Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0003500
Sequence Length
422 nt
GC Content
0.4526
UUCCAGGAAUGGAUGGAGGUGCUUUAACUGAUACAAGUCUCACAGAUUCCUAUUUUAGCACCAGCUUUAUUGGAGUCAAUGGAUUUGGAAGCCCUGUAGAAACAAAAUAUCCCCUGAUGCAGAGAAUGACUAAUAGUAGCAGCUCCCCAAGCCUUCUAAAUGACAGUGCCAAGCCAUAUUCAGCCCAUGAUCCUCUAACAUCACCUGCUUCAUCCUUGUUUAAUGACUUUGGUGCCCUCAACAUCUCUCAGAGACGAAAGCCAAGGAAGUAUCGCCUGGGGAUGCUGGAGGAGAGGCUAGUUCCGAUGGGAUCAAAGGCACGAAAAGCAAAGAACCCUAUUGGCUGCCUUGCUGACAGGUGUAAAUCAGGAGUACCCAUCAAUAUGGUUUGGUGGAACAGAGUCACAGAAAACAAUUUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -114.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 60.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((..(((..((((.((((...((((...((((((.((..((((((......(((....))).....))))))..))))))))......(((((...................)))))...........)))))))).)))))))..))).............(((((((((((((.((((.....(((((((.((((.(((((..(.((((((.....((.((((((...............)))))).)).....)))))).)....))..))))))).)))))))..))))......((((((.((....((((....(((((.(...((....))...).))))).....)))).......))...)))))))))))))))))))))))(.......................)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((..(((..((((.((((...{(({...((((((.((..((((((......(((....)))..,..))))))..))))))))......(((((...................))))).}......,..}))))))).)))))))..))),{.....},....(((((((((((((.((((.....(((((((.((((.(({((..(.((((((,{,..{{.((((((,,.......,.....,))))).)}.,}}.)))))).)....))..))})))).)))))))..))))......((((((.((....((((....(((((.{...((....)).,.).))))).....)))).......))...)))))))))))))))))))))))(.,,{{............,,,...)
Back