))))))..............(((((..............)).)))...........)))))))).)))))....)))..)))))).....))))))....)))))..))))))))))))).......)))))))(((((((((..((((.((((....(((.((......)).))).....)))).))))....)))))))))....)))))))).)))))))))))))))))))))......((((....((((....))))))))............)))).))).))))))........))).))))))))..(((.((((((.......)))))).))).....))))).)))))((((((((........)))))))).))))))).))).............)))))))).........)))).))..)))))))).))))))))..))))....))))))))))).)))))))).....)))))).))))((((.((((.........................)))).))))..............)))))).((..((((((....))))))...)).....................)))))..))(((.(((((((.....((((...(((((...((((((((.((.(.(((.((.((.......))))))).).))))))))))..)))))...)))).....)))..)))).)))....((((((((...))).)))))))(((((.......)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,......(((({.{{,,,,,,|||}}||,.{((((.{,.......|,....,.((((((.({..((((......................)))))).)))))).},...,||||.....,,.||.(((((((((((......,((((.(((((({((((({....|.........,,.})))))}.(((((((((((((((.....(((((..............)))))...(({.....)))...,,,..,,,,.,,,.((((.(((((((....((((..{((((((......)))).)).,..))))....))))..,},,..,))}.)))}.........(((......)))........)))))))).(.(((((((((((..{...((((.....((((((((.,{{(((,(((({((..((((((((,{,.,......(((((((((........))))))))){{{.(,(((((((((.......))}..{{(((((((,....}))))))).}}..,((((((((((.((..((({((((,.,,,{{(({,....{({,.((((.((....)}.))))..}}}.,..,||||.{(({.......,,,||||..{(((((,,(({(({.({{,,,......||{|,,,,|||.||.......,|||,,,..))))...,,)))))}||)|,}}..||||},.(((.,,(({((({((....,,,||||,..((((......))))...,||||||,}}|})})).}}}}..||,,.{(((((({.{({...||{,{{(.(((.{.|{{(((({{(({...}))))))}{{{{...,,{,,,.,}..))))..,||(((|,.{((((((((({{,({(((((...........)))))..}}}}..,}}}}|,|{{{{|...})))}},,|(((((.(({..(((((((((((((,,((((((((({...((((,.,,{.((((((({(.......)))))))).,))}})|,.,..,....,...(((((....)))))(((((....))))).....,,{(((,..,||}}|(((({...{{({..,{,...,,|||||,......,....||...{{||||||{,,..{{(((,(,,({(((,((.,{{...,))),)},,))))),})}})),.,|{{{{{{,,,.((..((((((....))))))..))}))))}..,...((((((....))))))||{|,{{|,,||,...})),))},.}}}......(((((((.((..((.((((((((((...(((((,{{....,,,)}))})})))))).,.)))).))..))...))))))).,},},,.|{{,,{{({{{{,.,{{.,,.....|..........||,,,,}}))}|}},.})),,,,.|{....)}.,,,....))))))))))))))),,,,.)))))))))).,,....))))))){(((((({{..{|||,{(({....{{|,{{|.|,||,}.}}},....)))).}}),,,,.)))))))))....)))))))).)))}}}))))))))},}}}},......((((.,,.(((,...,)}))))))............}})).))).}})}))........))}.)))))))},.{{(.((((((.......)))))).))}.....))))).)))))((((((((........)))))))).))))))}.))}....,,,......,},))},)}}}}}}..)))))},,{{|,,,,})),)))))))).,)))).,..))))))))))).)))))))).....)))))).))))|(((.((((........,{......,........)))).)))}..............)))))).((..((((({....})))))...))...........,,.....,,.))))).,))||{|||||||||,,,.{(((...{(({,,,{((((((({{((.(.(({,((.((.......))))))).).)))))))))).}))))}...)))).,,},)}},.}|}},}},...,,{{{{{{{..,))).)))))))(((((.....,.)))))
Back