Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_NSUN2_0005600
Sequence Length
526 nt
GC Content
0.4734
GGCUGGGAAGGAGGCUACCCCGAGAUCGUCAAGGAGAACAAGCUGUUCGAGCACUACUACCAGGAGCUCAAGAUCGUGCCCGAGGGCGAGUGGGGCCAGUUCAUGGACGCUCUCAGGGAGCCGCUCCCGGCCACUUUAAGAAUUACUGGUUACAAAAGCCACGCAAAAGAGAUUCUCCAUUGCUUAAAGAACAAAUAUUUUAAGGAAUUGGAGGACCUGGAGGUGGACGGUCAGAAAGUUGAAGUUCCACAGCCACUGAGUUGGUAUCCUGAAGAACUUGCCUGGCACACAAAUUUAAGUCGAAAAAUCUUGAGAAAAUCGCCACACUUGGAAAAGUUUCAUCAGUUUCUAGUUAGUGAAACAGAAUCUGGAAAUAUUAGUCGUCAAGAAGCUGUUAGCAUGAUCCCACCACUGCUCCUCAACGUGCGGCCUCAUCAUAAGAUCUUAGAUAUGUGUGCAGCACCUGGCUCAAAGACCACACAGUUAAUUGAAAUGCUACAUGCCGACAUGAAUGUCCCCUUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-145.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -155.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 91.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(..((((.(((.((((.((((.....(((((...)))))((((.((......))..))))..((.(..((((.(.......).))))..).))...)))).)))).))))))).)))))))))..............(((((.....)))))...........(((((((((.(((((((........))))))).)).))))))).(((((((.(((((.(((....((((((((((..((((((......)))....)))..)))))).....(((((((.(((((((.......((((((.((.....(((.(((((((...........((((((((.(((((((...(((...)))....))))))....).))))))))..((((((.......)).))))..)))).))).)))....)).))))))))))))).))))))).(((..((((((((.(((......)))..))))...))))..))))))).))).)))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({.{..((((.(((.((((.((((...,,((((,...|)))}((((.((......}),.)))).....,,.((({.,.,,,...}.)))),.},))...)))).)))).))))))).))))))))}..............(((((.....))))).........,.(((((((((.(((((((........))))))).)),})))))),(((((((.(((((.(((....((((((((((..((((((......})),...)))..)))))).....(((((((.(((((((.......((((((.((.....(((.(((((((,..,{{{{{..((({((((.({(,,{{.,}|||,,.)))|,,,},,,,|.,..,.,))}}))}..{((({(.......}).))))..,))).))).)))....)).))))))))))))).))))))).(((..((((((((.(((......)))..))))...))))..))))))).))).))))))),.}))))
Back