Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_OPRM1_0000600
Sequence Length
1277 nt
GC Content
0.4354
AUACACCAAGAUGAAGACUGCCACCAACAUCUACAUUUUCAACCUUGCUCUGGCAGAUGCCUUAGCCACCAGUACCCUGCCCUUCCAGAGUGUGAAUUACCUAAUGGGAACAUGGCCAUUUGGAACCAUCCUUUGCAAGAUAGUGAUCUCCAUAGAUUACUAUAACAUGUUCACCAGCAUAUUCACCCUCUGCACCAUGAGUGUUGAUCGAUACAUUGCAGUCUGCCACCCUGUCAAGGCCUUAGAUUUCCGUACUCCCCGAAAUGCCAAAAUUAUCAAUGUCUGCAACUGGAUCCUCUCUUCAGCCAUUGGUCUUCCUGUAAUGUUCAUGGCUACAACAAAAUACAGGCAAGGUUCCAUAGAUUGUACACUAACAUUCUCUCAUCCAACCUGGUACUGGGAAAACCUGCUGAAGAUCUGUGUUUUCAUCUUCGCCUUCAUUAUGCCAGUGCUCAUCAUUACCGUGUGCUAUGGACUGAUGAUCUUGCGCCUCAAGAGUGUCCGCAUGCUCUCUGGCUCCAAAGAAAAGGACAGGAAUCUUCGAAGGAUCACCAGGAUGGUGCUGGUGGUGGUGGCUGUGUUCAUCGUCUGCUGGACUCCCAUUCACAUUUACGUCAUCAUUAAAGCCUUGGUUACAAUCCCAGAAACUACGUUCCAGACUGUUUCUUGGCACUUCUGCAUUGCUCUAGGUUACACAAACAGCUGCCUCAACCCAGUCCUUUAUGCAUUUCUGGAUGAAAACUUCAAACGAUGCUUCAGAGAGUUCUGUAUCCCAACCUCUUCCAACAUUGAGCAACAAAACUCCACUCGAAUUCGUCAGAACACUAGAGACCACCCCUCCACGGCCAAUACAGUGGAUAGAACUAAUCAUCAGAUCAGAGAUCCAAUAUCAAACCUUCCCAGGGUGUCUGUAUUCUGACAACUGUCCACUGAGGCAAUUUCCAUACAGCGCAAAGUGGAGUGGCGAUUUGGCAGUUAUCAAGGGACCUCCAGCCAAGUUUGUUGCUGACCAACUUGCCGGGUCGUCUUGAAAAGGGGGCUUACAGGUGUUCCAAGCCCGUGUUUUAUCCUGAAGUAUCCCUCAACACAGAAAAACGACCUCAUAACACAAAAUACACCAGCUUAAAAAUAGCCUUUGAAUUAUUUUUCACAUUAAUCAAAACUUUACAGAGGAGAUAAACACUGAUUUUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUGCCAUUCAUUCAACCGUUUGCACAGAGAGAAAGAAGACAGAAAUCUGACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-304.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -328.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((.((.((((((.....................(((..(((....)))..)))..((((((((.((((....(((((.((((((.......((((((((((((.....(((....)))...))...((((((((((....))))))))))..))))))).)))....)))))).)))))..((((((............(((((((((...(((..........))).....(((((.(......).))))).........(((((((.(((.((..((....))..))))).)))))))....)))))))))))))))...............))))(((((....(((.(((......))).))).......))))))))))))).....(((..(((((((.(.((((((..((((.((..((((((..(((..((.(((.......))).))..)))..))))))....))(((...(((((((....)))))))..)))....))))..)))))).).))))))).)))((((((((.......)))))))))))))).)).))))))((((...))))...((.(((.((((..(((.((..(((((..(((((((.....(((((((...(((....(((((......((((...(((..(((............))).))).))))......)))))....)))..))))))).((((...))))...((((((((((.(((((.(((..(.(((............))).)..))).)))))..............(((((((..(((((.((((((((((.((.....((((((((((.........(((((.((((.((((.................)))).))))...)))))...)))))))))).((......)).......))...)))))).(((((.((((((((...((((((........))...))))..)))).)))).))))))))).))))).......((((((...((....)))))))))))))))...)))))))))).........................................(((.......)))...((((......))))...)))))))..))))).....((((((((....(((......)))....)))))))).......(((.((((..(((.(..(........)..))))..)))).))))).)))..)))).))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........((((((.((.(((((({....................{((..(((....)))..))|((((((((((,{{,{,,,,(((((.((((((.......((((((((((((.....(((....)))...))...((((((((((....))))))))))..))))))).)))....)))))).)))))..{{{{{{{{{,.,...,,.|{{{(((((.{{{,...{{{....,|||....,(((((.(......,.)))))}},......{((((((.(((.{{..({,...,},.}}))).)))))))...{|||||,||||,,||,...,}}}}...}}}})),}|(({{....(((.(((......))).)))...,.,,},}})}||,{||||{...{{{..{((((((,({(,((({..||||.|{..((((((..(((..((.(((,......))).))..)))..))))))....|,(((...(((((((....)))))))..)))....})))..))}))))).})))))),))).,,.}))),..)))))))))))))))))).)).)))))){{{{..,}}}}...{{.{{{.{{({..(((.((..{{(((..((((({{.....(((((((...(((....(((((......((((...{((..,,(,,...,},....},..})).))))......)))))....)))..))))))).{((,...,}}}...((((((((((.(((((.(({....,,,..,.........,})|}..}}}.,}}}}..,,,|....,,..|||||,{..{((((.((((((((((.(({....((((((((((.........(((((.((((.((((.................)))).))))...)))))...)))))))))).}|}.....,,.....,.},...)))))).(((((.((((((((...((({((,,......}}..,}))},,)))).)))).))))))))).))))|{{{,.,.((((((...((....)))))))),),))))...))))))))))..{,......},.............................(((.......)))...((({......)))}...}))))))..}}))}..}},{(((((((....((,......},},,,.}}}}}}},..,,..,{{{.((((..(({.{..(........)..})))..)))),}}})},))).,)})).))}.))
Back