Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAIP2_0001000
Sequence Length
317 nt
GC Content
0.3880
GAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUUGUGAUCCACGCGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCCUCCUGCCCUUGGAGUACAUUUUUAAUUGAUAGGAAAAUAGUUAAAGUUAUUAAGUGUAGGAAAAUAAACGCUAUAGAAAAGAAAUAGUUAAUAGAACAUUUGAAAAAGCAUAAGAAAAGUAAACAUGAAAUUAUUAUGAAAGACAUAAAACGAAACAUCAGUUAUCAAAAAUGUUAAUUCCUGGCUGGGCACAGUGUCUCACACCUGUAAUUCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-101.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -107.47
Frequency: 0.0001
Diversity: 51.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.(((((....))..))).)).)))..(..((((((((((((((((((((((((((((((..((((.(((((..(((.(((...((((((((((((((((((((...............(((.((((((((............(((((.........))))).......))))))))...)))..............(((((.....)))))..................))))))))...)))))))..))))).))).)))..))))).))))..))))))))))))))))))))))))))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.(((((.{({{{....))..}}}.}).)}}..{..((((((((((((((((((((((((((((((..((((.(((((..(((.(((...((((((((((((((((((((.,.....,.,,,....{{,||{(((((..........,}|||||.........|},|||......}},}}},,.....|.........,,...,{{{,.....}||||.....},,,........,)))))))}..,)))))))..))))).))).)))..))))).))))..))))))))))))))))))))))))))))))...)
Back