Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_OGDH_0001900
Sequence Length
2659 nt
GC Content
0.5517
GCAGUUGUGAAAAACUUCAGGACAAAAAUGUUUCAUUUAAGGACUUGUGCUGCUAAGUUGAGGCCAUUGACGGCUUCCCAGACUGUUAAGACAUUUUCACAAAACAGACCAGCAGCAGCUAGGACAUUUCAACAGAUUCGGUGCUAUUCUGCACCUGUUGCUGCUGAGCCCUUUCUCAGUGGGACUAGUUCGAACUAUGUGGAGGAGAUGUACUGUGCUUGGCUGGAAAACCCCAAAAGUGUACAUAAGUCAUGGGACAUUUUUUUUCGCAACACGAAUGCCGGAGCCCCACCGGGCACUGCCUACCAGAGUCCCCUUCCCCUGAGCCGAGGCUCCCUGGCUGCUGUGGCCCAUGCACAGUCCCUGGUAGAAGCACAGCCCAACGUGGACAAGCUCGUGGAGGACCACCUGGCAGUGCAGUCGCUCAUCAGGGCAUAUCAGAUACGAGGGCACCAUGUAGCACAGCUGGACCCCCUGGGGAUUUUGGAUGCUGAUCUGGACUCCUCCGUGCCCGCUGACAUUAUCUCAUCCACAGACAAACUUGGGUUCUAUGGCCUGGAUGAGUCUGACCUCGACAAGGUCUUCCACUUGCCCACCACCACUUUCAUCGGGGGACAGGAAUCAGCACUUCCUCUGCGGGAGAUCAUCCGUCGGCUGGAGAUGGCCUACUGCCAGCAUAUUGGGGUGGAGUUCAUGUUCAUCAAUGACCUGGAGCAGUGCCAGUGGAUCCGGCAGAAGUUUGAGACCCCUGGGAUCAUGCAGUUCACAAAUGAGGAGAAACGGACCCUGCUGGCCAGGCUUGUGCGGUCCACCAGGUUUGAGGAGUUCCUACAGCGGAAGUGGUCCUCUGAGAAGCGCUUUGGUCUAGAAGGCUGCGAGGUACUGAUCCCUGCCCUCAAGACCAUCAUUGACAAGUCUAGUGAGAAUGGCGUGGACUACGUGAUCAUGGGCAUGCCACACAGAGGGCGGCUGAACGUGCUUGCAAAUGUCAUCAGGAAGGAGCUGGAACAGAUCUUCUGUCAAUUCGAUUCAAAGCUGGAGGCAGCUGAUGAGGGCUCCGGAGAUGUGAAGUACCACCUGGGCAUGUAUCACCGCAGGAUCAAUCGUGUCACCGACAGGAACAUUACCUUGUCCUUGGUGGCCAACCCUUCCCACCUUGAGGCCGCUGACCCCGUGGUGAUGGGCAAGACCAAAGCCGAACAGUUUUACUGUGGCGACACUGAAGGGAAAAAGGUCAUGUCCAUCCUGUUGCAUGGGGAUGCUGCAUUUGCUGGCCAGGGCAUUGUGUACGAGACCUUCCACCUCAGCGACCUGCCAUCCUACACAACUCAUGGCACCGUGCACGUGGUCGUCAACAACCAGAUCGGCUUCACCACCGACCCUCGGAUGGCCCGCUCCUCCCCCUACCCCACUGACGUGGCCCGAGUGGUGAAUGCCCCCAUUUUCCACGUGAACUCAGAUGACCCCGAGGCUGUCAUGUACGUGUGCAAAGUGGCGGCCGAGUGGAGGAGCACCUUCCACAAGGACGUGGUUGUCGAUUUGGUGUGUUACCGGCGCAACGGCCACAACGAGAUGGAUGAGCCCAUGUUCACGCAGCCGCUCAUGUACAAGCAGAUCCGCAAGCAGAAGCCUGUGUUACAGAAGUACGCUGAGCUGCUGGUGUCGCAGGGUGUGGUCAACCAGCCUGAGUAUGAGGAGGAAAUUUCCAAGUAUGAUAAGAUCUGUGAGGAAGCUUUUGCCAGAUCUAAAGAUGAGAAGAUCUUGCACAUUAAGCACUGGCUGGACUCUCCCUGGCCUGGCUUCUUCACCCUGGACGGGCAGCCCAGGAGCAUGUCCUGCCCCUCCACGGGUCUGACGGAGGAUAUUCUGACACACAUCGGGAAUGUGGCUAGUUCUGUGCCUGUGGAAAACUUUACUAUUCAUGGAGGGCUGAGCCGGAUCUUGAAGACUCGUGGGGAAAUGGUGAAGAACCGGACUGUGGACUGGGCUCUAGCGGAGUACAUGGCGUUUGGCUCGCUCCUGAAGGAGGGCAUCCACAUUCGGCUGAGCGGCCAGGACGUGGAGCGGGGCACAUUCAGCCACCGCCACCAUGUGCUCCAUGACCAGAAUGUGGACAAGAGAACCUGCAUCCCCAUGAACCAUCUCUGGCCCAAUCAGGCCCCCUAUACUGUGUGCAACAGCUCACUGUCUGAGUACGGCGUGCUGGGCUUUGAGCUGGGCUUCGCCAUGGCCAGUCCUAAUGCCCUGGUCCUCUGGGAAGCCCAAUUUGGUGACUUCCACAACACGGCCCAGUGUAUCAUCGACCAGUUCAUCUGCCCGGGACAAGCCAAGUGGGUGCGGCAGAAUGGCAUCGUGUUGCUGCUGCCCCAUGGCAUGGAGGGCAUGGGUCCAGAACAUUCCUCCGCCCGCCCAGAGCGGUUCUUGCAGAUGUGCAACGAUGACCCAGAUGUCCUGCCAGACCUUAAAGAAGCCAACUUCGACAUCAAUCAGCUAUAUGACUGCAAUUGGGUUGUUGUCAACUGCUCCACUCCUGGCAACUUCUUCCACGUGCUACGACGCCAGAUCCUGCUGCCAUUCCGGAAGCCGUUAAUUAUCUUCACCCCCAAAUCCCUGUUGCGCCACCCCGAGGCCAGAUCCAGCUUUGAUGAGAUGCUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-966.