Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NFIX_0003600
Sequence Length
391 nt
GC Content
0.6240
GCCCGGCUUCUCUAAAGAAGUCAGGAAAGCUGGACUUCUGCAGUGCCCUCUCCUCUCAGGGCAGCUCCCCGCGCAUGGCUUUCACCCACCACCCGCUGCCUGUGCUUGCUGGAGUCAGACCAGGGAGCCCCCGGGCCACAGCAUCAGCCCUGCACUUCCCCUCCACGUCCAUCAUCCAGCAGUCGAGCCCGUAUUUCACGCACCCGACCAUCCGCUACCACCACCACCACGGGCAGGACUCACUGAAGGAGUUUGUGCAGUUUGUGUGCUCGGAUGGCUCGGGCCAGGCCACCGGACAGCAUUCGCAACGACAGGCGCCUCCUCUGCCAACCGGUUUGUCAGCAUCGGACCCCGGGACGGCAACUUUCUGAACAUCCCACAGCAGUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-123.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -129.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 43.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((....))))))).))....(((((((.(((.((((((((........)))))).))....(((..(((..........)))..)))(((((((..((((.(((......((.((..(((((((((((((((((((((..((((((.....((((............(((.((((..((((((............((......))..............))))))..))))..)))..))))...)))))).))).)))))..).)))))))))...)))..))))......)))))))..))))))).......((((..((((...(((.......))).))))...)))).................))).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((((((((....))))))).))....(((((((.(((.{{((((((........)))))).}}....(((..(((..........)))..))),((((((..((((.((({{,.,.((.((..(((((((((((((((((((({..((((((.....((((..,.........(((.((((..((((((............{(......})..............))))))..))))..)))..))))...)))))).,}).))))).,,.)))))))))...)))..)))).,.},.)))))))..))))))}.......((((..((((...(((.......))).))))...)))).......,.........))).)))).)))
Back