Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_OGDH_0001300

Sequence Length

577 nt

GC Content

0.4957

GCAGUUGUGAAAAACUUCAGGACAAAAAUGUUUCAUUUAAGGACUUGUGCUGCUAAGUUGAGGCCAUUGACGGCUUCCCAGACUGUUAAGACAUUUUCACAAAACAGACCAGCAGCAGCUAGGACAUUUCAACAGAUUCGGUGCUAUUCUGCACCUGUUGCUGCUGAGCCCUUUCUCAGUGGGACUAGUUCGAACUAUGUGGAGGAGAUGUACUGUGCUUGGCUGGAAAACCCCAAAAGUGUACAUAAGUCAUGGGACAUUUUUUUUCGCAACACGAAUGCCGGAGCCCCACCGGGCACUGCCUACCAGAGUCCCCUUCCCCUGAGCCGAGGCUCCCUGGCUGCUGUGGCCCAUGCACAGUCCCUGGUAGAAGCACAGCCCAACGUGGACAAGCUCGUGGAGGACCACCUGGCAGUGCAGUCGCUCAUCAGGGCAUAUCAGGUCAGGGGUCACCACAUUGCAAAACUUGAUCCUCUCGGAAUUAGUUGUGUAAAUUUUGAUGAUGCUCCAGUAACUGUUUCUUCAAACGUGGAUCUUGCAGUUUUCAAGGAACGACUUCGAAUGCUAACAGUAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-178.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -187.04

Frequency: 0.0000

Diversity: 124.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((...........(((((((((((.....((((((((((....((((((((((......))))))...))))....))(((((((...........(((((...(((..(((((((((..((.(...(((((......))))).(((.((((((((......)))))))))))((((....))))).))...))))))).))..)))..))))).........))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).....)))(.((((.((((.((((..((((((((((...............((((.(((...)))))))((((((.......))))))..)))))))..)))..))))...))))....))))((((..((((.((((((..((..((.((((....))))))..)).)))))))))).)))).(((((.((((...(((....)))...)))).)))))..(((((.((.((..........)).)).)))))......(((((((((.((((((......))).))).)))....)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((({,....,,.,,,,((((((((((((.....((((((((.(((..,,{,((((((......)))))),,,|,||({..{{({{{{{{{.,......,.{(((({(((((..{{(,{{{{{..,,.|,..(((((......))))).|}|}||||||{(,{{...,,,}},)))}}{{{{....})}}},)},.,))))))).))..))}.,)))))...........,,,))})))))))))))))))))))))})))}}}}}.,,..}}}{.((((.((((.((((..((((((((((.,.............((((.{((...)))))))((((((.......))))))..)))))))..)))..))))...))))....))))((((..((((.((((((..((..((.((((....))))))..)).)))))))))).)))).(((((.((((.,.(((....))).,.)))).)))))..{{{{{.{,.{||||...,.,{||.|},|||}}..,},,{{{{|||||,{{{{{|,,.,..)}),))),))|..,.})})}})