Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0011400
Sequence Length
1419 nt
GC Content
0.4581
GUGAUCCACCCGCGUUGGCCUCCCAAGUGCAGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCGCCCGGCCAAACACAUGUAUUCUUUUUUUCAGGUGAGGGGGUUGGGUGUUUUUUGAGACGGAGUCUCACUCUCUUGCCCAGGCUGGAAUGUGGUGGCGCAAUCUCAACUCACUGCAUCCUCCACCUCCAGAGUUUAAGCGAUUUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCCGGGGCUACAGGGGCAUGCCACCAUACCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGAGGUUUCACCAUGUUGGCCAUGCUGGUCUCGAAAUUCUGACUUGAAGUGAUCUGCCCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCACCCAGCUUGUAUUCUUUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUUUUUAGACGGAGCCUCCCUCUUUCAUCCAGGCUCGAGUGCAAUGGCACGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAUGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGUCUCCUGAGUAGCUGAGAUUAUAGGCGUGUGCCACCACACCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUAUUCACCAGGCUAGUCUCGAACUCCUGACCUCGUGAUCUGCCCACCUUGCCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCACCCAGCCCUGUAUUCUUAAUUUGGGGCCACAUCUGCUAUAAAAUCUUUCAUGCCUUCUUUUGCUGUUCGCUGAAUUGGAGUGAUACUUUAUCAUUUGCCAGUUGACUCUGGGAAUCACUGAGUAAAUCUGUGGUGAAUUAGCUGUAGAACUAAUUUUUGUAUUUUUAAAAUUUAAAAAAUAUAUUCUUUGUAUAGAUAGGGUCUCACUGUGUUUCUCAAGCUGGUCUCGAACUCCUGGGCACAAGUGAUCCUCCCAUCUCAGCCUCCCAAAGUUCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCUACCACAUUCAGCCUAUAUUAACUUUUUAAUGGGUAAUAUAGGUAUAUGCUACAAAAUUCAGAAAUAUAGAGUACAAGAUAAAUUUCCAAGUCAACCAGUUCUCUUGCUUAGAAACAGCUACCAUUGCCAGCUUCUUAAUUAUCCUGCCAGAGGGUUCUAUGCCCAGGUAAGCAUAGAUCACUCUAUUUUAAAGUAAAGUUAUUAAUUCAUUUAUUUGAGCAGGGUCUCACUCUUUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCAUGAUCUUGGUUCACUGCAGCCUCCGCCUCCCAGGCUUAAGCAAUCCUCCCACCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCACAAGCCACCACAACUGACUGAUUUUUGCAUUUUUCCCCAUGUUGCCCAGGUUGAUCUUGAACUCCUGGACUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-392.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -418.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 335.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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