Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFATC3_0015300
Sequence Length
1245 nt
GC Content
0.4265
GAGAACCACUUGAACCCGGGAGACGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGUGCCGCUGCACUCUAGCCUCGGUGACAGAGCAAGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUCUGACAAAGUACUUUAUUAAUCUAUACCUUAAAAAAUUGCUUAUCACUGGCCAGGCGCGGGGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUCAGGAGGCCGAGGUGGGUGGAUCAUGAGGACAGGAGAUCGAGACCGUCCUGGCUAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGACACGGUGGCAUGCACCAGUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCUUAUCACUUAGUAGUUAUUAGCUCACCAGUAUUGAUUAAUCUUCACUGUUUUGCAGAGUCCUUUGGCUUCAAGUCCCUACUUCUUUACUAUUCUAUGUUCAGUACUAACCACAGCUAAGCCAAAUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCACCCGCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACCGUUGCCUGCCACCGUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGUUUUCACCAUCUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUUGUGAUCCACCCGCCUUGGCCUCCCAGAGUGCUGGGUUUAUAGGCAUGAGCCACCGCGCCUGGCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCUCCCUGGCUGGGCUGCAGUGGCACAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCACAUUCCAGGUUCAAGCAACUGAAUUAGUAAAUAUUAGUUCCUUCUCCUUAUAGCCAUAUGAGUUUGAGAAAUUUUUGUUCCGAACUGUGUAAACCAGAAAAAGAUUAGAUGUUAAUACUUGGAAGAUUUUUAAAAUCUUUUUGUUUUGGUCUGUUUUUGUUUAUAACAGCUGUAAUGAGAUAUAAUUCACAUACCAUAAAAUUUAUCCUUAAAAGUAUACAACUCAGUGGUUUUUAGUAUAGUCAGAGUUUUGCAACUAUUACUAGUAUCUAUUUUUAUAUUGAUUGAUUGAUUGAUUGAUUUUUUGAGACAGAGUCUCACUCUUGUUUCCCAGGCUGGAGUGCAUGGUGCAAUCUCGGCUCACCGCAACCUCCGCCUCCCAG

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-581.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -601.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 166.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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