Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PAN3_0000200

Sequence Length

2110 nt

GC Content

0.5284

CUCCCCGGGCGGCUCCGGCUCCCGCAGCGGGACAGACCCACCCGCCCAGGCUUUUAUCCGGCACCGGCAGCGUCUUCCUUUCCUCCCCCGUCUAUGGUGGUGGCGGCGGCGGCUCCUCGGGCGGCGGCGGAAGACGAGGCUGCGGCGUUGCCAUGAACAGUGGCGGCGGCCUCCCGCCCCCCUCGGCCGCCGCCUCCCCUUCCUCCUCCUCGCUGGCGGCGGCGGUGGCGGUGGUGGCCCCGCCGGGGGUCGGGGGUGUCCCCGGCGGGGCGGCGGUAGGAGUGAAGCUGAAGUACUGCCGCUACUACGCUAAGGAUAAGACUUGCUUCUACGGGGAGGAGUGUCAGUUCCUGCAUGAGGACCCUGCCGCCGGGGCUGCCCCGGGCCUCGGCCUCCAUAGCAACAGCGUCCCCCUGGCUCUGGCUGGUGCACCCGUGGCCGGCUUUCCGCCGGGAGCCGUCGCGGGCGGGGGAGCUGGGCCGCCCCCCGGGCCCAAGAAGCCGGACCUGGGGGACCCGGGGACCGGAGCCGCAGCCGGCGGAGGAGGCAGUAGCGGGGGACUCGAUGGACCGCGGCUGGCAAUUCCAGGAAUGGAUGGAGGUGCUUUAACUGAUACAAGUCUCACAGAUUCCUAUUUUAGCACCAGCUUUAUUGGAGUCAAUGGAUUUGGAAGCCCUGUAGAAACAAAAUAUCCCCUGAUGCAGAGAAUGACUAAUAGUAGCAGCUCCCCAAGCCUUCUAAAUGACAGUGCCAAGCCAUAUUCAGCCCAUGAUCCUCUAACAUCACCUGCUUCAUCCUUGUUUAAUGACUUUGGUGCCCUCAACAUCUCUCAGAGACGAAAGCCAAGGAAGUAUCGCCUGGGGAUGCUGGAGGAGAGGCUAGUUCCGAUGGGAUCAAAGGCACGAAAAGCAAAGAACCCUAUUGGCUGCCUUGCUGACAGGUGUAAAUCAGGAGUACCCAUCAAUAUGGUUUGGUGGAACAGAGUCACAGAAAACAAUUUACAGACACCAAAUCCUACUGCAAGCGAGUUUAUUCCUAAAGGAGGAUCAACCUCCAGGCUGAGUAACGUGUCCCAGUCAAAUAUGUCUGCCUUCUCUCAAGUUUUCUCUCACCCAUCCAUGGGAAGCCCUGCUACUGCUGGAUUAGCGCCAGGAAUGUCGUUGUCUGCUGGGUCUUCCCCUCUUCAUUCCCCCAAGAUUACUCCACAUACUUCUCCUGCUCCCAGAAGAAGAAGUCACACUCCAAAUCCAGCAAGUUACAUGGUGCCUUCUAGUGCCUCUACAUCUGUUAAUAAUCCUGUUUCUCAGACUCCGUCUUCUGGUCAGGUGAUCCAAAAGGAAACUGUUGGUGGGACGACUUACUUCUAUACAGACACAACUCCAGCACCUUUGACUGGAAUGGUGUUUCCAAACUAUCAUAUUUAUCCUCCAACUGCACCUCACGUUGCUUAUAUGCAACCGAAAGCAAACGCACCUUCCUUCUUCAUGGCUGAUGAACUCCGACAGGAGCUGAUCAACAGACAUUUAAUAACAAUGGCUCAAAUUGAUCAAGCAGAUAUGCCAGCAGUUCCUACAGAGGUUGACAGCUACCAUAGCCUAUUCCCUCUAGAACCACUGCCACCUCCCAACCGGAUACAGAAAUCAAGUAAUUUUGGAUAUAUUACAUCUUGCUACAAAGCUGUAAACAGCAAAGAUGAUCUGCCAUAUUGCCUUCGGAGGAUACAUGGUUUUCGUCUUGUUAACACAAAGUGCAUGGUGUUGGUCGACAUGUGGAAGAAAAUUCAACACUCAAAUAUCGUAACUUUGCGUGAAGUAUUUACCACUAAAGCAUUUGCUGAGCCCUCUCUUGUGUUUGCAUAUGAUUUCCAUGCUGGAGGAGAAACUAUGAUGAGCAGACACUUUAAUGACCCUAAUGCUGAUGCCUACUUCACCAAGAGAAAGUGGGGUCAGCACGAGGGACCAUUGCCCAGGCAGCAUGCUGGAUUAUUGCCAGAAUCUCUUAUUUGGGCAUAUAUUGUCCAACUAAGUUCUGCAUUGCGUACCAUUCAUACAGCAGGUUUGGCAUGUCGAGUUAUGGAUCCAACAAAGAUUCUGAUAACUGGCAAAACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-745.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -784.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 548.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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