Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NFATC3_0010800

Sequence Length

497 nt

GC Content

0.4185

UAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCUCCCAGCGGUCUGCUCAAGAACUUCCUCAUAUUGAGAAGUACAGUAUCAACAGUUGUUCUGUAAAUGGAGGUCAUGAAAUGGUUGUGACUGGAUCUAAUUUUCUUCCAGAAUCCAAAAUCAUUUUUCUUGAAAAAGGACAAGAUGGACGACCUCAGUGGGAGGUAGAAGGGAAGAUAAUCAGGGAAAAAUGUCAAGGGGCUCACAUUGUCCUUGAAGUUCCUCCAUAUCAUAACCCAGCAGUUACAGCUGCAGUGCAGGUGCACUUUUAUCUUUGCAAUGGCAAGAGGAAAAAAAGCCAGUCUCAACGUUUUACUUAUACACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-123.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -133.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 82.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..((.(((.((((((......((((....(((.((.........)))))..)))).....)))))).))).))..))))((((((...(((((((((.......))))...((((......))))..)))))....)))).......((((((((..((((((........))))))(((.....)))(((((.(((...)))))))).........((((.....))))..))))))))..(((((((.(((.((((((..((..((((((((.............((((((((((.....)))).))))))....(((((.....)))))....(((..((((....(((((.....(((((((.(.......))))))))..)))))...))))....))).(((((....)))))(((((....))))).......((((....))))))))))))..)))))))).))))))))))..........))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((..((.(((.{(((((......((((....(((.({.........}}))}..)))).....)))))}.))).))..))))((((((...(((((((((.......)))),..((((......))))..}))))....)))),......((((((((..((((((.,....,.)))))){((.....))}(((({{(({...}))))))),{{{.,.,,{,,,.,}..))))..))))))))..{(((((,{(((.((((((..,,..((((((((.....,,,....{({(({(((((....,)))).))))))},..(((((.....)))))....(((..((((....(((({.....(((((((((.......))))))))..)))))...))))....))).(((((....)))))(((((....))))).......((((....))))))))))))..,,)))))).)))))))))}..........))