Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAIP2_0002300
Sequence Length
351 nt
GC Content
0.3960
GUUAAAAACGACAACCAACAUCAGCCAUGAAAGAUCCAAGUCGCAGCAGUACUAGCCCAAGCAUCAUCAAUGAAGAUGUGAUUAUUAACGGUCAUUCUCAUGAAGAUGACAAUCCAUUUGCAGAGUACAUGUGGAUGGAAAAUGAAGAAGAAUUCAACAGACAAAUAGAAGAGGAGUUAUGGGAAGAAGAAUUUAUUGAACGCUGUUUCCAAGAAAUGCUGGAAGAGGAAGAAGAGCAUGAAUGGUUUAUUCCAGCUCGAGAUCUCCCACAAACUAUGGACCAAAUCCAAGACCAGUUUAAUGACCUUGUUAUCAGUGAUGGCUCUUCUCUGGAAGAUCUUGUGGUAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-69.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -78.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 65.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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