Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NLGN1_0008500

Sequence Length

238 nt

GC Content

0.3613

AGCAGACAGUAUUGAUAUUAUCAAAGUAUGAUUUCCCAGUGUUAAAUAUUUGUUCUGGCUCUACUGUACCCUAGAAUAUAACAUUUAGUUGUCUCCUCUCCUUUAUUUCUCUUAAACACAUUAUACACUGAUAACAAGCCAAAGGCUGUCCUUGAUAGGCCUCCUCUCAACGUGACAAAACAUAAACUCUGUGAAACAUUGUUUAGGUAGACUUUAAGACAUUGGUUCUCGAACAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-37.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -43.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 45.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((((((((((((.....)))).....)))))).)))).))).))).)))((.((((.(...((((((((((.....)))))........(((....(((((((((((.......(((.((.....((((...))))((((((((.(((...))).)))).).)))...........)).)))......)))))))).)))....)))......))))).).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((((((((((((.....}))).....))))))}}}))}}})}})),}))((.((((.,.,.(((((,,{{{.....|}}||,,......,{{.,..(((((((((({.......{{,.{|.....((((...))))((((((((.(((...))).)))).).)))...........,,,)))......)))))))).)))..,.)))......))))).).))))))