Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAIP2_0001900
Sequence Length
652 nt
GC Content
0.4433
GAGAAUUGCUUGAGCCUGGGAGGCGGAGGUUGCGGUGAGCUGAGAUCACGCCACUGCACUCGUCUGGGUGAGACCCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAUGCCUGAAACUCACUGUACAGUGAGGAACUCCAGACAUGGAAGAACUUGACAUGGACCUAGAGAAAAAGCAGACACAGAAUAUGGGCUAUCAAGGAGAGAUCCAGAGCUAUAUACAUGAAGAACCUAAGAAGUUAUUAAAAAUCUGUUAGUUUUCACUUUCAAUCCCUGGACUUUUUGAAGUCAGUUUUUAAAAAUUGAAUUUGCUUUUCAUCAUUUCAUCACUUGAUGACUCAGUCUUUCAGACCGUGUUUGGUUUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUUGAGGUGGAGUUUCCCUCUGUUGCCUAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAGUCUCGGCUCACUGUACCCUCUGCCUCCUGGUUUCAAGUGAUUCUCCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGUACCACCAUGCCCAGCUAAAUUUUUUGUUUUUGGGUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUUUCACUCUUUUUGCCCAGGCUGGAGUGCAACGGCGCAAUCUUGGCUCACCACAGCCUCCGCCUCCCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-257.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -268.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 120.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(.....)...)(((((((((((((((((.(((((((((((((..((((..((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))....((((....))))(.(((..((((..(((...((.(((((.(((((((........((((.((((((((...(((((.(.........((((((..((((.(.(((......))).).)))))))))).........)))))))))))))))))).............((((.......)))).....(((((....)))))....((((...)))).))))))).))))).))...)))..))))))).)(((((((((((..((.((.((..(((.((((.((.(((((((((.((.......)))))))))))))...))))...)))..)))).))..)).))))))))).........((((((((......((......))......))))))))..........)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).........))))))))..)))))))..))))..))))))))))))).)))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...,.....}...)(((((((((((((((((.(((((((((((((..((((..((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))).,,{{{((,,,,}|}|{{(((,.((((,,({(...((,(((((,(((({{(,{{,..{,((((.((((((((.,.(((((.(.........((((((..((((.(.(((......})).).)))))))))).........,))))))))))))))))},||||},.....,}}|.,}}}}}})|||{{,..,{,{{...}))))}....{|||,,.}),),)))))}),))))).)),,,)}),.)))}},.,,{((((((((((..((.((.((..(((.((((.((,(((((((((.((.,.....))})))))))))).,,))))...)))..)))).))..))}}}))))))},,.......((((((((......((..,,..}}..,},,))))))))..........)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))),........})))))))..)))))))..))))..))))))))))))).)))))))))))))))))
Back