Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NLGN1_0007900
Sequence Length
197 nt
GC Content
0.3959
GUCCCCUUACAAAGAAACAGACAGAUGAUUUAGGUGAUAAUGACGGUGCUGAAGAUGAAGGUCCUCAAGGUAUAUGUCUUAUUUAGUUGUAACACACUGUUACAACAUUAUAGCCGGAAACGGCAGACUUCCUUGCAUCAGUUUUUCACCUGAAAAUUGGUGCUUUUGCUUCAGCAUUCAUCAUUAUGUGUUAGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-50.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -53.58
Frequency: 0.0041
Diversity: 33.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((............((((.(((((...(((((........(((((((((..((((.....(((((.....((((......(((((((((...)))))))))......((((....))))))))..)))))(((((((((((.....)))))))))))))))..))))))))))))))))))).)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{.,{{..,.........,,,..,||.{{{{{...(((((((.((((((((((..((((.....(((((.....((((......(((((((({...}))))))))......((((....))))))))..)))))(((((((((((,....)))))))))))))))..))))))))))}.))))))).,})})))..
Back