Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NFATC3_0010900

Sequence Length

1505 nt

GC Content

0.4472

UAUUGAUUGUGCAGGUAUUUUGAAACUCCGCAAUUCAGAUAUAGAACUUCGAAAAGGAGAAACUGAUAUUGGCAGAAAGAAUACUAGAGUACGACUUGUGUUUCGUGUACACAUCCCACAGCCCAGUGGAAAAGUCCUUUCUCUGCAGAUAGCCUCUAUACCCGUUGAGUGCUCCCAGCGGUCUGCUCAAGAACUUCCUCAUAUUGAGAAGUACAGUAUCAACAGUUGUUCUGUAAAUGGAGGUCAUGAAAUGGUUGUGACUGGAUCUAAUUUUCUUCCAGAAUCCAAAAUCAUUUUUCUUGAAAAAGGACAAGAUGGACGACCUCAGUGGGAGGUAGAAGGGAAGAUAAUCAGGGAAAAAUGUCAAGGGGCUCACAUUGUCCUUGAAGUUCCUCCAUAUCAUAACCCAGCAGUUACAGCUGCAGUGCAGGUGCACUUUUAUCUUUGCAAUGGCAAGAGGAAAAAAAGCCAGUCUCAACGUUUUACUUAUACACCAGUUUUGAUGAAGCAAGAACACAGAGAAGAGAUUGAUUUGUCUUCAGUUCCAUCUUUGCCUGUGCCUCAUCCUGCUCAGACCCAGAGGCCUUCCUCUGAUUCAGGGUGUUCACAUGACAGUGUACUGUCAGGACAGAGAAGUUUGAUUUGCUCCAUCCCACAAACAUAUGCAUCCAUGGUGACCUCAUCCCAUCUGCCACAGUUGCAGUGUAGAGAUGAGAGUGUUAGUAAAGAACAGCAUAUGAUUCCUUCUCCAAUUGUACACCAGCCUUUUCAAGUCACACCAACACCUCCUGUGGGGUCUUCCUAUCAGCCUAUGCAAACUAAUGUUGUGUACAAUGGACCAACUUGUCUUCCUAUUAAUGCUGCCUCUAGUCAAGAAUUUGAUUCAGUUUUGUUUCAGCAGGAUGCAACUCUUUCUGGUUUAGUGAAUCUUGGCUGUCAACCACUGUCAUCCAUACCAUUUCAUUCUUCAAAUUCAGGCUCAACAGGACAUCUCUUAGCCCAUACACCUCAUUCUGUGCAUACCCUGCCUCAUCUGCAAUCAAUGGGAUAUCAUUGUUCAAAUACAGGACAAAGAUCUCUUUCUUCUCCAGUGGCUGACCAGAUUACAGGUCAGCCUUCGUCUCAGUUACAACCUAUUACAUAUGGUCCUUCACAUUCAGGGUCUGCUACAACAGCUUCCCCAGCAGCUUCUCAUCCCUUGGCUAGUUCACCGCUUUCUGGGCCACCAUCUCCUCAGCUUCAGCCUAUGCCUUACCAAUCUCCUAGCUCAGGAACUGCCUCAUCACCGUCUCCAGCCACCAGAAUGCAUUCUGGACAGCACUCAACUCAAGCACAAAGUACGGGCCAGGGGGGUCUUUCUGCACCUUCAUCCUUAAUAUGUCACAGUUUGUGUGAUCCAGCGUCAUUUCCACCUGAUGGGGCAACUGUGAGCAUUAAACCUGAACCAGAAGAUCGAGAGCCUAACUUUGCAACCAUUGGUCUGCAGGACAUCACUUUAGAUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-391.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -419.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 412.14

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..((.(((.((((((......((((....(((.((.........)))))..)))).....)))))).))).))..))))(............(((((.......)))))(((..(((.(((((((.(((((...(((((((((((.(((((((...(((((((((((((...((((((........(((((.((......((((((((.........((((.....))))...(((((((((((.(((((((((((((((((.........(((.((((.............)))).))).(((((..((((((..((...(((((((((((((..(((((((((.(((((((..(((((..........))))).)))))))((((..(((((..((((((...(((((....)))))(((((....)))))......((((((..(((...(((((....(((.((((..(((.((((.................(((((.(((......((((((.(.((((((.......)))))).).))))))....))).)))))..((((.((..((((((....))))))..)).))))((((...((((((....)))))))))).)))).))).)))).)))..((((((((..(((((((.((..((.((((((((((...(((((.((.......)))))))))))))...)))).))..))...)))))))..............(((((..............)).)))...........)))))))).)))))....)))..)))))).....))))))....)))))..))))))))))))).......)))))))(((((((((..((((.((((....(((.((......)).))).....)))).))))....)))))))))....))))))...))....))))))..)))))........((((....((((....)))))))).......((((((...((((..............))))...)))))).......(((......)))(((..((((......)))).)))...((((((((........))))))))...))).))))))))))).)))...))))).))))))......(((...(((.....)))...)))....))))))))......))..)))))))))))...(((....)))..((((.((((.........................)))).)))).(((...(......)....)))...((((((....))))))..))))))))...............)))))....))))).)).))))))..((((...(((((...((((((((.((.(.(((.((.((.......))))))).).))))))))))..)))))...))))..........)))))....)))))....))))))).)))..)))((((......))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,{{..(({(((.((((((,,....((((....{(({(,.......{{||,,,..))))...}}))}}}},)}),}},}))))|,...||}}||,.{((((.......))))},((..(((.(((((((.{((((...{((((((((((.(((((((...(((((((((((((..,((((((........(((((.((......((((((((,{,{....,{{,{.,,..))))...(((((((((((.(((((((((((((((({......,,,,,,.|||{.............}|||{|},.,|{{{.,{{(((((.((,..{((((((((((((..((((((((({...((((..,{{.((((((({(.......)))))))).}))}})|,.,.......,...(((((....)))))(((((....)))))......,((((,..,||}}|{({{{...,{({..,{,...,,|||||,......,....||...{{||||||{,,..{{(((,(,,({(((,((.,{{...,))),)},,))))),}}}})),.,|{||{{{,,,.((..((((((....))))))..})}))))},.,...((((((....))))))||{|,{{|,,||,...}))}))},.}}}......(((((((.((..((.((((((((((...(((((,{{....,,,)}))})})))))),,.)))).))..))...))))))).,,,,,..{((,,(((((((,.{{{.,,.....|..........,,....}}})|||,..,))}....||...,)}.,,.....))))))))))))))).....)))))))))).......)))))))(((((((((..{{((.((((....({,,({{,,,|,}},}}}.....)))).}})},,,,)))))))))....))))))}}.)))},.,,,,}}..,,,,,........((((....(((,...,)})))))).......,,{{{{..,||{{.....,,.......})))...}))))}..,{{.{((({{.......|||}}|,||,.....}))}.}}).,.((((((((........))))))))...})).))))))))))).}))...))))).))))))......(((...(((.....)))...)))....))))))))......))..))))))))))}...{{(|...,}}..((((.((((...,....,,......,........)))).)))).,{{..........,....,,}...((((({....})))))..))))))))},....,,.....},,})))....))))).)).)))))}..{((,...{{{,.,{{(((((({{{((.(.((,,((.((.......))))))).).)))))))))).}))}},...}}},..,},,,...)))))....)))))....))))))).)))..)))((((,.....)}))}})