Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_OGDH_0005300
Sequence Length
1949 nt
GC Content
0.4741
GUGUGAGCCUCCAUGCCUGGCCAGAAUCCCCUCUUUUUGGUCAGGAAGAGUGACAUUGCCCUUCAAGGUGGCUUGGUUCCCUGUCCAGGUUUGAGGAGUUCCUACAGCGGAAGUGGUCCUCUGAGAAGCGCUUUGGUCUAGAAGGCUGCGAGGUACUGAUCCCUGCCCUCAAGACCAUCAUUGACAAGUCUAGUGAGAAUGGCGUGGACUACGUGAUCAUGGGCAUGCCACACAGAGGGCGGCUGAACGUGCUUGCAAAUGUCAUCAGGAAGGAGCUGGAACAGAUCUUCUGUCAAUUCGAUUCAAAGCUGGAGGCAGCUGAUGAGGGCUCCGGAGAUGUGAAGUACCACCUGGGCAUGUAUCACCGCAGGAUCAAUCGUGUCACCGACAGGAACAUUACCUUGUCCUUGGUGGCCAACCCUUCCCACCUUGAGGCCGCUGACCCCGUGGUGAUGGGCAAGACCAAAGCCGAACAGUUUUACUGUGGCGACACUGAAGGGAAAAAGGUAAGGCCCAGAGAGAGGCGUGCAAGGCAGAUCGUCAAGGCCCCAUGUUCCAGCAUGGAGUUCCGCUCACCAACAUAACCCAGAGCCCUGGGUGCAUCUAGACUUUAAAAAAAUAUUUAAAGUCGGCCGGGCGCAGUGUCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGCAGAUCACCUGAGUUCGGGAGUUGGAGACCAGCCUGACCAACAUGGAGAAACUCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGCGCGCGCCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUUACGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCCAACAAGAGCGAAACUCUGUCUCAAAGAAAAAAAUAAAUAAAUAAAAAAUAUAUGUAUAUGUAUGUAUGUGUGUGUGUGUGUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUUUAAAAUCAACUUUUAAAGAAUAGCAAUAGUAAAACAGUCCUGCUUACAGUGUUCCUUUUCCUGAAGUUGUAAUUGUCAGAACUAUGUGGGAAGUUUGCUUUUGUCUUCACCAAAUCUGUUAAGGAGCCAGGUUGCAGUUAUUCUGAAUGGACAGAGAUGUUUUCACUGAAAAGGAGGGGAGUCUGAGAGUCUCUGUAAGGAAAAAGUGUAGGUGAGCCUGAAGGAGAAAUUGUAGAACUGAGACUUGUCAGGAGAGUCAUGCUUGCUGUGAUUAGAGGCGGGAGUUCACGGGCUGGUAGGAGACGGAGGAGGGCACAGACUGCAGGCAGGUGGGGUCCUGCUUCACCAUUUCUGGUCAUGUGACUGAGUGUUGGGGGUUGACUCGCCUGCCUGCUUGUGUAGAAAUAGUCUCAACAGAUUGUAACAAUUUGCCCUUAUUUAACUUCAAGAUAGAAUCUUGUCUGACAAAUUUUAUAUUUCCUAUUAAUGAUGACCUAAAAACCAAAUAAUCAGAAAAAAAAUCAAAUAUUUGUAAUGUCUUAUGUAUGGGUUCUGGGAAACAUAUAAAGAAGGCAUCACCACUUUUCUCUCCAGAGCCUCCUGUUCUUUUUAGAAAAAAGGUCGUGUGUAAAGAAGCAAAUAGCACAUACACGGCAUGAUAGGAAACUGGAGUUAGCCGUGAAGAGCUUUGGAAGAGGUGUGCAGGGGUGUGGGCUAGAGUUGGACCAAGGAUAGAAGGCACACCCCUUAGUAGCAGAGCAGGUAGUUGUCAUUUUAUUUGAGAAGUGGCAGGAUUUAGGGAGGUGGGAAGGGAAGAAUGUUUUCUGGAGAUGAAAGGUAAGAGCAAAGAUGUAGGGGGAAUUGGGGACACAGAGCAGGGAGGGGCCGGCCUCCUAGUUGUGCCCUGGAAAGAAGUCAGGUCUAUGUUAGAAGUGGAACCAAUUGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-653.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -692.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 424.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......)))))(((((((....((((((((((((.((.......((((...(((((....(((((((((((........)))))..(((((....))).))(((..(((.((((((((..........((((((.((.(((.(.((........)).).))).)).))))))((((((.......))))))...(((((((..(((.(....).))).)))))))..)))))))).)))...)))((((.((.....((((.....((((((...(((((...)))))........((((.(((((....)))))..))))))))))...)))))))))).)))))))))))....)))).(((.((....)).)))((((((((((........))))))...))))(((..(((((((((((((..(((((((...(((.(((((.(((......)))..(((..(((((...))))))))..)))))..))).....)))..)))).....(.(((((((..(((((...((((..((((.(((((....)))))((((...)))).........((((((....)))))).......(((((((((......))))))))))))).))))...)))))))))))).)..((((((....)))))).(((......)))......(((((((((((..(((((...)))))....))...((((((...))))))..(((((((..........)))).)))(((((....)))))((((((..((...((((((.