Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_OGDH_0000400

Sequence Length

1961 nt

GC Content

0.4136

GGGAAUUGCUUGAACCUGGGAUGGGAGGUUGCACUGAGCCGAGAUCACACCACUGCACUCCAGCCUGGACUACAGAGCAAGACUCCGUAUCAAAAAAAAAAAAUCUCCAGCUGUUGUGGCAGCUCUGCUGGGCAGCACUUAACUAUGUGUCAGAUUCAGUGACUGCGGAUAGCAAAAUGUCAUGAUUUACUUAAACAGGAUCAUGUGGAAGGGGCCACUUUGGGAAGAACAGAUGAAAUUGGUGUUUUACGAUUGUCAGUUCAGUGCCUGUUAAUUGGGCUAUUGCAGCAACUGAAUACUGAUAGUUAAUGAGGUGAUGCUAUUGUUUUCUGGGAGAAAACCCAACUCAGAGGCAAUUGGGUAUUUAAUAUUGCCUUAAUAAUGACAUUAAAGGAAAAAAAUGAACAUUUUCCUUUGAGCCUGAGAAAUUAAAAAAAAAAUAGCAUAAAAUGAAGCAACAGUAGUAUUUUUGCUGUCAAUGUUAGGGCUGUUUGUCUUCCUUAAAUAUAUCAGUGGAAAAACUUGGAGUGUAGUUGGAGGUAGGAAGAACUACCGAAUUAACUUAAAACUUUUGAUUUCUAAAGUGAAAACCCAGGGGUAAAGAUUGCAUUCCCUAAUUAUAUCCAGAAUAUAUUGCUUGUUUACCUUUAAUUUGUAAGGAGCAAGUUUUUGUUUGUUGUUCAGUUUGUUUUUAAAGAAUAUGUUCUGCUGUUUACUUUUGCUGACCUAUCUCUUCUCAGUGGAGCAGGCCAGAGGUGAAUGCAGGACACUCUAAGCCCUCUCUCUUGGUGUCCCUUAAGUGUAUUCUGAGCAUAUUUGGGCCAAGAGGAAGUUUCUGAUAAAUAAUAUAGAAGAUAUUUUUAUGUAACAGUUAUUUCUGGGUAAUUCACACUAUGUUUCAGAGCUUGGAUUUUCUUCGGGUAGGUGUGGACAUGGAGUGUAGUUCUAACUUUACAACCAGAGCACCUGCUUUGAGACAAAUUCAUGAGCAACCAUGUAGGCCAGCAAGCACCUUUUUUUCCACAGGCAGCGUCCUUGUGAACUUUCCGCUUGGAUCCUGACUCUGCUGUUAGUAGCCUAUGACCUUGGAUGAAAUGUAAGGGAAUAGAAACUGAAGCUAUCUGUAAAGUGAAAGAGCUGGUGCCUGCCUUAUUGGGAGCCUCUGGGUUUAUGUAUGAGUCAGAUGCGUAGAGUUGCUCACCAUGGAGGGCCCAGGGUAGGCAGGCAUUAUUGAACAACUGCUCCAUGUGCUCUUUUCAAUCUUUGCAGACCCCACCCACGUCUCCCUUGCUCAGACCUGGCUCCCCAUGGCUUAUGAAAGGGGGCUGAGUGCAGAAGGUGGCAGGCAGGACACUGGACAACCCUCUGUGGCUUUUCCUUACCCUUCGUAGUACCAUGAGAUUCUGGCUCUUCCCGUCUCUGUGUUUCUGCCUAUGGGUCCUUCCACAUGCAGUGCCUCGUCUUCCCUCCUUCCCAUCCAUGUCCUUUUGUCUUCAGGCACACCCACUUGGAAGGAGCCCAUCCUCUCACAGGGUCUGCUGGCAUAUUCUGCACCUCUCAAGUACUCAUAUUUCCUCUGCAAUCUUUUCUAUGUUGUUUUUCCUCUGCUCAAGGGUAAAUUGAGAGUAAGGAAAGUAUUUUUCUAAUUUCUUUGUAUUUUCCAUAAUAUUGUAAGUACAGCAGGUACUCAGUAGUUUCUGGACAGAUUAGAAAAUGUUUUACUUAUUCUCCAAUUAAUCCUAAUCCUAAUUCUAAAUUAAUUAAUCCUUGUUGCCUUUCUUCUAAUUGUUUUAUAUAUAUGUAAUAUGUAAAUUUAAAGAACAUCGUAUGUUUAUCAUCUUAGCCCUUAAACUAGAUUUAAUGGUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUGAGACAGAGUCUCACUCUGUUGCUAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUCUCGGCUCACUGCAGCCUCCACCUACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-615.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -655.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 380.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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