Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NFATC3_0009600

Sequence Length

373 nt

GC Content

0.4102

CUCCUGGGCUAUAACGAAAAGCCAAUAAAUCUACAAAUGUUUAUUGGGACAGCAGAUGAUCGAUAUUUACGACCUCAUGCAUUUUACCAGGUGCAUCGAAUCACUGGGAAGACAGUCGCUACUGCAAGCCAAGAGAUAAUAAUUGCCAGUACAAAAGUUCUGGAAAUUCCACUUCUUCCUGAAAAUAAUAUGUCAGCCAGUAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-79.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -85.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 95.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((..............(((((((((........)))))))))....(((((.(.(((.......)))).)).)))......))))).((((....(((.((((.....((..((((((((.......((((....((((.((((.((....)).)))).)))).....)))).((((..........))))..((((((..((.(((.((((((......((((....(((.((.........)))))..)))).....)))))).))).))..))))))((((...(((((((((.......))))...((((......))))..)))))....)))))))).))))..))...)))).))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((,,.....,......(((((((((........)))))))))....((({{.(.(((.......))).,}}.))).,,...}}))),({{{....{((,((((.....((..((((((((,....,,((({....{((,.((((.((....)).)))).,)))....,})}}.{(({........,.|}}|..((((((..((.(((.((((((......((((....{{{.{{........,}|}},..)))).....)))))).))).))..)))))).{{|,..{{|{(((((.......)))),..((((......))))..,}))).,,,)))))))).))))..)).,.)))).))))))).