Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NFATC3_0014500

Sequence Length

1412 nt

GC Content

0.4476

GAGAAUGGCGUGAACCCGGAAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCAAGAUCAUGCCACUGCGCUCCAGCCUGGGCGACAGAGUGAGAUUCCUUCUCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAUACAAAAAAUUAGCCAGGUGCUGUGGUCCCAAAUACUUGGGAAGCUGAAGUGGGAGGAUUGCUUGAGCCUGGGAGGUAGAGGCUGCAGUGAGCCAUUAUUGUGCCACUGCACACCAGCCUUGGUGACAGAGUGACACCUUGUCUCAAAAAAAAUAAAAGAAUUUUUACAAACACUUUUCUGCAUCUAUCGAGAUGAUCAUGUGGUUUUUAAAUUAAUUUUUGUAGAGGUAGGGUCUUGCCAUGUUGCCCAUGCCAGUCAGGAGUAUGUUUUUUUUUCUUUUGUUCAACUAAUUUGGCAUAUUACUUUAAUUGAUUUUCAUUUGUUGAAUCAUCCUUGCAUUCUGGGAAUAAAACUCACUUGGUCUUAAUGUAUCAUCCUUUUAAUAUGCUGCUGAAUUGUGUUAGUGUUUUGUUGAUUUUUGCAUCUAUAUUCAUAAAGAAUAUUCUGUAGUUUUUUUGUUUUUUUGUUUGUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCGCUCAGGCAGGAAUGCAGUGGUGUGACCUCGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCCAGUUCAAGCGAUUCUUCUGCUUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAAGUGCGCACCACCAUGCCCGGCUAAUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUAUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCGUGAUCCACCCACCUUAGCCUCCCAGGUGUAAGCCACUGUGCCUAGCCUUUUCUUUUCUUAUAGUAUCUUUUUCUGGCUUUGUGUCAGAGUAAAUUCUGGCCUCAUAAUGAGUUAGGAAGUGUUUCCUUUUCUUUAAUCUUUUUAAGAGUUUCAAAAGAAUCGAAACUCUUUUUUCUUUGUUUUGUUUUGAGAUGGAGUCUCGCUCUGUCGCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUCAGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCGGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCGAGUAGCUGGGAUUACAGGCACUCACCACUAUGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGAUGGUUUCUAUCUCCUGACCUUGUGAUCCUCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGUGCCCGGCUGAAACUCUUCUUCUGUAAAUGUUUUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUUGAGUCGGAGUCUCACCCUGUUGCCCAGUCUGGAGUGCAAUGGCAUGAUCUCAGCUCACUGCAACUUCCGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-594.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -620.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 241.98

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((((((((.(((.((((.(((((((((((..(((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((.((((.(((((((((....((((((((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((((.(((((((((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((((((....(((((((((((((..((.((((.((((((((((((((.((..((((((((..((((((((((((...(((.(((((..(((.((((((....))))(((((.((((.(((((........(((.(((((((((((...(((((.((((.....((.((..(((((......)))))..))...)).....)))).)))))............((((((.........)))))).)))))).))))).)))))))).)))).)))))..........................)).)))..))))).)))............(((((...((((((.....))))))..))))).......)))))))))))).)))))))))).)))..))))))))))).)))).))..)))))))))))))....))))))))))).))))))))))))..))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))))).....))))).........)))))).))))))))))))))((.(((((.((((((....((((.((((..((.(((((.(((..........))).)).)))))(((((.........)))))...)))).))))...)))))).))))).))..........(((((((((((((.((((((......))))))..))....))))))))))).........................((((((((.........))))))))))))))))).)))).)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))..))))))))))).)))).))).)))))))))))))))))))(((.(((........)))((((((((..((..((......))..))..))))))))..................(((.(((((..((((......((.(((((.(((....)))))))).))..))))..).)))).)))(((((((...((.((((((...(((((.(((((..(((....((((((.((((.(..(..(.............................)..)..)..)))).)))))))))))))))))))..))))))))))))((((.((((.((....)))).)).))))......)))...)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

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