Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NLGN1_0009000
Sequence Length
729 nt
GC Content
0.3278
AUUAAAUUUGAAAUGCCUAUUAAGUAUCAAACUGGAGUUAUCUAUUUGAUAAUUAGAUACACAAGUUUAGAGGUUAGAGGAGAGGUCAGGCUAGAGAGAAAAAUCCAAAAUCCAAAUAUGCAUGACUUUCAGAUUUGAUUUUUUUCCUUUAAAAUAUUUAAUUGAUAAAUAAAAAUUCUAUACAAUGUGUACAAUGUGAUGAUUUGACAUGCAUAUACAUUGUGUACUGAUUACCAUAGUCAAAUUAAUUAACUCAUCUAUCACCUUUCAUAAUUAAAAUUUCAUGUGUGGAGUGUGUGCGUGUGUGUGUGUGUGUGUUUGUGUGUGUGUGUGUGUUAAGAUCACUUAAAGAAACUGCUCUUAUCAAAUUUCAAGUAAACAAUACAGUAUUAUUAAUUAUAGUCACUAUACUAUACAUUAGAUCCCAAGAACUUAAUUCAUUUUAUAACUGAAAGUUUGUACCAUUUGACCAACAUCUGUGCUCUGGUAGAAUUUACCUGAUUUGUUCUCUCAAAUUCCUUUCAUUCACAUUUUUGCUGAUUCUUCUGCCCCCUUGCCUUCCAAAAGUUGAUAUUCAGCCCAUCUUAAUAUGUGGCCUUGAGCAUAGCCAUGUCUAAAAGGUUUUGAGUAAUCAUCUGUGAUGUUUCCUUCUUACCUACAGUAAAUAGCUAAUUGAUCCAAACGUGCCCUGUUGAGUGGUCAUAAUAUUUGCCCGGUGACUUUGGGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-133.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -152.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 274.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((......(((.....(((((((.((((....)))))))))))..))).....)))))))).((((.((((((((.((((.(.((((((((((((((..(((((..((...........))..)))))))))))))).)))))...((((((.....)))))).......(((((((((((((..((((.(.....).))))...))))))))))))).((((((...)))))).........(((((......((((((................((.((.(((((.(((((((((((.(((((.(((.((((((((((((...((.(((((.((.((.....)).)).))))).))............)).)))))...........))))).)))))))))))))))..........((((((...(((.........)))))))))))))))))).))))((((((((((((.((((.....)))).((((((......))))))..................(((((.((..((..................))..))...)))))((((........))))....))))))))..))))...))))))..))))).......).)))).))))).))).))))..(((.....)))...((((((.((((.....))))..).)))))....))((((((((.....))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((...{(.,((,{,,.(((((((.((((....))))))))))).,))).,,,,)))))))),((((.((((((((.((((,{.{(((((((((((((.,(((((,,((,.{,,,.,{,,||,,|}}}}}}}}}}}}}}.,}|}...,,{{{{,..,,}}}},,..,,,,.(((((((((((((..((((.(.....}.}))),..})))))))))))}.{(((({...|})))}.,,,,|{,,{{.{{.....,{{,{{{,,{{..,........,,,}||}|||{|,|||,|||{||||||{{{|{{{{{{({{{{{{{{{{{{({,(((({.{{,,,.,,,,.,.}}.))))}.,,.....,,.,,,.}},})))}.,,,,,,....|}}}|,})),))))))))))},,,,,.....{{{{{,..,|{{........,)))))))))))},,))))}},,.{{{|{{||{{{{.(({{{||,,},}}.|||||{,,,,,,)))}}}........,{{{{....,|{|||....}||||......,.........,|,,||...}))|}{{({.,....|||||||,..}}}}}}}),.}))}....,|))).,))|}},,}|,||}.}))).)))))}})}.))))..{{{.....}}}...{{{,{{.{{{{.,,,,}}}).,},))}))....))((((((((.....))))))))
Back