Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_OGDH_0009500

Sequence Length

709 nt

GC Content

0.4979

GAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGUGGACGUUGCAGUGAGCUGCUAUCACGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAAUAAGAGCAAAACUCCGGCACAAAAAAAAAAAAAAAAGUCCCAUGAUACCAGAUGAGGGAGGUCACAGCUUACAUUCACGUUGGUCAAAUGACAUGUCUUAACAUGCAGCCCAGGAGCUGUUGCCUCUCACCUGCAAAUGCCCCCAAGGACUCCACUAGAGGCAAUUAAGUAUGUCCAAGAUUGAGGGUUAGUGCCGCUGCCUGCGGCCUCCUUCAGCAGGUGAGUGGCAGCUCACCACUGGCUCAGAGGCCCAGCCCCAAAGCAAGCCCUUCAGGACAGAGAAAAAAACACUGGACGGCAGGUCCUGCCAAGUCACAUGCCAGCUGCACUUGUGUGAAGGGAGACCCAUAACAUUGAGAUUUCUAUAGGGACAGUGGAGUGCAGGAUGUUGACACAGCCUUUACCACCCACCAGGGGUCACCAGGCCAGGAAGCCUGCAUCCCACCAGUCACCAAACCCCCUUUAGUCUUCAAUCAAGGUGAGCCCCUUGUUUUUUGGGGGUUUUUUCCCAAUCUUUUUUUAUUUUUAAUUUUAUUUAUUUAUUUAUUUAUUUAUUUUUGAGACGGAGUCUCGCUCUAUCGCUCAGGCUGGAGUGUGGUGGCACAAUCUCGACUCACUGCAAGCUCCACCUCCCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-259.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -271.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 147.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.............)((.(((((((((..((((((((((.((.......((((((((((((((((((((((.(((.((((...((((((...(((((((((.((((((((..((.((((...(((((((((.(((..(((((..(((.....((((.....((.(((((....)))))))...(((((.((((((((.(((((((((............((((...(((.((.....)).)))..)))).....((((((..((.(((((.....)))))))))))))))))))))).)))))).........(((..(.(((...))).)..)))..(((.(((((................))))).))))).))))))))).....)))..)))))(((....)))...(((((.(((......)).).)))))...(((((.((((.(((((((...(((.....((((.....((((.....))))....)))))))....))))))).))))..))).))..))))))))..))))...)))).)).((((((((........)))))))).........)))))))).))).............................))))))...))))))...))))))).)))))))))))))))))))))).......)).))))))))))..))))))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.........,...)((.(((((((((..((((((((((.((.......((((((((((((((((((((((.((,{((((.,.((((((.,.(((((({((,((((((((,,((.((({...(((((((((.(((..(((((,.,......,{{((,,...{(.(((((....)))))}|{{|||{||||||{((((.(((((((((...,{{{.....((,{...,||.|,}}},.,,.,,,..}}}}.....((((((..((.(((((.....)))))))))))))))))))))).)))))),,.,..,|}|||..{.{|{...}|,.,..,))..{((,(((((................)))}},|||,{,|,}})}}...|{{{|||{.,,,,)}},.,}})))},}|||||}}|,......}|,|.,..},...(((((.((((.(((((((...(((.....((((.....,(((....}))}}....)))))))....))))))).))))..))).))..}))))))}..))))...)))).)).||((((((........))))))},.........)))))))}.,},,,.........,,..........,...,.}))))).,.)))))).,.))))))).)))))))))))))))))))))).......)).))))))))))..))))))))).))