Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_OGDH_0006100

Sequence Length

880 nt

GC Content

0.5614

GUUUGAGGAGUUCCUACAGCGGAAGUGGUCCUCUGAGAAGCGCUUUGGUCUAGAAGGCUGCGAGGUACUGAUCCCUGCCCUCAAGACCAUCAUUGACAAGUCUAGUGAGAAUGGCGUGGACUACGUGAUCAUGGGCAUGCCACACAGAGGGCGGCUGAACGUGCUUGCAAAUGUCAUCAGGAAGGAGCUGGAACAGAUCUUCUGUCAAUUCGAUUCAAAGCUGGAGGCAGCUGAUGAGGGCUCCGGAGAUGUGAAGUACCACCUGGGCAUGUAUCACCGCAGGAUCAAUCGUGUCACCGACAGGAACAUUACCUUGUCCUUGGUGGCCAACCCUUCCCACCUUGAGGCCGCUGACCCCGUGGUGAUGGGCAAGACCAAAGCCGAACAGUUUUACUGUGGCGACACUGAAGGGAAAAAGGUCAUGUCCAUCCUGUUGCAUGGGGAUGCUGCAUUUGCUGGCCAGGGCAUUGUGUACGAGACCUUCCACCUCAGCGACCUGCCAUCCUACACAACUCAUGGCACCGUGCACGUGGUCGUCAACAACCAGAUCGGCUUCACCACCGACCCUCGGAUGGCCCGCUCCUCCCCCUACCCCACUGACGUGGCCCGAGUGGUGAAUGCCCCCAUUUUCCACGUGAACUCAGAUGACCCCGAGGCUGUCAUGUACGUGUGCAAAGUGGCGGCCGAGUGGAGGAGCACCUUCCACAAGGACGUGGUUGUCGAUUUGGUGUGUUACCGGCGCAACGGCCACAACGAGAUGGAUGAGCCCAUGUUCACGCAGCCGCUCAUGUACAAGCAGAUCCGCAAGCAGAAGCCUGUGUUACAGAAGUACGCUGAGCUGCUGGUGUCGCAGGGUGUGGUCAACCAGCCUGAGUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-307.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -321.75

Frequency: 0.0000

Diversity: 172.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((..((((.......(((..(((.((((((((..........((((((.((.(((.(.((........)).).))).)).))))))((((((.......))))))...(((((((..(((.(....).))).)))))))..)))))))).)))...))))))).))))).((((......((.(((((.(((((...)))))........((((...((((((.(..(....)..).)))))).....))))(((((((((((.((.(((.....((((.(((..((((((....(((((((((((.(((((.((((((((((((.................)))))))...(((((....)))))..........(((..(((((...))))))))........)))))..))))).))))...))))))))))))).))).))))...))))).)))))....)).))))..((((...(((((..(((((.((((((............)))))).((((.((((((((((((((((((((((((((...(((((....(((.(((.((...((((((((.......((((....))))..((.((((.(((((....))))).)))).)).((((............((((((((((((....))))...)))))))))))))))))))).)).)))...)))..))))).))))))))))).))))...(((......)))...........)))))..)))))).))))((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).))))..))))).))))).))))..)))))))....)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((..((((.......(((..(((.((((((((..........((((((.((.(((.{.(({{......})}).))).)).))))))((((((,....,,})))))...(((((((..({{.{....,.))).)))))))..)))))))).)))...))))))).))))).(((({{{,..((.(((((.{(({(,,.||}}},...,,..{(((.,{(((,,,.|}}|}..,)},),)})})),,,,.)),.(((((((((((.((.(((.....((((.(((..((((({...,(((((((((((.(((((.((((((((((((.........,,,.....}|}}}}},.,{,|||}}|,}|||}.....,}...(((..{((((...))))))))..,,,,..}))))..))))).))))...))))))))))))).))).))))...))))).)))))....)).))))..((((...(((({,.(((((,((((((............)))))).((((.((((((((((({(({(((((((((((...(((((.{..(((.(((.((...((((((((..,....{((({.{{||||...({((((.(,,,,...}))))).))))}),...,|,,.,|.......((((((((({{{....,)},..))))))))),.).)))))))).)).)))...))).}))))).))))))))))).}}}}..,({{....,,))),|.......,,)))))..)))))).))))((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).)))),.))))).))))).))))..))}})))},..}))).