Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NLGN1_0008100
Sequence Length
251 nt
GC Content
0.3705
CUCUAUCCCAUCCCAUGUCUACAUGAUAAAACAUAGAGCCAAAGCGUGAAGAAGAAGAGUAUAUUAGCCACACAAAGAAAGUGAAAAAAUAUUUGUCUGUUCUCUUCUUCCAAAGGGUAAGGAGAGCUGGAUAUAGUGGAUGUCCUGAAUUUCCUAAAAAAUAUCAUUCUAAUGACAUUUCCCUAAAUGCAACAAGAGGAGCACAGAUGUACAUGACUUUCGUGCCUAAACAUUCAUCUGACAUUACUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-49.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -54.68
Frequency: 0.0004
Diversity: 38.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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