Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NLGN1_0015900
Sequence Length
1371 nt
GC Content
0.4238
GACUUUUUCAACGAGCAAUAGCUCAAAGUGGAACAGCCCUUUCCAGCUGGGCUGUUAGUUUUCAACCUGCAAAAUAUGCUAGAAUGUUGGCCACAAAAGUUGGUUGCAAUGUUUCAGAUACAGUAGAGUUAGUGGAAUGCCUACAGAAGAAGCCUUACAAAGAACUUGUUGACCAAGAUAUUCAACCAGCUCGAUACCACAUAGCCUUUGGACCUGUGAUUGAUGGUGAUGUAAUACCAGACGACCCCCAGAUAUUGAUGGAGCAAGGAGAGUUUCUCAACUAUGAUAUAAUGUUAGGAGUGAACCAAGGGGAAGGGUUAAAAUUUGUUGAAAAUAUAGUAGAUAGCGAUGAUGGUAUAUCAGCUAGUGAUUUUGACUUUGCUGUUUCAAAUUUUGUUGAUAAUUUAUAUGGAUAUCCUGAAGGCAAAGAUGUUUUGAGAGAAACCAUUAAGUUCAUGUAUACUGACUGGGCUGACCGUCAUAACCCUGAAACCAGAAGAAAGACAUUACUGGCUUUGUUUACGGACCAUCAGUGGGUGGCACCAGCUGUAGCCACAGCGGAUCUUCACUCAAACUUUGGUUCACCUACGUACUUCUAUGCCUUUUACCAUCAUUGCCAAACAGAUCAGGUUCCAGCUUGGGCUGAUGCAGCCCACGGAGACGAGGUUCCCUAUGUACUGGGAAUCCCCAUGAUUGGCCCUACAGAGUUAUUUCCUUGCAAUUUCUCCAAAAAUGAUGUGAUGCUGAGUGCAGUUGUAAUGACAUACUGGACAAAUUUUGCUAAAACUGGUGACCCAAAUCAACCAGUCCCUCAAGACACGAAAUUCAUUCAUACCAAACCCAACCGUUUUGAAGAAGUAGCAUGGACCAGAUAUUCCCAGAAAGACCAACUUUAUCUCCAUAUUGGAUUAAAACCAAGAGUUAAAGAACAUUACAGAGCCAAUAAGGUGAACCUCUGGUUGGAGUUGGUACCUCAUCUGCAUAAUCUCAAUGACAUUUCUCAGUAUACCUCUACAACAACUAAAGUGCCAUCAACUGACAUCACUUUCAGACCUACGAGAAAAAAUUCUGUACCUGUCACGUCAGCCUUUCCCACUGCCAAGCAGGAUGAUCCCAAACAACAACCAAGUCCAUUUUCAGUGGAUCAAAGGGACUACUCAACAGAGCUGAGUGUCACUAUUGCAGUUGGAGCAUCACUGCUGUUUCUGAACAUCUUGGCCUUUGCAGCCCUGUACUACAAAAAGGAUAAGAGGAGACAUGAUGUUCACAGGAGAUGCAGCCCUCAGCGCACUACUACCAAUGAUCUAACCCAUGCACAAGAAGAGGAAAUCAUGUCCCUCCAAAUGAAGCACACUGAUUUGGAUCAUGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-333.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -362.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 391.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((...((((....))))(((((((((((((((.........)))))))).(((((((.(((((..(((((......)))))(((..........(((((..((((..(((.(((.((((((...((((.....))))...........(((..((((.(((((((...((((.....((((((((.(.((((....((((((((..(((((((...(((((......))))).........((.(((((..(((((((((((((....(((.............(((.(((.((.((.((.((((..(((.....(((((((................((((((((((((....(((((((((((((..((((...((((((........(((..(((((.((((...((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))))).......((((.((.....))))))......))))))..))))..))).))))))))))........((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....((((....)))).....))))))))))))..))))))).....)))....(((((((...)))))))((....))..((((((........)))))))))).)).)).)))))))))))...)))))))))......))))..))).)).))((((((.((.(((((((....))).)))).)).............((((((((......)).))))))...(((((((............................))))))).....))))))(((........)))............(((((.(((....((((.......))))))).)))))...)))))))..)))..))))).......))))).)))))))).....))))........)))))))...))))..)))...)))))).....((((((((...((....))...)))))).)).......((((....))))))).)))..))))))))).........)))..))))).)))....))))...........)))))))...(((((((..(((((.(((((.......)))))))).....(((.(((((.((..((((.((((....(((((((.((.(((((.....(((...........)))...)))))...)).))))))))))).)).))..)).).)))))))......))..)))))))............)))))))...(((((....(((((((.(.......).))))))).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((...((((....))))...((((((((((((.........)))))))).....{(({((((((.....}}}.|}...}})}|}}}}...(((((((((.(((((((..{...(((..(((((.,((,.,.{{}|,}...,|..},,}}.},...})))).))).,..)))))))))))))))),,,,..((((...((...))...}))),|||.(((((......}))))..,,....{({....,,..}||.(({,{({((,,.,|||..,,.,.......||||{({.{{.,,.{,.((((({((({{...,,((((({......,..,,,,..((((((((((((....(((((((((({((..((((...((((((......,,,,{,{(((((.((((.,.((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))),,.....,.((((.((.....))))))......))))))..))))..})).))))))))))..,.....((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....|{{{....,,}).....))))))))))))....|||||.{{({,(({{{{(((((((...))))))},{|,..,{{{((((((,......,|||}}}}))),,},||{||,||,,,|||,,,|||||,|||.{{{{{{.{{{{{,{{,,(({,{{,(({((,(((((((...,}}|,||||.}}...,,{{{.....((((((((......)),})))))...,|||||,..,....,,,,}},..............}))))).}}}}||.}}}.}|}...|||,}}},|||,....,,,,(((({.{((,...((((.......)))}}}|.}}}}}..,.....||.||||,,.|)).,,,})))}}}}),))))))),}})).})))).....,,,..,}},.,,,}}}}}}}}}..,,,)})}}}....{(((((...((....))...)))))).,|{,.(((.((({....})))))).,,}}},,,,,|}}}|||||}.{{{{.,{||||((((.{{,.,{{{,........(((((({...}))))))....{|(((.(((((.......)))))))).}}.,}|{,||||},,|}}},}|}|}||||,{{{{{{((,{{.{((({,,,,.(((...........)))...})))),,.}},))))))))}})}}},|||.||.,,,,)))))},.,,.,},|||,}},,...},},,....))))))}...(((((....(((((((.,.,....,).))))))).))))).}
Back