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1016.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 563.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((...........(((((((((((.....((((((((((....((((((((((......))))))...))))....))(((((((...........(((((...(((..(((((((((..((.(...(((((......))))).(((.((((((((......)))))))))))((((....))))).))...))))))).))..)))..))))).........))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).....)))((((((((....))))........(((((((((((........((((.(((...)))))))((((((...((((....((((((.(((...((((.(((....((((.....(((...)))..))))..))).))))....((((....))))........))).)))).))))))...)))))).((....)).))))))))))).(((((((..((((((.((((.(((....((.........(((((.((.....)))))))))...))).)))).))))))(((((.....))))).....(((((((.((............))))).)))).)))))))(((((.....)))))..(((((((((((((((..((((((...(((((((.((((((((((((.((((........))))..((((((((((((.(((((.(((.((.(((((((.(.((...(((.((......(((........)))......)))))....)))))))))).))))))))))..)))..(((((.((((......)))...).))))).(((((.((((((((....(..(((.(.((((..(((..((((((((((.......((((((.......))))))....((((((((((.(((((((((((((.(((.((((((((((.(((................((((.((((....(((.(((((((((...)))))...)))).)))....)))).)))).(((((..((((..((((((((......(((((..(((((.((.(((..(..(((......(.((((((((((((........))))))...)))))))......)))..)..))).))...)).))).)))))((((((((.((((...(((..(((((...))))))))....((....)).....)))).))))))))..(((.((((((((((((((((.((((......))))..)))))........((((.(((.(((...((((((............))))))...)))..((((((((.....(((((((((((...(((((....(((.(((.((...((((((((.......((((....))))..((.((((.(((((....))))).)))).)).((((............((((((((((((....))))...)))))))))))))))))))).)).)))...)))..))))).)))))))))))(((((...))))).))))))))...))).)))).(((((((.(((((((((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).))))......(((((.(.(((...((((((((.((((..((((.....))))..))))..))(((((((..((((...))))..))))))).(((((......)))))((.......))...)))))))))).)))))..((((.(((((((((......((((((..((......))..))))))((((((((((((..(((((....))))).......((((((.(.(((((((((((....(((((((...........))))))))))))).))))).)))))))))))))))))))....)))))))))))))..))))))))))))))....(((((((((((((((((((.(((((((((((((.....)))...)))))..))))))))).))))....(((((((.......))).))))..))))))))))).((.(((.....))).)).........)))))))))))))))))))))))))).))))))))))))...)))))))))..((((((..((((.(((((...)))))))))..))))))(((((((.(((.((((((..(....)..))))))...))))))))))....(((......))).......))))).)).)))).))...)))))))..))).....((.((((..((((.(((((((((((......)))).))))))))))))))).))))))))).)))..)))......))))))))..))))))))).)))))(((....))).(((((((((((((((((...............((((....))))))))))...((((.....).)))....)))))))))))..)))))))))...(((((......................))))).....(((.((.....)).)))