Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFIX_0003400
Sequence Length
229 nt
GC Content
0.6114
CACCACCAAGCGCCCCAAGUCCAUCGAUGACAGUGAGAUGGAGAGCCCUGUUGAUGACGUGUUCUAUCCCGGGACAGGCCGUUCCCCAGCAGCUGGCAGCAGCCAGUCCAGCGGGUGGCCCAACGAUGUGGAUGCAGCAUUCGCAACGACAGGCGCCUCCUCUGCCAACCGGUUUGUCAGCAUCGGACCCCGGGACGGCAACUUUCUGAACAUCCCACAGCAGUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-71.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -75.17
Frequency: 0.0042
Diversity: 74.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((...((((.....((((((..(((.((((.(((((((((.((.((((((.(((((((.....(((((...(((.((.((((((....))))))...))))))))))......)).))))).))))..)))).))))))).)))))))))(((....))))))))).....))))...))).))........((((((...........)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,........,({{{{...{(((,,...(({({,..{(|.((((.(((((((((.((.,(((((,{{(((((,,...(((((..,(((.((.((((((....))))))...)))))}))))...,,.||,|||||.}}))},)))).))))))).))))))))){{{..,.)))}))))).,...))))...))).)),,......{{||||,,......},,),.))})
Back