(((.((.((((((((.((..((((((...((((((...(((((..(((((((.((.........)))))))))))))).)))))).......))))))..))))))))))......................(((((((((((((((((((((((((((((......)))))))))))))))))))))))))))))........((((((.....((((..((((...(((.((((((..(((.....((((((((.((((((.(............((((((....((((((((((.....(((..((((((.........))))))........((((......))))(((.((((..((((((((((.(((((((((((((..(((....)))((((((...(((((((((..........((.(((((((((((.(((((((((((.((...((((..(((((.((.((((((.(((.((((.(((....(((((........((((((...(((((((((((((.((...(((((.(((((..((((....))))))))).)))))...))))))))))))))))))))).......)))))..))).)))))))..)))))))).)))..))..))))...)).))))..))))))).)))))......((((..((((.(((........((((((....((.......))...))))))....)))))))..)))))))))).))............)))).))))))))))))))).))))..))))).))))))))))..)))).)))))).....))))))))))..))))))((((((((..(((....)))..))..)))))).).))))))))))))))))))))))).)))..))))..)))).........)))))).....))))).)))))).))))))))...(((((((((......))))))))))))))))))))))))))))))).((((....))))..........)))..)).)))))).).))))).....((((.(((((....((((((......))))))..)))))))))............(((((((.......)))).)))...)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......)))))(((((((,..{((((({((((((,((..,..{.(((({{,(((((....(((((((((((,,,,...,|||||{{(((((,,,,||}.}|{{(..(((.((((((((..........((((((.((.(((.{.(({{......}}}},))).)).))))))((((((,....,}})))))...(((((((..({{.{....,.))).)))))))..)))))))).)))...)}||||{.|,..,,,{,{|,,...{|{||{,{,(((((...))))),..,,,..{(({.{((((....)))))..})},)))))),}.}}}}}}))}},)))))))))))}),.})))}.|,.||,|,.,,,.((((((({,(((,.{{....,,))))}}}))))))}..(((((((((((({..,{((,((,,.{((.{(((,.(((......)))..|||,.{(,(({{{|||||,||..,,|||,,|||.....||}..,}))},...(.(((((((..(((((...((((..((((((((((....)))))|{({...}}},.........((((((....)))))).......(((((((((......))))))))))))).))))...)))))))))))).}..(((({,....|})))}.{||,,}}}}}}}...,|.(((((({{{{((,({(((,,.,,,,||||.....,{{||{{...)))))},,},................{{(({(((,{{{..{{|.,,}))),.,..,)))})}}}}}}}}}.}|,((((((({{((..((((((...((((((...(((((..(((((((.((.{......})))))))))))))).)))))).......))))))..)))))))))}......................(((((((((((((((((((((((((((((......)))))))))))))))))))))))))))))........}}}}}...,....}}.,}}}}}}}||..|(((((((,..,,,..((((((((.((((((.{............((((((....((((((((((.....(((..,{(((({,....,,.||}}}}.,,,....||||....,,))))(((.((((..((((((((((.((((((((({(((..{,,....|||((((((,..(((((((((..(((({{..,{{((({{.{{{{{.(((((((((((.((.,.((((..(({{.,((.((((((.(((.(((,.(((....(((((........((((((...((((((((((((({((...(((((.(((((..((((....))))))))).)))))...))))))))))))))))))))).......)))))..))).,))))))..))))))})}).}..))..)))).,.)}.)))}.,))))))).)))))},}))))).,..,{{,,,.{{{,....,({,(({,,.,({.......,,...,}}))}.....||||,||||||},||.}},),..))),,,,,..)))).)))))))))))))))}))))..))))).))))))))))..)))).)))))),,...))))))))))..))))))(((((({(..(((....)))..))..)))))).}.)))))))))))))).,|}}(((((((((..(((...(((...)})...)))....)))))))))..,,,,}.)))))))....(((((((((......))))))))))),,))}))))))))))))))).,{{,...,||}}......,,..,,,..)).)))))}.}.}))))),..{((((.((((,.,{.((((((......)))))).,))))))))),,........,.(((((((.......)))),,))..,)))))))
Back