Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NSUN2_0004400
Sequence Length
767 nt
GC Content
0.4563
CCACGCAAAAGAGAUUCUCCAUUGCUUAAAGAACAAAUAUUUUAAGGAAUUGGAGGACCUGGAGGUGGACGGUCAGAAAGUUGAAGUUCCACAGCCACUGAGUUGGUAUCCUGAAGAACUUGCCUGGCACACAAAUUUAAGUCGAAAAAUCUUGAGAAAAUCGCCACACUUGGAAAAGUUUCAUCAGUUUCUAGUUAGUGAAACAGAAUCUGGAAAUAUUAGUCGUCAAGAAGCUGUUAGCAUGAUCCCACCACUGCUCCUCAACGUGCGGCCUCAUCAUAAGAUCUUAGAUAUGUGUGCAGCACCUGGCUCAAAGACCACACAGUUAAUUGAAAUGCUACAUGCCGACAUGAAUGUCCCCUUUCCAGAGGGAUUUGUUAUUGCGAAUGAUGUGGACAACAAGCGCUGCUACCUGCUCGUCCAUCAAGCCAAGAGGCUGAGCAGCCCCUGCAUCAUGGUGGUCAACCAUGAUGCCUCCAGCAUACCCAGGCUCCAGAUAGAUGUGGACGGCAGGAAAGAGAUCCUCUUCUAUGAUCGAAUUUUAUGUGAUGUCCCUUGCAGUGGAGACGGCACUAUGAGAAAAAACAUUGAUGUUUGGAAAAAGUGGACCACCUUAAAUAGCUUGCAGCUACAUGGCUUACAGCUGCGGAUUGCAACACGCGGGGCUGAACAGCUGGCUGAAGGUGGAAGGAUGGUGUAUUCCACGUGUUCACUAAACCCUAUUGAGGAUGAAGCAGUCAUAGCAUCUUUACUGGAAAAAAGUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-213.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -229.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 185.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.....((.(((((((((.(((((((........))))))).)).))))))).))((..(((((...((((....))))...)))))..))........((((............))))..(((((((.(((((((.......((((((.((.....(((.(((((((...........((((((((.(((((((...(((...)))....))))))....).))))))))..((((((.......)).))))..)))).))).)))....)).))))))))))))).))))))).(((..((((((((.(((......)))..))))...))))..))).((((....))))(((((....)))))((((((....))))))).)))))...........(((((.((((((((((.((((((((....((((..(((((((.((((((((((.....)))))))))).((((......((((((..((....((((((((.((.((((......))))))))))).)))...(((((((((.((((((.......)).)))).))).))))))........))..))))))......))))...........((((...((((....))))...))))(((..........))))))))))..)))))))))...((((((....(((......)))....)))))).........)))))))).)))))...))))).(((((((.......)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,(({.....{(.(((((((((.(((((((........))))))).)),})))))).))((..(((((,..((({....}))).,.)))))..)){(((.(,{(((....(({.,....(({.,.(((((((.(((((((.......((((((.((.....(((.(((((((,..,{{{{{..((({((((.({(,,{{.,}|||,,.)))|,,,},,,,|.,..,.,))}}))}..{((({(.......}).))))..,))).))).)))....)).))))))))))))).))))))),)))...,.})))...))))}.))))....,,...,(({{,,{,}.((((....})))(((((....)))))((((((....)))))).,))))).,,.,,.,,}.{((((.((((((((((.(({((((,...{((((..(((((((.((((((((((.....)))))))))).{(((,,....{{{{{{{{((,,..,,{{||||{(({({({,,{{{.,,))))))},)}.)),..(((((((((.{(((((.......)).)))}.))).)))))).....,,,,..,)))))),.....}|}}...,,......,{{({{{((((....||||...))))|||,...{,....,)))))))))..))))))))),..{((((({.,.{{{....,,)))).}.}}}}}}.........})}))))),,))))...))))).(((((((.......)))))))
Back