Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NSUN2_0004700
Sequence Length
1882 nt
GC Content
0.3348
GUAUUUAUCUUAUUGGCCAAAAAGCCCAAAUCCACUAAAGAAAUCAAGUCAAAUAGAGACUAAAAUGAAGUUGUGCAUGAAUAUGACACAAUUGUACAUAAGUCUUGGGGUGCGGAGAAAGAUAGCGUGAGCCUAAACCAAAAGAUGGACACGUAGAUACGUCUUAAUGAGAAGCAGCACAGCAGAUGCUGGAUAAAGAACAGAAAGGGGUGGUUGCAAUAGCCUGCAGAAAGAUAAAGAGAAAACAAAACAAAACAGAGAAAAUACGUAAGAGGAAAAUAGAAUCGUAGACUCUUAUUGUGGUGUGUUUUAGGAUGUUAUUGCUUGGAACAAUUUGUGCACCCCAACUAUUUUGUAUUAGUUCUUCCAGUGAGUACAGUAUAUAAAAAACUUUGUCAUAAAAUAAUACGUAAUCACAUUGGAUUUUAUGUUAUUUAGUUGAAUGAAAGAAAUUUCGGAGUUCAAGCCCUUAAGAAAUUCAUUUUGCUUGUGUUUUUAUACCUUUCUUGAGAUAAUACAUCAACAUUUUAGAUAUUUAGAGUUUAGAUAUAAAAUAAUACUCAUGGUAUAACUGAGUAACAAGUUUUUUUAAAAGGAAAGAAACAAAACUAAAGACAUCAUCUGUUCCGUUCCCAUAGGAGGUGCACGGAUGAUGAUCCCAGGUGAUAAUGACUUCUGAAUGACAUAAGUUUGUCAAGACCAGAAUUCAAAAGCUGCCACAAAACUUGUUAGCACAGAAUGCAAGCUUUAGAUACGAUACCACAUUAUGGAAGAAUGCCAUUUUGUUUCAGUAAGUGGCAGAGUUACUGCUCAUGGCAAAACUCAGUAUGAAACUUGCAGCUGGUGGCUCUGAAUAUAGCUGAGUGUUAAAAUAAUCUGGAAAAAGCCCUCUUUAAAGUAAAAUUUAAAAUACAUCAUGAACUAAAGUUUUUUUUUCCUCUAGGUUGCAAUUUUUCAGUAUUCCUUGGGGUCUCAUGUUUUCCUACCCCUGUUUUUUGAUCAGAAAGAUAACUCGUUCCUUGUAUCAUAUUCUGAGAUCUGAGAACGCAGUGACCUUAUGAGCAAGAGGUUGCAAGCUGGGGAAAUUUCUGAAAUUGUGGUGGGAUUUCUACCAUGCAAACAACUAGUGUACAGCCAGGAAUGCCAUUGCAAAGUGGGGAUUACAUCUCAUGGGAUAAUUCCAUCCUGCAGACCUAGUCCCUCGUGUACACGCGGCUAGACCAUCAAGGAAAAUCAGCAUUUACAGAGAAAGCCAACAAAAACAGGCGUUACCUUCUGGGAAAACAGGGCAGAUAAAAUUAGACACAGAAAGUAACAAAUCCAGUCUUUACUAUAAAAUAUACAUGGAAAGAGCUUCCAUUAACAAAAACAUGAAAAUAACUUCCAUUAAAUAAAAGUAGAAAGUCAGAAAUUUAACGGUGAUUGUAAGAAAAAUUUAGCUAUUAGUAAGAAAAAUUUAGCUAUUAUAUUAGCUUAAUUGAAAUUACUAUGGAAAAUUUAUUAGUCAUUAUUCAUAUAAUUCUGAUUAAAAUGCCAUUGUUGAUUAACUGAGUUUUUCAAUAGUAUUUUAGGUUCUGAAAAACAUGAAAAUAACUUCCAUUAAAUAAAAGUAGAAAGUCAGAAAUGUUUACCUGUGAUUGUAGGAAAAAUUUAGCUAAUAUAUUAGCUUAACUGUGGAAAAUUUCUUAUUAGUCAUUAUUCAUGUAAUUCUGAUUAAAGUGUCAUUGUUGAUUAACUGAGAUUUUCAAUAGUAUUUUAGGUUCUGUGUCCUAGGUCUGCAAAUUAGUCUUGCUAGUGUUUUUUCCAAAUGGAAGCACAUUAAUAUCUCCUUAGUGAAUGGAGUUUACUGUUCAAAUCCAUUAUUUUCUGCUUGAAAAUUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-415.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -454.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 563.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((.....(((......)))....................((((.......)))).......((((((((((....))).)))))))(((((.((...((((((((((.(((......(((((..((.............)).))))).......((((...)))).(((((.((.(.....(((.........))).....).))))))).....((.((((.((.((....((((.(((..((((...((((....((((.................))))..))))..))))..))).))))...)).)).))))..)).....))).))))))))))...)).))))).((((((((((((((.(((.(((((((((....))))).........))))))).))))((((((((...(((((((((((.((((((.....(((((.(((........)))..))))))))))).)))(((((((.......(((((..((((........(((((((...((((((((((((..............((((((.(......)))))))....((((((((......))))))))...(((...((((((((((((.(..((((....))))..).)))))))))).))...))).....(((.(((((..(((((......)))))....))))).)))...((((..((((...)))))))).(((..((((((.(((..((((....(((.....))).....((((((((.........))))))))