Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0011500
Sequence Length
1644 nt
GC Content
0.4519
GUGAUCCACCCGCGUUGGCCUCCCAAGUGCAGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCGCCCGGCCAAACACAUGUAUUCUUUUUUUCAGGUGAGGGGGUUGGGUGUUUUUUGAGACGGAGUCUCACUCUCUUGCCCAGGCUGGAAUGUGGUGGCGCAAUCUCAACUCACUGCAUCCUCCACCUCCAGAGUUUAAGCGAUUUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCCGGGGCUACAGGGGCAUGCCACCAUACCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGAGGUUUCACCAUGUUGGCCAUGCUGGUCUCGAAAUUCUGACUUGAAGUGAUCUGCCCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCACCCAGCUUGUAUUCUUUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUAUUUUUUAGACGGAGCCUCCCUCUUUCAUCCAGGCUCGAGUGCAAUGGCACGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAUGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGUCUCCUGAGUAGCUGAGAUUAUAGGCGUGUGCCACCACACCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUAUUCACCAGGCUAGUCUCGAACUCCUGACCUCGUGAUCUGCCCACCUUGCCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCACCCAGCCCUGUAUUCUUAAUUUGGGGCCACAUCUGCUAUAAAAUCUUUCAUGCCUUCUUUUGCUGUUCGCUGAAUUGGAGUGAUACUUUAUCAUUUGCCAGUUGACUCUGGGAAUCACUGAGUAAAUCUGUGGUGAAUUAGCUGUAGAACUAAUUUUUGUAUUUUUAAAAUUUAAAAAAUAUAUUCUUUGUAUAGAUAGGGUCUCACUGUGUUUCUCAAGCUGGUCUCGAACUCCUGGGCACAAGUGAUCCUCCCAUCUCAGCCUCCCAAAGUUCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCUACCACAUUCAGCCUAUAUUAACUUUUUAAUGGGUAAUAUAGGUAUAUGCUACAAAAUUCAGAAAUAUAGAGUACAAGAUAAAUUUCCAAGUCAACCAGUUCUCUUGCUUAGAAACAGCUACCAUUGCCAGCUUCUUAAUUAUCCUGCCAGAGGGUUCUAUGCCCAGGUAAGCAUAGAUCACUCUAUUUUAAAGUAAAGUUAUUAAUUCAUUUAUUUGAGCAGGGUCUCACUCUUUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCAUGAUCUUGGUUCACUGCAGCCUCCGCCUCCCAGGCUUAAGCAAUCCUCCCACCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCACAAGCCACCACAACUGACUGAUUUUUGCAUUUUUCCCCAUGUUGCCCAGGUUGAUCUUGAACUCCUGGACUUAAGUGAUCUGCCCACCUUGGCCUCUCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCUUGAGCCACCAUGCUCGGCUGGCAAAGUAAUUUAAAUAAUUUAAGUUCAUAGAGUAGUUUGAGUGUUUGAGAUGAAGUUACGCUAAAAUGAUUCUUAAUUUUUUUUCUUUUUUUAAAAAUAAAAUUGGCCAGGCGCCGUGGCUCAUAACUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-505.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -536.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 444.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(.((.((((((((((((((((.((((((((((..(((((((((.(((((.((((((....................(((((.((((((..((((....((((((..(.(((((((..(((.((....)).)))..)))).))).)..))))))..))))..)))))))))))((((((((((((..............(((((....)))))(((((.((((.(((((((.((((...(((((((((((((...........))))).(((((.((......(((...))).....)).)))))....(((......)))(((.......)))((((((((.....)).))))))....)))))))).((((.((((((.((((((........((.((.((.((....)).)).)).)).......((.((((.....)))).))...)))))).).))))).))))...((((((((((...(((((((......(((((....((((...((((..(((((((....)))))..)).)))).....((.(((((....))))))).(((((...........))))).((((.((((..((((........(((((..(((.((((......((((..(((((((...(((.(((......))).)))...)))))))((((((((((....)).....((((((.(((...))).))))))....................)))))))).............((((((.((.(((((.((((((((...(.((((......)))).)(((((.((.....)).)))))(((((((........))))))).(((((((((........)))))))))...........)))))))).))))).)).)))...))).))))))))))))))))......))))..).))).))))....(((((......))))).(((((((.((((........)))))))))))...))))....)))))......))))...)))...................)))).))))))........((((((..(((((...((((((((....((((.........))))........((((((((((((...(((((((........)))))))...))))......(((((((............)))))))).)))))))...............((((((.((((.(((.(........).))))))).))))))..((((...)))))))))))).........((((((..(....)..))))))......(((....))).....)))))..))))))..))))....)))).))).)))).)))))..)))))))).))))......(((((((...(((.(((......))).)))...)))))))..((((..((((((......)).)))).))))((((((((...))))))))...(((((.((((.(((((.............))))).)))).)))))..((((((...........))))))....)))))).))))).)))))))))..)))))))))).)))).)))))))))))).)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...)))(.((.((((((((((((((((.((((((((((.,(((((((((.(((((.((((((.....,{{{{{{{...,{{{{((((.((((((..((((....((((((..(.(((((((..(((.((....)).)))..)))).))).)..))))))..))))..))))))))))}(((((((({{((,{{.......,,{,(((((....))))){{|{{,{({{.{{{((((,{,(({{.,,..,,||||,,,.,,,,{,{{{{{,||{{(((((,{({,...,|{{,|.}}}.,},,})})))}},...|||||,.,{|||(((.......}}}{{{{{{{(,,,,.}}.}})))),...{{((((((.((((.((((({,((((((.........,..,.,,.,,..,.,,.,,.,,.........,((.((({....,}))).}}...)))))).).))))).)))).......(((((((({(.((((.({..(((.,,,......|||{.{((({{({(((((....)))))}}),.))))}},,.((.(((((....))))))).(((((...........))))).)))..)))))}.}}..........((((..(((.....))))))).(((.(((((((...(((.(((......))).)))...)))))))))).)))))))}..},.....((((({.{,,...,}}.})))))}}}})))),,,.........{{{{(({{......,,...,,{{{{(,,((((((((((...))))))},.||||,,,,,,)))).}(((((.((,....}}.})))}(((((((.,......)))))}}.(((((((((........))))))))).{{{......})}.,(((..(((((((({,.{{{,,(..(,.......)..})))))))},)))).}}},))}.||||||,(((((......)))))....})))}))))......|,,...((((((((({,(((......)))))))))))))...,},}.,,.,,,}},)))}...)))))))},|,...,,,|,.{{({{{,.,{{{{...|||||{{|},..,{{{....,{{{{||||........{{((({{.(((({{.(((((((........))))))).}.))))......,{{{{{{..........,.}}}}}})||||}}|||...........{{..((((((.((((.({{.{,,......},})))))).))))))..||{{...,|||||||||,,...,.,,..((((((..(....)..))))))......(((....))).....|||}}..,}},,...|,|,....}}}}.})),)}||{||}}}..,}}}}}}})}))),.....(((({{{,,,{{{.{{||,...}))).)))..,)))}}}}..||||}}||||{|.,,,,,))})))),),}}{(((((({...})))))))...{{{||.||{|.{||{{..,,,,....,,,))))).}})}.}}))}..,,,,{,,,.....,...}}}},.,},,)))))).))))).))))))))),.)))))))))).))))}}})))))))))).)).)
Back