Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0009500
Sequence Length
630 nt
GC Content
0.4063
GUGCAUGCCUUCACGUCUGGCUCUACCUGUUUUUGUACAGCUUGUGAACUAGGAGUGGUUUUUAUACAUUUUUACAUGGGUGGAGAAAAAAUCAAAAGAAUACUAUUUUCUGAUGUGAAACUUAUGUGGAAUUCCAAAGUAACCAUCCAUAAUGAUUGUUUUUCAUUUAUGUAUUGACUGGUUACUUUUGUGUUACAGUGACAGAGUUGAGUAAGACAAGAGAACAUAAGUGGCACUCUCAUCACUUCACACUACCGCUCAGGGCAGUAUAAAUCACAGUGAUGCAGUUAAAACUCAAUAGUGUUUCAAGUGCCACAAGUAUUGCUGCAUUGGGACUUUAAAAAAAUAAUAAUCAGUACAUACUCAUCAUGUCAAAACAAGAAAAAGCAGAUAUCGAAUGUCAUUCUUUUGAGGCACAGUGGACUGUGUGUUAUCUUGUUAUCAAAUUAGAUAGCAAACUGGGUACCGUGGCUCACGCCUGUAAUCUCAGCACUUUGGGAAGCCAAGGCAGGUGGAUCACCUGAGGCCAGGGCAGGUGGAUCACCUGAGGCCAGAAGUUCAAGACCAGCAUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUGCAAAAAUUUAGCCGGGGAUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-169.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -180.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 131.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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