Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_NLGN1_0015800

Sequence Length

2366 nt

GC Content

0.4045

GUUUCUUGAGUACAGGCGAUCAGGCUGCAAAGGGGAACUAUGGACUCCUUGAUCUCAUACAAGCUUUAAGAUGGACUAGUGAAAACAUUGGAUUCUUUGGUGGUGACCCCUUAAGAAUCACUGUUUUUGGAUCUGGUGCUGGGGGUUCAUGUGUCAACCUGCUGACUUUAUCCCAUUAUUCUGAAGGUAACCGUUGGAGCAAUUCAACCAAAGGACUUUUUCAACGAGCAAUAGCUCAAAGUGGAACAGCCCUUUCCAGCUGGGCUGUUAGUUUUCAACCUGCAAAAUAUGCUAGAAUGUUGGCCACAAAAGUUGGUUGCAAUGUUUCAGAUACAGUAGAGUUAGUGGAAUGCCUACAGAAGAAGCCUUACAAAGAACUUGUUGACCAAGAUAUUCAACCAGCUCGAUACCACAUAGCCUUUGGACCUGUGAUUGAUGGUGAUGUAAUACCAGACGACCCCCAGAUAUUGAUGGAGCAAGGAGAGUUUCUCAACUAUGAUAUAAUGUUAGGAGUGAACCAAGGGGAAGGGUUAAAAUUUGUUGAAAAUAUAGUAGAUAGCGAUGAUGGUAUAUCAGCUAGUGAUUUUGACUUUGCUGUUUCAAAUUUUGUUGAUAAUUUAUAUGGAUAUCCUGAAGGCAAAGAUGUUUUGAGAGAAACCAUUAAGUUCAUGUAUACUGACUGGGCUGACCGUCAUAACCCUGAAACCAGAAGAAAGACAUUACUGGCUUUGUUUACGGACCAUCAGUGGGUGGCACCAGCUGUAGCCACAGCGGAUCUUCACUCAAACUUUGGUUCACCUACGUACUUCUAUGCCUUUUACCAUCAUUGCCAAACAGAUCAGGUUCCAGCUUGGGCUGAUGCAGCCCACGGAGACGAGGUUCCCUAUGUACUGGGAAUCCCCAUGAUUGGCCCUACAGAGUUAUUUCCUUGCAAUUUCUCCAAAAAUGAUGUGAUGCUGAGUGCAGUUGUAAUGACAUACUGGACAAAUUUUGCUAAAACUGGUGACCCAAAUCAACCAGUCCCUCAAGACACGAAAUUCAUUCAUACCAAACCCAACCGUUUUGAAGAAGUAGCAUGGACCAGAUAUUCCCAGAAAGACCAACUUUAUCUCCAUAUUGGAUUAAAACCAAGAGUUAAAGAACAUUACAGAGCCAAUAAGGUGAACCUCUGGUUGGAGUUGGUACCUCAUCUGCAUAAUCUCAAUGACAUUUCUCAGUAUACCUCUACAACAACUAAAGUGCCAUCAACUGACAUCACUUUCAGACCUACGAGAAAAAAUUCUGUACCUGUCACGUCAGCCUUUCCCACUGCCAAGCAGGAUGAUCCCAAACAACAACCAAGUCCAUUUUCAGUGGAUCAAAGGGACUACUCAACAGAGCUGAGUGUCACUAUUGCAGUUGGAGCAUCACUGCUGUUUCUGAACAUCUUGGCCUUUGCAGCCCUGUACUACAAAAAGGAUAAGAGGAGACAUGAUGUUCACAGGAGAUGCAGCCCUCAGCGCACUACUACCAAUGAUCUAACCCAUGCACAAGAAGAGGAAAUCAUGUCCCUCCAAAUGAAGCACACUGAUUUGGAUCAUGAAUGUGAGUCCAUUCAUCCACAUGAGGUGGUUCUUCGGACCGCCUGUCCCCCAGAUUACACACUAGCUAUGAGGAGGUCACCUGAUGAUGUUCCCUUAAUGACACCCAACACCAUUACAAUGAUUCCCAACACUAUACCAGGGAUUCAGCCCUUACACACAUUCAAUACAUUUACUGGAGGACAGAACAAUACUCUGCCCCAUCCCCAUCCCCACCCCCAUUCACAUUCAACAACCAGGGUAUAGCCAGAUAAGAGAAACAAACUAUUUUUUUUGAUGGAUUGCAGUAAACGAUCACUGAAGAUUCCUUGGCUUUCAACCUACAAGACUUACUAUUUAAAUAAGGAGGAAUAUUAUGUGAAUAUACAUAUCAAGAACUUUGGGGGUUUUGAAAAAAAUGAAUUGUAUAUAUACAAAUCAACUUUAAAAACAAAUUUCAAUUGCUUGAAGCAAUUGUUCUGAAUGAUACUUUUUCAUUCACAUUCAAGAAUUAAUUUUUUGAAGAUUUAAGUUACAUAAUGGAAUUAGGCAUGUGGAACACCAAACAGGAAAGAACUAUGUCUGAAAUAUAAAAAAUAAAAAUAAAAAAACAACUAUGAAUAUGCACAAGGGACACACCAGUGGAAUGUCAGAUAAUUUUCACCAGUUUUUAUUUGGAGCCGUUUUAUUGUGUAGACCAUAUUUACAUAUUUGGAUAAGUACACAAAGCGUCAAUGCUGUUAAUGGCCUUAGCAAAGGCUCAUGCUGAAAUUUGCCAGUAAAACAAAGAAGUUUAAAGACUGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-584.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -633.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 482.32

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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