..........)))))))))..)))...))))).)).......))))))..)))))))..)))).))))..))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({(((({,..,,,,.,,,,((((((((((((.....((((((((.(((..,,,,((((((......)))))),,,|,||({..{{{{{{{{{{.,....,.,.{((((((((((..({{,{{{{{..,,,,,..(((((......))))).|}|}||||||((,{,...}}}}},)))|}{{{{....}}}}}})},.,))))))).)),.))}.,}))))...........,,,))})))))))))))))))))))))}}))|}}}}.,,..))}{{({(({(....}))).,|||{{..{{{,{,,,,,,{{{{{{{((((.{((...)))))))((((((.,...{{|,|||,..)))))),..}))}})),....((((....((..((((((((((...{,{.((..(((..((((((((((.((((..{({,,,{.((((((..,.{(((...)))|{....,,.(((((.(((((((....))))))).)))}),)))))).,}}....,,,,,.{((((.((.....)))))))..)))).)))}}))))))))).}))}..,,.))))))))))..)),,.}},}.........})))))}.|}},....,,..,||}},}}.{((({..(((((((((((((((..((((((...(((((((.{(((((((((((.((((........))))..((((((((((((.(((((.((,{((.(((((((.(.((...(((.((......(((......,,)}},.....))))).,..)))))))))).))))))))))..)))..(((((.((((......)))...}.))))).{((((.((((((((....{..(((.(.((((..(((..((((((((((....,,.((((((.....,}})))))....((((((((((.(((((((((((((.((,{((((((((((.((((({.{{{,,,,....,|||,.,||{,,..|||}{{{,(((((...)))))}..,}}..,||,.(((((....))))),,})}((({.,((((((((......(((((..(((((.(,.{({,,{,.(({......{.((((((({{(((..{{....,,))))}}}))))))|......}}}..,..})},)},},)).))).)))))((((((((.((((...(((..{((((...})))))))....||....)}.....)))).))))))))..(((.(((((((((((,{{,{.{{(({{,{{{||,,.,|||,,.,,,,||.{{((,(({.(((,,.((((((............)))))).,{||},,((((((((.,,,,(((((((((((...(((((.{..(((.(((.((...((((((((..,....{((({.{{||||...({((((.(,,,,...}))))).))))}),...,|,,.,|.......((((((((({{{....,)},..))))))))),.).)))))))).)).)))...))).}))))).))))))))))){||||...|}}}}.,)))))}}...}}}.}))}.{{((((|,(({(((|((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).))))..,,,||{{||,|.{{||..((((((,{.((((..((((,...,))))..))))..,,(((((((,{(({....}))),,))))))).{((((......))))}((.......))...))))))))}}.)))))}}({((.(((((((((......((((((..((......))..))))))((((((((((((,.(((((....))))).,.....((((({,(.(((((((((((,{{...(((((....,}},)..}.))))})))))),})))).)))))))))))))))))))....))))))))))))).,})))))))))))))....(((((((((((((((((((.((((((((((,{.{{....)).,.)))))..)))))))))}})))..,.(((((((.......))).)))),.))))))))))).||.|||....,))).},.,.....,.))))))))))))))))))))))))))..))))}))))))...)))))))))..{(((((..((((.(((((...)))))))))..)))))}(((((((.(((.((((((..(....)..))))}),..))))))))))....{{(,,....})),......))))},)).)))).))...))))))}..))).....((.((({.,((((.(((((((.,,({{....)))).))))))))))))))).))))))))).)))..)))......))))})))..,)))))))).))))|(((....))),(((((((((((((((((...............((((....))))))))))...((({.....}.,})....)))))))))))..)))))))))...(((((..,.........,,.....,..))))).....(({.((.....)).})).,........))))))))),,)}}...))))).)).......))))))..)))))))..)))).))))})))).)
Back