Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_OGDH_0002000
Sequence Length
947 nt
GC Content
0.4720
UUGUGAAAAACUUCAGGACAAAAAUGUUUCAUUUAAGGACUUGUGCUGCUAAGUUGAGGCCAUUGACGGCUUCCCAGACUGUUAAGACAUUUUCACAAAACAGACCAGCAGCAGCUAGGACAUUUCAACAGAUUCGGUGCUAUUCUGCACCUGUUGCUGCUGAGCCCUUUCUCAGUGGGACUAGUUCGAACUAUGUGGAGGAGAUGUACUGUGCUUGGCUGGAAAACCCCAAAAGUGUACAUAAGGUAAGGCUCGCAGGGCUGUGGGUCUGCCUCAUGUUGGUGUGUUGGCCUGUUCCUGACUGGUCACCAGGUAAGUGUGUGCGUCCUGAGGAGUCAGCGGGCAGACAGGCAGCUGGAGCGCCAUACCAACCACCGUAUCUGUAUCGGACCCAGCAUAGCCCCAGCAGAAGCCAUGGUCCCUGGAUUGGCGUCCAGCAGUAGACACUGUGCUUAACUCUGCGAGGAUGUGAAGAAGCAUGUGUGUGACCCUCCAGCAUCUCCGCAAGGGCUGCUUCAGGAUGAAGCCGCUGAAGAAAGAAGAAAGAAAGAAAGUGUGUGGAAAAGAGCAGGACCUCAGGAAGCUCCUCCAUUCUAACUGUCUGGAGAGGAUACUUUCAUUUGUAACAUGCCGUAGUCACCUCAUGUAAUUUCUGUAUGAAUGGCCUUUUAGCUCAUUAUGUUCGUAUUUUUUUCCUGUUUGUUUCUAACUUCUCUGUAUUACAUAUAAGGGCAUUUUCUAAACUUUUCACCACAUGAUUACUGAUGUAAGUCAUGUCUUGUUUUUUUUGGUUUGUUUUUGUUUUUGUUUGUUUUGUUUUGUUUCAGACAGAGUCCCACUGUUGUCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGGGAUCUCGGCUUGCUGCAACCUCCGACUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUUAUGCCUCAGCCUCCCGAGUAACUGGGACUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-289.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -310.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 226.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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