Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_OGDH_0006600
Sequence Length
1404 nt
GC Content
0.5705
GGCUCCGGAGAUGUGAAGUACCACCUGGGCAUGUAUCACCGCAGGAUCAAUCGUGUCACCGACAGGAACAUUACCUUGUCCUUGGUGGCCAACCCUUCCCACCUUGAGGCCGCUGACCCCGUGGUGAUGGGCAAGACCAAAGCCGAACAGUUUUACUGUGGCGACACUGAAGGGAAAAAGGUCAUGUCCAUCCUGUUGCAUGGGGAUGCUGCAUUUGCUGGCCAGGGCAUUGUGUACGAGACCUUCCACCUCAGCGACCUGCCAUCCUACACAACUCAUGGCACCGUGCACGUGGUCGUCAACAACCAGAUCGGCUUCACCACCGACCCUCGGAUGGCCCGCUCCUCCCCCUACCCCACUGACGUGGCCCGAGUGGUGAAUGCCCCCAUUUUCCACGUGAACUCAGAUGACCCCGAGGCUGUCAUGUACGUGUGCAAAGUGGCGGCCGAGUGGAGGAGCACCUUCCACAAGGACGUGGUUGUCGAUUUGGUGUGUUACCGGCGCAACGGCCACAACGAGAUGGAUGAGCCCAUGUUCACGCAGCCGCUCAUGUACAAGCAGAUCCGCAAGCAGAAGCCUGUGUUACAGAAGUACGCUGAGCUGCUGGUGUCGCAGGGUGUGGUCAACCAGCCUGAGUAUGAGGAGGAAAUUUCCAAGUAUGAUAAGAUCUGUGAGGAAGCUUUUGCCAGAUCUAAAGAUGAGAAGAUCUUGCACAUUAAGCACUGGCUGGACUCUCCCUGGCCUGGCUUCUUCACCCUGGACGGGCAGCCCAGGAGCAUGUCCUGCCCCUCCACGGGUCUGACGGAGGAUAUUCUGACACACAUCGGGAAUGUGGCUAGUUCUGUGCCUGUGGAAAACUUUACUAUUCAUGGAGGGCUGAGCCGGAUCUUGAAGACUCGUGGGGAAAUGGUGAAGAACCGGACUGUGGACUGGGCUCUAGCGGAGUACAUGGCGUUUGGCUCGCUCCUGAAGGAGGGCAUCCACAUUCGGCUGAGCGGCCAGGACGUGGAGCGGGGCACAUUCAGCCACCGCCACCAUGUGCUCCAUGACCAGAAUGUGGACAAGAGAACCUGCAUCCCCAUGAACCAUCUCUGGCCCAAUCAGGCCCCCUAUACUGUGUGCAACAGCUCACUGUCUGAGUACGGCGUGCUGGGCUUUGAGCUGGGCUUCGCCAUGGCCAGUCCUAAUGCCCUGGUCCUCUGGGAAGCCCAAUUUGGUGACUUCCACAACACGGCCCAGUGUAUCAUCGACCAGUUCAUCUGCCCGGGACAAGCCAAGUGGGUGCGGCAGAAUGGCAUCGUGUUGCUGCUGCCCCAUGGCAUGGAGGGCAUGGGUCCAGAACAUUCCUCCGCCCGCCCAGAGCGGUUCUUGCAGAUGUGCAACGAUGACCCAGAUGUCCUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-539.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -562.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((((.((...(((((((((((.((.(((.....((((.(((..((((((....(((((((((((.(((((.((((((((((((.................)))))))...(((((....)))))..........(((..(((((...))))))))........)))))..))))).))))...))))))))))))).))).))))...))))).)))))....)).))))..((((...(((((..(((((.((((((............)))))).((((.((((((((((((((((((((((((((...(((((....(((.(((.((...((((((((.......((((....))))..((.((((.(((((....))))).)))).)).((((............((((((((((((....))))...)))))))))))))))))))).)).)))...)))..))))).))))))))))).))))...(((......)))...........)))))..)))))).))))((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).))))..))))).))))).))))..((((((((.((((..((((.....))))..))))..))(((((((..((((...))))..))))))).(((((......)))))((.......))...)))))))))))))..))))(((((((((((((......((((((..((......))..))))))((((((((((((..(((((....))))).......((((((.(.(((((((((((....(((((((...........))))))))))))).))))).)))))))))))))))))))....)))))))))..(((((.(((((((((((.....(((((((((((((((((((.(((((((((((((.....)))...)))))..))))))))).))))....(((((((.......))).))))..))))))))))).((.(((.....))).))(((((.....(((....))).....)))))((((......))))........(((.....)))(((((..((((.(((((...)))))))))..)))))((((((((.(((.((((((..(....)..))))))...)))))))))))...(((......)))......))))))))...((((((....((.(((((((..(((((..((((..((((.(((((((((((......)))).)))))))))))))))..((((((.(((.........)))))))))...(((.....)))))))).))))))).))..)))))).))).).)))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((((.((...(((((((((((.((.(((.....((((.(((..((((({...,(((((((((((.(((((.((((((((((((.........,,,.....}|}}}}},.,{,|||}}|,}|||}.....,|...(((..{((((...))))))))..,,,,..}))))..))))).))))...))))))))))))).))).))))...))))).)))))....)).))))..((((...(((((..(((((,((((((............)))))).((((.((((((((((({(({(((((((((((...(((((.{..(((.(((.((...((((((((..,....{((({.{{||||...({((((.(,,,,...}))))).))))}),...,|,,.,|.......((((((((({{{....,)},..))))))))),.).)))))))).)).)))...))).}))))).))))))))))).)}}}..,({{....,,)}).,.......,,)))))..)))))).))))((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).)))),.))))).))))).))))..((((((,{.((((..((((,...,))))..))))..,,(((((((,{(({....}))),,))))))).{((((......))))}((.......))...)))))))))))))..))))(((((((((((((......((((((..((......))..))))))((((((((((((,.(((((....))))).,.....((((({,(.(((((((((((,{{...(((((....,}},)..}.))))})))))),})))).)))))))))))))))))))....)))))))))..(((((.(((((((((({.....(((((((((((((((((((.((((((((((,{.{{....)).,.)))))..)))))))))}})))..,.(((((((.......))).)))),.))))))))))).{{.(((....,}||.},(((((.....(((....))).....)))))((((......))))...,...,|{{|,.,..,{(((((..((((.(((((...)))))))))..)))))|(((((((.(((.((((((..(....)..))))}),..)))))))))),...{{(,,....})),..,,,))))))))...((((((....((.(((((((..(((({..((({.,((((.(((((((.,,({{....)))).))))))))))))))).{((((((.(((.........)))))))))}.{(((.....))))}))).))))))).))..)))))).))).).)))).))))
Back