(((((..((((...)))).))))).)))).))))))))).)))..))))))))))))....)))))))......)))))))))..(((((.((((((......)))))).........((((....)))).(((((((...((((.((..((((((.((((((((((((((((((.(((((((((.....((((((.((((((((.((((.(.........)))))...))))))..)).))))))((.((((((((........))))))))..)))))))))))...)))..(((((((((.((((((....((...((.....))...))...)))))).)))))))))...((((((((..(((..((((((......)))))).)))..))))))))((((....))))....)))).))))))))..........))).))))))(((..........))))).))))...))))))).)))))..........)))))))..))))))))))))))))...................))).))))))).................)))))).))(((.(((......(((((((((((.....((((((((((((..((((((..(((((.((...((((((....((((.(((((......))))).))))....)))))).((.......(((((..(((((....))))).))))).......))((((((((..(.((.((((..(((((((((((((((..((.(((..(((((((.....................(((((.(........).)))))..((((((((((((((..(((((((((....))))))........)))..))))))).)))))))..)))))))..))).)))))))))...))))))))..)))).)).)..))))))))..((((((........))))))...)))))))..))))))((((((..(((((....))))).))))))....((((.........)))).)))))))).)))).....)))))))))))...))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(((({({.(({((.....,|||{,.....,,,...,......,,|,.....{(((((...,,,.((((((((((....))).)))))))...,,,.))))))|||{|||{||,.,,,,,,(((((,,((,...,,......|)).}}}}}.}}})),||{{,,{...{{((((.,,,,.,{{{|,||{{{...(((({{..(((((((({((((......))))|.,{{{{,..((((...({{......{{.((((((..((.(,{((((((((.(((((..(((..,,...{{((((((((((((((,.{{(({(((({{(((((((,,((,(((.....{({{....,...})))|{{(((((((,{((,.((((.{{{{....,,|||,,,.,{{{,{||.,,{{((,|..,|}}}}...||||||||{{{|{{{{(({{...,||||,{.{|,,...,.|||,,||||,,.,},,.(({{{{||,,,.,,,,,|}},||}||........,,,,.{{{({,.{(((((({,,,,}})))}},,,,...(((({{.|,,,,.,))))))),,,.((((((((......)))))))).........((((((((((((.{..((((....)))),.).)))))))))).)),,})))}}}..{((.(((((..(((((......)))))....))))).))}...((((..({{,...}))}}))).,|||}||||}}}|||,.}}}}..}}}}}}....))))))}.}))}),,))))}}}}}}}}}}}}||((((({{((((...,{({,...{{{,,.}}}..,)))))}),)}}))))))).,},},|}}}}},}}}....,...,,||.....,,},...,,..,,,,,..})))))))))))))))).)))..))))).)))))))))).)).....)))))).}).,,..))).,.)))).))))))})))))))}((((((,{{{{{{{{,{{{|{(.,,,,....}}}||...}}}))}.,)}.))))))|,.{{((((((........))))))||,,||((((({,{{((((,,..(((((((((.((((((....((,,.{{.....,)}},,,,..)))))).)))))))))..}|||||||...})}}|{((((,...}}})),,|((((((((((.||({({((,...}}}}({{.{{((.....))....}}})).,,},|||||...(((..........))).,,..,|||||......})))}............((((((((({{{{{.........,..|}}}}...........((((((.....)))))}...........,|.......,|||.,,........}}}.,,.,(((((((.,.,,,.((((((((,,,,,.{(((((..(((,{(((((....((((.(((((......))))).))))....))))))))).}))))).}}}}))))).,,...,.,.)))))))|(((((((...((((((..{.((.((((..(((((((((((((({..({.(((..(((((({....,,{{,.,,,.......,||,|,.,,,,,....,,,}},,.,((((((((((((({..{{{((((({....})))))........}}}..)))))))},))))))..}))))))..))).))))))))),..})))))))..)))).)).)..)))))))))))))}..)))))))))))))))))))}...|||,,}}))||((((,.{((((....)))))})),,,,....((((.,.....,.)))).,,.))))))..})))).)}}}},))))))....}}})).
Back