Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_OGDH_0003200

Sequence Length

1293 nt

GC Content

0.5669

UCAUGGGACAUUUUUUUUCGCAACACGAAUGCCGGAGCCCCACCGGGCACUGCCUACCAGAGUCCCCUUCCCCUGAGCCGAGGCUCCCUGGCUGCUGUGGCCCAUGCACAGUCCCUGGUAGAAGCACAGCCCAACGUGGACAAGCUCGUGGAGGACCACCUGGCAGUGCAGUCGCUCAUCAGGGCAUAUCAGAUACGAGGGCACCAUGUAGCACAGCUGGACCCCCUGGGGAUUUUGGAUGCUGAUCUGGACUCCUCCGUGCCCGCUGACAUUAUCUCAUCCACAGACAAACUUGGGUUCUAUGGCCUGGAUGAGUCUGACCUCGACAAGGUCUUCCACUUGCCCACCACCACUUUCAUCGGGGGACAGGAAUCAGCACUUCCUCUGCGGGAGAUCAUCCGUCGGCUGGAGAUGGCCUACUGCCAGCAUAUUGGGGUGGAGUUCAUGUUCAUCAAUGACCUGGAGCAGUGCCAGUGGAUCCGGCAGAAGUUUGAGACCCCUGGGAUCAUGCAGUUCACAAAUGAGGAGAAACGGACCCUGCUGGCCAGGCUUGUGCGGUCCACCAGGUUUGAGGAGUUCCUACAGCGGAAGUGGUCCUCUGAGAAGCGCUUUGGUCUAGAAGGCUGCGAGGUACUGAUCCCUGCCCUCAAGACCAUCAUUGACAAGUCUAGUGAGAAUGGCGUGGACUACGUGAUCAUGGGCAUGCCACACAGAGGGCGGCUGAACGUGCUUGCAAAUGUCAUCAGGAAGGAGCUGGAACAGAUCUUCUGUCAAUUCGAUUCAAAGCUGGAGGCAGCUGAUGAGGGCUCCGGAGAUGUGAAGUACCACCUGGGCAUGUAUCACCGCAGGAUCAAUCGUGUCACCGACAGGAACAUUACCUUGUCCUUGGUGGCCAACCCUUCCCACCUUGAGGCCGCUGACCCCGUGGUGAUGGGCAAGACCAAAGCCGAACAGUUUUACUGUGGCGACACUGAAGGGAAAAAGGUCAUGUCCAUCCUGUUGCAUGGGGAUGCUGCAUUUGCUGGCCAGGGCAUUGUGUACGAGACCUUCCACCUCAGCGACCUGCCAUCCUACACAACUCAUGGCACCGUGCACGUGGUCGUCAACAACCAGAUCGGCUUCACCACCGACCCUCGGAUGGCCCGCUCCUCCCCCUACCCCACUGACGUGGCCCGAGUGGUGAAUGCCCCCAUUUUCCACGUGAACUCAGAUGACCCCGAGGCUGUCAUGUACGUGUGCAAAGUGGCGGCCGAGUGGAGGAGCACCUUCCACAAGGACGUGGUUGUCGAUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-450.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -475.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 350.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((.((.........)).)).((((....(((((((((((.(((...((((((.((((.....((((((((((((((.(((...)))))))((((((.....(((.(((...))))))....)))))).....((((....((..((((((((((...(.(.((..(((..((((((((((.((((..(((((((.((((((..(.((((...)))).)......(((((.(((((((....))))))).))))).))))))..))....))))).(((((.((.....)))))))..)))).))).))))))))))..))).)...))))))))))..))...)))).........))))))).)))......(((((((.(((.((((..(((.((((.(((((.(.(.(((((...(((((((.....((((...(((..(.(((((...(((.(((.(...((.((((.((.((.(((....))).))..)).)))).))..).))).)))...))))).)..)))..))))))))))).)))))).).))))).))..))..))).....)))).))).)))))))((((((((..........((((((.((.(((.(.((........)).).))).)).))))))((((((.......))))))...(((((((..(((.(....).))).)))))))..))))))))..((((((((........))))..))))(((.(((.((..(((((...))))))).)))..)))....))))))))))))).)).)))))))))...))))..(((((((((((.((.(((.....((((.(((..((((((....(((((((((((.(((((.((((((((((((.................)))))))...(((((....)))))..........(((..(((((...))))))))........)))))..))))).))))...))))))))))))).))).))))...))))).)))))....)).))))..(((...((((....(((...((((((............)))))).)))....))))..)))......(((((((((...(((((....(((.(((.((...((((((((.......((((....))))..((.((((.(((((....))))).)))).)).((((............((((((((((((....))))...)))))))))))))))))))).)).)))...)))..))))).)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,{.(({......,{{{{,,,((({,.{,(((((((((((.(((...((((((.((((,{{,.((((((,{{((((({(((,..}}|||}}((((((.,...(((.(((...))))))...}))))))}}...((((....((..((((((((((...(,{.((..(((..((((((((((.((((..{({,,,{.((((((..,.{(((...)))|,,...,,.(((((.(((((((....))))))).)))}),)))))).,}}....,,,}}.{((((.((.....)))))))..)))).))),}))))))))).,))}..,,.))))))))))..))...)}})...,{{{.({((((({(.,,......(((((((.(((.((((,.{{.{((,{.(((((,{,(,{((({.,,((((((,....{((((...(((,.(.(((((...(((.(((.(...((.((((.((.((,(((....))),),}}}),)))).))..).))).)))...))))).),.)))..))))))))))).))}}},,},)}))).,),,)}..,}},}}.})))).))).)))))))})))})))}}}}}.||||||||{|.|{.(({{(((({{({{.,.{{.{{((((((.||||,,{{,,{|....,})),|||,...(((((((..({{.{....,.))).)))))))},).))))))))..|}.|))))))}}}...}}}.,}}))}})),}}||{{(((((...))))),...,,...,,....))))))))))))).)).)))))))))...}}}}..{,,{||(((((.((.(((.....((((.(((..((((({...,(((((((((((.(((((.(((((((((({{.........,,,...,.}|}}}}},.,{,{|||}},}||||.....||...(((..{((((...))))))))..,,,,..})))}..))))).))))...))))))))))))).))).))))...))))).))))),,,,))|))|)||||,...((((....(((...((((((............)))))).))),...)))),.)))......(((((((((...(((((,{..({(.(((.((...((((((((..,....{((({.{{||||...({((((.(,,,,...}))))).))))}),..,,|,,.,|.......((((((((({{{....,)},..})))))))),.).)))))))).)).)))...})).}))))).)))))))))